63 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_8068 on replicon NC_011887
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011887  Mnod_8068  hypothetical protein  100 
 
 		 341 aa  678    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0531  hypothetical protein  54.33 
 
 		 345 aa  348  1e-94  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1191  hypothetical protein  57 
 
 		 350 aa  346  3e-94  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.161242  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6752  hypothetical protein  52.21 
 
 		 337 aa  336  3.9999999999999995e-91  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00609082 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3413  hypothetical protein  47.11 
 
 		 328 aa  296  3e-79  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.591496  normal  0.708141 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2404  hypothetical protein  44.55 
 
 		 329 aa  265  8e-70  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.147622  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5144  hypothetical protein  40.3 
 
 		 331 aa  253  3e-66  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.62916  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3122  hypothetical protein  36.21 
 
 		 326 aa  175  9.999999999999999e-43  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2795  hypothetical protein  35.15 
 
 		 327 aa  165  8e-40  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2203  hypothetical protein  31.42 
 
 		 349 aa  127  3e-28  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2975  hypothetical protein  28.96 
 
 		 331 aa  121  9.999999999999999e-27  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3305  MetA-pathway phenol degradation-like protein  30.77 
 
 		 299 aa  114  3e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.853243 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0598  hypothetical protein  29.82 
 
 		 364 aa  113  4.0000000000000004e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.161242  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2982  hypothetical protein  32.24 
 
 		 299 aa  109  7.000000000000001e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.0000000220614  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2732  hypothetical protein  29.64 
 
 		 301 aa  109  7.000000000000001e-23  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.206778  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1833  putative signal peptide protein  29.78 
 
 		 297 aa  94  4e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.714906  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3157  meta-pathway phenol degradation-like protein  31.01 
 
 		 295 aa  91.3  2e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4501  MetA-pathway phenol degradation-like protein  30.06 
 
 		 295 aa  88.6  2e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08780  hypothetical protein  26.86 
 
 		 268 aa  87  4e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.299934  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3482  meta-pathway phenol degradation-like protein  29.56 
 
 		 318 aa  86.3  6e-16  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0883  hypothetical protein  27.79 
 
 		 309 aa  84  0.000000000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.00462477  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1676  hypothetical protein  28.16 
 
 		 328 aa  82.8  0.000000000000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.275603  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2107  putative signal peptide protein  27.61 
 
 		 309 aa  82.4  0.00000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6101  putative lipoprotein  25.66 
 
 		 316 aa  80.5  0.00000000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.540128  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0092  hypothetical protein  27.78 
 
 		 334 aa  78.6  0.0000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.672977  normal  0.778879 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70300  putative enzyme  25.36 
 
 		 316 aa  77.4  0.0000000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5460  hypothetical protein  28.08 
 
 		 296 aa  77.4  0.0000000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6970  hypothetical protein  28.38 
 
 		 340 aa  76.6  0.0000000000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000157214  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1588  hypothetical protein  35.66 
 
 		 320 aa  75.5  0.000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.232894  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5224  hypothetical protein  26.46 
 
 		 322 aa  75.9  0.000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.347235 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4536  phenol degradation protein  26.81 
 
 		 318 aa  74.7  0.000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.375555  normal  0.225823 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30840  hypothetical protein  23.62 
 
 		 294 aa  74.3  0.000000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.856206  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2955  meta-pathway phenol degradation-like protein  27.56 
 
 		 300 aa  73.6  0.000000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.148613  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0632  meta-pathway phenol degradation-like protein  27.56 
 
 		 316 aa  72.8  0.000000000008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3846  hypothetical protein  26.63 
 
 		 334 aa  72  0.00000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3168  hypothetical protein  25.52 
 
 		 315 aa  69.3  0.00000000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2127  phenol degradation-like protein  23.75 
 
 		 307 aa  68.6  0.0000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32260  signal peptide protein  24.92 
 
 		 303 aa  68.2  0.0000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03076  putative signal peptide protein  25.16 
 
 		 311 aa  65.1  0.000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0368  hypothetical protein  27.07 
 
 		 295 aa  65.1  0.000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1838  phenol metabolism protein  24.84 
 
 		 310 aa  63.2  0.000000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.394031  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1377  MetA-pathway phenol degradation-like protein  23.75 
 
 		 324 aa  60.8  0.00000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.351343  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0190  hypothetical protein  25.5 
 
 		 307 aa  60.1  0.00000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4488  protein involved in meta-pathway of phenol degradation  25.08 
 
 		 302 aa  60.5  0.00000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.796292  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2845  phenol degradation-like protein  22.49 
 
 		 306 aa  58.5  0.0000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0355  hypothetical protein  27.1 
 
 		 295 aa  58.2  0.0000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4527  hypothetical protein  25.48 
 
 		 310 aa  57.4  0.0000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0341  hypothetical protein  26.69 
 
 		 295 aa  57  0.0000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.225999  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2388  hypothetical protein  29.2 
 
 		 310 aa  51.6  0.00002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.806824 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1148  meta-pathway phenol degradation-like protein  25.13 
 
 		 324 aa  51.6  0.00002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4267  hypothetical protein  24.48 
 
 		 297 aa  51.6  0.00002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1376  meta-pathway phenol degradation protein  22.15 
 
 		 309 aa  50.1  0.00005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.768311 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3839  regulation of phenolics degradation protein  24.62 
 
 		 298 aa  50.1  0.00006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1047  MetA-pathway of phenol degradation-like protein  25.68 
 
 		 307 aa  48.9  0.0001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.379936 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2098  hypothetical protein  23.81 
 
 		 269 aa  48.9  0.0001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.591796  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0164  hypothetical protein  25.82 
 
 		 306 aa  46.6  0.0006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.433262  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6407  hypothetical protein  26.38 
 
 		 312 aa  45.4  0.001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.579544 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3195  hypothetical protein  24.68 
 
 		 313 aa  45.4  0.001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6917  hypothetical protein  26.67 
 
 		 312 aa  44.7  0.002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4890  hypothetical protein  26.1 
 
 		 312 aa  44.7  0.003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3274  hypothetical protein  26.1 
 
 		 312 aa  44.7  0.003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0193485 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1931  hypothetical protein  26.55 
 
 		 327 aa  44.3  0.003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.903227  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2099  Protein involved in meta-pathway of phenol degradation  26.25 
 
 		 319 aa  44.3  0.003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.119201  normal  0.245606 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>