77 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpop_1047 on replicon NC_010725
Organism: Methylobacterium populi BJ001



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010725  Mpop_1047  MetA-pathway of phenol degradation-like protein  100 
 
 		 307 aa  615  1e-175  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.379936 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1377  MetA-pathway phenol degradation-like protein  35.64 
 
 		 324 aa  169  4e-41  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.351343  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0632  meta-pathway phenol degradation-like protein  32.17 
 
 		 316 aa  142  6e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2982  hypothetical protein  29.15 
 
 		 299 aa  101  1e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.0000000220614  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2955  meta-pathway phenol degradation-like protein  24.62 
 
 		 300 aa  99  9e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.148613  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3305  MetA-pathway phenol degradation-like protein  26.96 
 
 		 299 aa  92  1e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.853243 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2732  hypothetical protein  24.82 
 
 		 301 aa  91.3  2e-17  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.206778  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3157  meta-pathway phenol degradation-like protein  25.85 
 
 		 295 aa  88.6  1e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4501  MetA-pathway phenol degradation-like protein  26.53 
 
 		 295 aa  87.4  2e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0164  hypothetical protein  26.83 
 
 		 306 aa  85.1  0.000000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.433262  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3482  meta-pathway phenol degradation-like protein  25.17 
 
 		 318 aa  84  0.000000000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03076  putative signal peptide protein  28.33 
 
 		 311 aa  82  0.00000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1931  hypothetical protein  24.83 
 
 		 327 aa  82  0.00000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.903227  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4832  hypothetical protein  27.52 
 
 		 304 aa  81.3  0.00000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.922561 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6917  hypothetical protein  28.22 
 
 		 312 aa  80.1  0.00000000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6407  hypothetical protein  27.62 
 
 		 312 aa  79.7  0.00000000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.579544 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6119  hypothetical protein  27.62 
 
 		 312 aa  79.7  0.00000000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30840  hypothetical protein  25.81 
 
 		 294 aa  79.7  0.00000000000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.856206  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4890  hypothetical protein  27.87 
 
 		 312 aa  79  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3168  hypothetical protein  21.61 
 
 		 315 aa  78.2  0.0000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3274  hypothetical protein  27.87 
 
 		 312 aa  79  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0193485 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4527  hypothetical protein  27.48 
 
 		 310 aa  77.4  0.0000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3195  hypothetical protein  24.25 
 
 		 313 aa  77.4  0.0000000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4267  hypothetical protein  26.67 
 
 		 297 aa  76.3  0.0000000000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70300  putative enzyme  22.59 
 
 		 316 aa  74.3  0.000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1833  putative signal peptide protein  24.74 
 
 		 297 aa  73.2  0.000000000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.714906  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0368  hypothetical protein  24.36 
 
 		 295 aa  69.7  0.00000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1838  phenol metabolism protein  24.64 
 
 		 310 aa  69.7  0.00000000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.394031  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0190  hypothetical protein  25.57 
 
 		 307 aa  69.3  0.00000000007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0355  hypothetical protein  25.51 
 
 		 295 aa  69.3  0.00000000007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08780  hypothetical protein  22.18 
 
 		 268 aa  68.6  0.0000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.299934  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2045  hypothetical protein  29.03 
 
 		 331 aa  68.9  0.0000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0341  hypothetical protein  26.32 
 
 		 295 aa  68.9  0.0000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.225999  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6101  putative lipoprotein  22.59 
 
 		 316 aa  67.8  0.0000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.540128  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4488  protein involved in meta-pathway of phenol degradation  23.22 
 
 		 302 aa  67  0.0000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.796292  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2388  hypothetical protein  24.62 
 
 		 310 aa  65.5  0.000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.806824 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1588  hypothetical protein  23.41 
 
 		 320 aa  65.5  0.000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.232894  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1956  hypothetical protein  27.14 
 
 		 322 aa  64.7  0.000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.235366  hitchhiker  0.00028826 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4179  hypothetical protein  24.5 
 
 		 278 aa  63.9  0.000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32260  signal peptide protein  23.29 
 
 		 303 aa  63.5  0.000000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2107  putative signal peptide protein  24.68 
 
 		 309 aa  63.5  0.000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2677  hypothetical protein  28.83 
 
 		 317 aa  62.4  0.000000009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.356132  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2810  hypothetical protein  27.88 
 
 		 321 aa  61.2  0.00000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2195  hypothetical protein  29.82 
 
 		 334 aa  61.2  0.00000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1206  hypothetical protein  26.37 
 
 		 278 aa  61.6  0.00000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.321887  normal  0.463504 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1191  hypothetical protein  25.41 
 
 		 350 aa  60.1  0.00000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.161242  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2498  hypothetical protein  28.39 
 
 		 322 aa  60.1  0.00000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.250275  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0883  hypothetical protein  24.77 
 
 		 309 aa  58.9  0.0000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.00462477  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5693  hypothetical protein  26.13 
 
 		 309 aa  58.5  0.0000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.721893  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5044  hypothetical protein  27.15 
 
 		 297 aa  57.8  0.0000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.205192  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1417  hypothetical protein  26.1 
 
 		 305 aa  57  0.0000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.344999 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1256  hypothetical protein  26.1 
 
 		 305 aa  56.6  0.0000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.168978 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5460  hypothetical protein  24.15 
 
 		 296 aa  56.2  0.0000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2095  hypothetical protein  26.55 
 
 		 303 aa  55.5  0.000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0128666  normal  0.0122297 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5520  hypothetical protein  27.3 
 
 		 284 aa  55.1  0.000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.444925  normal  0.155172 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1462  hypothetical protein  25.52 
 
 		 290 aa  54.7  0.000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5144  hypothetical protein  24.04 
 
 		 331 aa  53.9  0.000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.62916  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2218  hypothetical protein  25.57 
 
 		 294 aa  53.5  0.000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.062473 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2261  hypothetical protein  27.33 
 
 		 295 aa  52  0.00001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.106617 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2536  hypothetical protein  27.33 
 
 		 295 aa  52  0.00001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.70197 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8068  hypothetical protein  27.36 
 
 		 341 aa  51.2  0.00002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1569  hypothetical protein  26.69 
 
 		 326 aa  51.6  0.00002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0945587  normal  0.178884 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4258  hypothetical protein  29.15 
 
 		 313 aa  50.4  0.00003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.930732  normal  0.515923 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2371  hypothetical protein  25.52 
 
 		 296 aa  50.8  0.00003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.193146  normal  0.0336172 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3890  hypothetical protein  29.15 
 
 		 330 aa  50.8  0.00003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.526711  normal  0.295416 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4359  hypothetical protein  28.96 
 
 		 313 aa  50.4  0.00004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.100275  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2629  hypothetical protein  27.3 
 
 		 270 aa  50.4  0.00004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.712331  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2763  hypothetical protein  21.46 
 
 		 301 aa  48.5  0.0001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_32640  hypothetical protein  22.22 
 
 		 303 aa  46.2  0.0007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00101125  hitchhiker  0.00152263 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2795  hypothetical protein  22.07 
 
 		 327 aa  45.8  0.0009  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6752  hypothetical protein  23.85 
 
 		 337 aa  45.4  0.001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00609082 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2845  phenol degradation-like protein  21.35 
 
 		 306 aa  45.1  0.001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6970  hypothetical protein  23.36 
 
 		 340 aa  45.1  0.002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000157214  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0531  hypothetical protein  25.09 
 
 		 345 aa  43.9  0.003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4536  phenol degradation protein  24.34 
 
 		 318 aa  44.3  0.003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.375555  normal  0.225823 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2732  putative signal peptide  24.03 
 
 		 315 aa  42.7  0.008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.235663  normal  0.493951 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5600  hypothetical protein  22.15 
 
 		 383 aa  42.4  0.01  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  unclonable  0.00091534  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>