27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_2498 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010511  M446_2498  hypothetical protein  100 
 
 
322 aa  626  1e-178  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.250275  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2810  hypothetical protein  88.96 
 
 
321 aa  529  1e-149  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2045  hypothetical protein  83.08 
 
 
331 aa  500  1e-140  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1569  hypothetical protein  67.96 
 
 
326 aa  402  1e-111  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0945587  normal  0.178884 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4359  hypothetical protein  64.55 
 
 
313 aa  332  4e-90  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.100275  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4258  hypothetical protein  64.85 
 
 
313 aa  332  5e-90  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.930732  normal  0.515923 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3890  hypothetical protein  64.85 
 
 
330 aa  332  5e-90  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.526711  normal  0.295416 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2195  hypothetical protein  61.02 
 
 
334 aa  314  9.999999999999999e-85  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5693  hypothetical protein  46.37 
 
 
309 aa  228  7e-59  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.721893  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4179  hypothetical protein  38.87 
 
 
278 aa  153  4e-36  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5520  hypothetical protein  35.58 
 
 
284 aa  150  4e-35  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.444925  normal  0.155172 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2261  hypothetical protein  33.03 
 
 
295 aa  130  3e-29  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.106617 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2218  hypothetical protein  32.18 
 
 
294 aa  130  3e-29  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.062473 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2536  hypothetical protein  33.03 
 
 
295 aa  130  3e-29  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.70197 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5044  hypothetical protein  35.45 
 
 
297 aa  128  1.0000000000000001e-28  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.205192  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2677  hypothetical protein  35.26 
 
 
317 aa  125  7e-28  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.356132  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1462  hypothetical protein  33.55 
 
 
290 aa  116  5e-25  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2095  hypothetical protein  33.23 
 
 
303 aa  112  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0128666  normal  0.0122297 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2371  hypothetical protein  32.81 
 
 
296 aa  109  7.000000000000001e-23  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.193146  normal  0.0336172 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1206  hypothetical protein  34.36 
 
 
278 aa  102  7e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.321887  normal  0.463504 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1417  hypothetical protein  33.33 
 
 
305 aa  97.1  4e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.344999 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1256  hypothetical protein  32.98 
 
 
305 aa  95.9  8e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.168978 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2629  hypothetical protein  29.49 
 
 
270 aa  76.6  0.0000000000005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.712331  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0632  meta-pathway phenol degradation-like protein  28.46 
 
 
316 aa  67  0.0000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1047  MetA-pathway of phenol degradation-like protein  26.81 
 
 
307 aa  53.9  0.000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.379936 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1191  hypothetical protein  27.8 
 
 
350 aa  52.8  0.000009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.161242  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1377  MetA-pathway phenol degradation-like protein  26.88 
 
 
324 aa  43.1  0.006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.351343  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>