29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpal_2677 on replicon NC_011004
Organism: Rhodopseudomonas palustris TIE-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011004  Rpal_2677  hypothetical protein  100 
 
 		 317 aa  628  1e-179  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.356132  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4179  hypothetical protein  43.49 
 
 		 278 aa  191  1e-47  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5520  hypothetical protein  37.76 
 
 		 284 aa  166  4e-40  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.444925  normal  0.155172 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2095  hypothetical protein  37.09 
 
 		 303 aa  154  1e-36  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0128666  normal  0.0122297 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2536  hypothetical protein  35.52 
 
 		 295 aa  154  2.9999999999999998e-36  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.70197 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2261  hypothetical protein  35.52 
 
 		 295 aa  154  2.9999999999999998e-36  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.106617 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2371  hypothetical protein  36.42 
 
 		 296 aa  152  8.999999999999999e-36  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.193146  normal  0.0336172 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2218  hypothetical protein  34.95 
 
 		 294 aa  151  1e-35  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.062473 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5044  hypothetical protein  33.94 
 
 		 297 aa  140  3.9999999999999997e-32  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.205192  normal  1 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5693  hypothetical protein  36.09 
 
 		 309 aa  140  3.9999999999999997e-32  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.721893  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1462  hypothetical protein  36.05 
 
 		 290 aa  135  9.999999999999999e-31  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2629  hypothetical protein  33.72 
 
 		 270 aa  127  3e-28  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.712331  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1256  hypothetical protein  30.69 
 
 		 305 aa  124  1e-27  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.168978 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1417  hypothetical protein  30.69 
 
 		 305 aa  124  2e-27  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.344999 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2810  hypothetical protein  33.76 
 
 		 321 aa  123  4e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1206  hypothetical protein  31.79 
 
 		 278 aa  122  7e-27  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.321887  normal  0.463504 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2498  hypothetical protein  34.68 
 
 		 322 aa  122  9.999999999999999e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.250275  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4359  hypothetical protein  34.75 
 
 		 313 aa  119  6e-26  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.100275  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2045  hypothetical protein  32.91 
 
 		 331 aa  119  7e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3890  hypothetical protein  34.16 
 
 		 330 aa  115  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.526711  normal  0.295416 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4258  hypothetical protein  34.16 
 
 		 313 aa  115  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.930732  normal  0.515923 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2195  hypothetical protein  33.23 
 
 		 334 aa  112  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1569  hypothetical protein  33.02 
 
 		 326 aa  107  3e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0945587  normal  0.178884 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0632  meta-pathway phenol degradation-like protein  27.24 
 
 		 316 aa  57.8  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1047  MetA-pathway of phenol degradation-like protein  27.96 
 
 		 307 aa  56.2  0.0000008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.379936 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2732  hypothetical protein  24.04 
 
 		 301 aa  45.8  0.0009  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.206778  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1191  hypothetical protein  25.93 
 
 		 350 aa  45.8  0.001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.161242  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1377  MetA-pathway phenol degradation-like protein  25.09 
 
 		 324 aa  44.3  0.003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.351343  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2955  meta-pathway phenol degradation-like protein  26.32 
 
 		 300 aa  43.1  0.007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.148613  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>