67 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_1191 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010511  M446_1191  hypothetical protein  100 
 
 		 350 aa  699    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.161242  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6752  hypothetical protein  62.54 
 
 		 337 aa  447  1.0000000000000001e-124  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00609082 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0531  hypothetical protein  61.38 
 
 		 345 aa  433  1e-120  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8068  hypothetical protein  56.33 
 
 		 341 aa  350  2e-95  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2404  hypothetical protein  54.14 
 
 		 329 aa  346  4e-94  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.147622  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3413  hypothetical protein  50 
 
 		 328 aa  296  3e-79  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.591496  normal  0.708141 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5144  hypothetical protein  43.17 
 
 		 331 aa  270  2.9999999999999997e-71  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.62916  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3122  hypothetical protein  40.94 
 
 		 326 aa  217  2e-55  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2795  hypothetical protein  35.91 
 
 		 327 aa  189  5.999999999999999e-47  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2203  hypothetical protein  31.92 
 
 		 349 aa  158  1e-37  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0598  hypothetical protein  31.8 
 
 		 364 aa  152  1e-35  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.161242  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2975  hypothetical protein  30.75 
 
 		 331 aa  142  9.999999999999999e-33  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2732  hypothetical protein  31.54 
 
 		 301 aa  119  9.999999999999999e-26  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.206778  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08780  hypothetical protein  30.07 
 
 		 268 aa  115  2.0000000000000002e-24  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.299934  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3305  MetA-pathway phenol degradation-like protein  29.94 
 
 		 299 aa  111  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.853243 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5460  hypothetical protein  29.71 
 
 		 296 aa  99  1e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30840  hypothetical protein  27.74 
 
 		 294 aa  99  1e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.856206  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2982  hypothetical protein  29.81 
 
 		 299 aa  97.8  3e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.0000000220614  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1833  putative signal peptide protein  28.62 
 
 		 297 aa  89  1e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.714906  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3157  meta-pathway phenol degradation-like protein  29.93 
 
 		 295 aa  87.4  3e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1588  hypothetical protein  29.57 
 
 		 320 aa  87.4  3e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.232894  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3482  meta-pathway phenol degradation-like protein  27.44 
 
 		 318 aa  85.5  0.000000000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6101  putative lipoprotein  26.71 
 
 		 316 aa  84  0.000000000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.540128  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70300  putative enzyme  27.31 
 
 		 316 aa  84  0.000000000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3168  hypothetical protein  27.66 
 
 		 315 aa  83.6  0.000000000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4501  MetA-pathway phenol degradation-like protein  29.61 
 
 		 295 aa  82.4  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1676  hypothetical protein  29.5 
 
 		 328 aa  82.4  0.00000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.275603  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32260  signal peptide protein  26.85 
 
 		 303 aa  82.4  0.00000000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2955  meta-pathway phenol degradation-like protein  26.13 
 
 		 300 aa  82.4  0.00000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.148613  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0883  hypothetical protein  26.2 
 
 		 309 aa  80.1  0.00000000000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.00462477  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1838  phenol metabolism protein  25.99 
 
 		 310 aa  79  0.0000000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.394031  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6970  hypothetical protein  26.33 
 
 		 340 aa  68.6  0.0000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000157214  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2107  putative signal peptide protein  26.01 
 
 		 309 aa  68.6  0.0000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4527  hypothetical protein  28.91 
 
 		 310 aa  67  0.0000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03076  putative signal peptide protein  29.87 
 
 		 311 aa  66.2  0.0000000008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0190  hypothetical protein  27.4 
 
 		 307 aa  64.7  0.000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0355  hypothetical protein  25.4 
 
 		 295 aa  64.3  0.000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6407  hypothetical protein  27.4 
 
 		 312 aa  63.9  0.000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.579544 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4536  phenol degradation protein  31.64 
 
 		 318 aa  63.5  0.000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.375555  normal  0.225823 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3846  hypothetical protein  24.92 
 
 		 334 aa  62  0.00000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0092  hypothetical protein  25.45 
 
 		 334 aa  61.6  0.00000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.672977  normal  0.778879 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6119  hypothetical protein  27.05 
 
 		 312 aa  60.8  0.00000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0368  hypothetical protein  25.48 
 
 		 295 aa  60.8  0.00000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4488  protein involved in meta-pathway of phenol degradation  31.37 
 
 		 302 aa  60.5  0.00000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.796292  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0341  hypothetical protein  24.24 
 
 		 295 aa  59.7  0.00000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.225999  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0632  meta-pathway phenol degradation-like protein  25.09 
 
 		 316 aa  58.9  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5224  hypothetical protein  29.35 
 
 		 322 aa  58.9  0.0000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.347235 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4359  hypothetical protein  30.77 
 
 		 313 aa  57.4  0.0000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.100275  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3890  hypothetical protein  30.77 
 
 		 330 aa  57  0.0000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.526711  normal  0.295416 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4258  hypothetical protein  30.77 
 
 		 313 aa  57  0.0000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.930732  normal  0.515923 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2388  hypothetical protein  32.74 
 
 		 310 aa  56.6  0.0000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.806824 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4267  hypothetical protein  28.38 
 
 		 297 aa  56.6  0.0000007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3195  hypothetical protein  29.48 
 
 		 313 aa  55.8  0.000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3274  hypothetical protein  26.55 
 
 		 312 aa  55.1  0.000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0193485 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4890  hypothetical protein  26.55 
 
 		 312 aa  55.1  0.000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1047  MetA-pathway of phenol degradation-like protein  25.55 
 
 		 307 aa  55.1  0.000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.379936 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6917  hypothetical protein  27.95 
 
 		 312 aa  54.3  0.000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1377  MetA-pathway phenol degradation-like protein  25.16 
 
 		 324 aa  53.9  0.000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.351343  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0164  hypothetical protein  26.97 
 
 		 306 aa  53.1  0.000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.433262  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1931  hypothetical protein  28.32 
 
 		 327 aa  51.2  0.00002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.903227  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4179  hypothetical protein  25.61 
 
 		 278 aa  47.8  0.0003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2127  phenol degradation-like protein  23.63 
 
 		 307 aa  47.8  0.0003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2677  hypothetical protein  26.3 
 
 		 317 aa  46.2  0.0008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.356132  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2845  phenol degradation-like protein  23.39 
 
 		 306 aa  45.8  0.001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1256  hypothetical protein  28.36 
 
 		 305 aa  43.1  0.006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.168978 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1417  hypothetical protein  27.55 
 
 		 305 aa  43.1  0.007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.344999 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5693  hypothetical protein  26.26 
 
 		 309 aa  42.7  0.009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.721893  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>