27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mchl_5693 on replicon NC_011758
Organism: Methylobacterium chloromethanicum CM4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011758  Mchl_5693  hypothetical protein  100 
 
 		 309 aa  610  1e-173  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.721893  normal  1 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5520  hypothetical protein  49.48 
 
 		 284 aa  260  2e-68  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.444925  normal  0.155172 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2195  hypothetical protein  49.06 
 
 		 334 aa  257  2e-67  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1569  hypothetical protein  48.8 
 
 		 326 aa  249  5e-65  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0945587  normal  0.178884 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4258  hypothetical protein  49.07 
 
 		 313 aa  238  1e-61  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.930732  normal  0.515923 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4359  hypothetical protein  49.69 
 
 		 313 aa  236  2e-61  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.100275  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3890  hypothetical protein  49.38 
 
 		 330 aa  237  2e-61  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.526711  normal  0.295416 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2045  hypothetical protein  45.03 
 
 		 331 aa  220  1.9999999999999999e-56  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2498  hypothetical protein  46.5 
 
 		 322 aa  219  3.9999999999999997e-56  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.250275  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2810  hypothetical protein  44.61 
 
 		 321 aa  215  7e-55  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4179  hypothetical protein  47.19 
 
 		 278 aa  201  9.999999999999999e-51  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2218  hypothetical protein  42.37 
 
 		 294 aa  187  2e-46  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.062473 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5044  hypothetical protein  45.8 
 
 		 297 aa  186  6e-46  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.205192  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2536  hypothetical protein  42.57 
 
 		 295 aa  182  6e-45  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.70197 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2261  hypothetical protein  42.57 
 
 		 295 aa  182  7e-45  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.106617 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2095  hypothetical protein  40.07 
 
 		 303 aa  171  1e-41  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0128666  normal  0.0122297 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2371  hypothetical protein  39.33 
 
 		 296 aa  165  6.9999999999999995e-40  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.193146  normal  0.0336172 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1256  hypothetical protein  37.86 
 
 		 305 aa  156  4e-37  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.168978 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1417  hypothetical protein  37.5 
 
 		 305 aa  155  9e-37  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.344999 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1206  hypothetical protein  37.97 
 
 		 278 aa  153  4e-36  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.321887  normal  0.463504 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1462  hypothetical protein  36.59 
 
 		 290 aa  145  1e-33  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2677  hypothetical protein  36.09 
 
 		 317 aa  140  3e-32  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.356132  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2629  hypothetical protein  33.87 
 
 		 270 aa  114  2.0000000000000002e-24  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.712331  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0632  meta-pathway phenol degradation-like protein  25.62 
 
 		 316 aa  59.3  0.00000007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1047  MetA-pathway of phenol degradation-like protein  25.51 
 
 		 307 aa  58.2  0.0000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.379936 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1377  MetA-pathway phenol degradation-like protein  25.4 
 
 		 324 aa  55.8  0.000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.351343  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1191  hypothetical protein  25.07 
 
 		 350 aa  42.7  0.007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.161242  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>