25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpop_2218 on replicon NC_010725
Organism: Methylobacterium populi BJ001



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010725  Mpop_2218  hypothetical protein  100 
 
 
294 aa  592  1e-168  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.062473 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2261  hypothetical protein  92.54 
 
 
295 aa  557  1e-158  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.106617 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2536  hypothetical protein  92.54 
 
 
295 aa  556  1e-157  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.70197 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5044  hypothetical protein  68.46 
 
 
297 aa  366  1e-100  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.205192  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2095  hypothetical protein  58.74 
 
 
303 aa  321  9.999999999999999e-87  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0128666  normal  0.0122297 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2371  hypothetical protein  56.8 
 
 
296 aa  312  4.999999999999999e-84  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.193146  normal  0.0336172 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1206  hypothetical protein  51.12 
 
 
278 aa  266  4e-70  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.321887  normal  0.463504 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5520  hypothetical protein  46.37 
 
 
284 aa  265  8e-70  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.444925  normal  0.155172 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1256  hypothetical protein  51.72 
 
 
305 aa  262  4.999999999999999e-69  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.168978 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1417  hypothetical protein  51.34 
 
 
305 aa  261  8.999999999999999e-69  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.344999 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4179  hypothetical protein  45.71 
 
 
278 aa  226  3e-58  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1462  hypothetical protein  40.86 
 
 
290 aa  184  2.0000000000000003e-45  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5693  hypothetical protein  42.4 
 
 
309 aa  184  2.0000000000000003e-45  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.721893  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2677  hypothetical protein  35.42 
 
 
317 aa  151  1e-35  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.356132  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2195  hypothetical protein  35.13 
 
 
334 aa  142  7e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2629  hypothetical protein  34.01 
 
 
270 aa  137  2e-31  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.712331  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1569  hypothetical protein  33.56 
 
 
326 aa  137  3.0000000000000003e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0945587  normal  0.178884 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2810  hypothetical protein  32.58 
 
 
321 aa  135  6.0000000000000005e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4359  hypothetical protein  33.9 
 
 
313 aa  133  3.9999999999999996e-30  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.100275  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3890  hypothetical protein  33.9 
 
 
330 aa  132  5e-30  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.526711  normal  0.295416 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4258  hypothetical protein  33.9 
 
 
313 aa  132  5e-30  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.930732  normal  0.515923 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2498  hypothetical protein  32.57 
 
 
322 aa  127  3e-28  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.250275  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2045  hypothetical protein  29.94 
 
 
331 aa  121  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0632  meta-pathway phenol degradation-like protein  23.05 
 
 
316 aa  59.3  0.00000008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1047  MetA-pathway of phenol degradation-like protein  24.26 
 
 
307 aa  47.8  0.0002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.379936 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>