25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpop_1206 on replicon NC_010725
Organism: Methylobacterium populi BJ001



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010725  Mpop_1206  hypothetical protein  100 
 
 		 278 aa  560  1.0000000000000001e-159  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.321887  normal  0.463504 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1417  hypothetical protein  88.01 
 
 		 305 aa  477  1e-134  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.344999 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1256  hypothetical protein  87.64 
 
 		 305 aa  476  1e-133  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.168978 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5044  hypothetical protein  52.94 
 
 		 297 aa  273  2.0000000000000002e-72  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.205192  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2218  hypothetical protein  51.12 
 
 		 294 aa  266  2.9999999999999995e-70  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.062473 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2261  hypothetical protein  50.94 
 
 		 295 aa  261  1e-68  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.106617 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2536  hypothetical protein  50.37 
 
 		 295 aa  260  2e-68  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.70197 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2095  hypothetical protein  46.13 
 
 		 303 aa  237  1e-61  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0128666  normal  0.0122297 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2371  hypothetical protein  44.65 
 
 		 296 aa  229  4e-59  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.193146  normal  0.0336172 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5520  hypothetical protein  44.49 
 
 		 284 aa  215  5e-55  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.444925  normal  0.155172 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4179  hypothetical protein  39.92 
 
 		 278 aa  181  2e-44  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1462  hypothetical protein  36.22 
 
 		 290 aa  157  1e-37  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5693  hypothetical protein  37.97 
 
 		 309 aa  153  2.9999999999999998e-36  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.721893  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2195  hypothetical protein  34.22 
 
 		 334 aa  129  4.0000000000000003e-29  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2677  hypothetical protein  31.9 
 
 		 317 aa  122  9e-27  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.356132  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4359  hypothetical protein  34.56 
 
 		 313 aa  118  9.999999999999999e-26  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.100275  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3890  hypothetical protein  34.07 
 
 		 330 aa  114  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.526711  normal  0.295416 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4258  hypothetical protein  34.07 
 
 		 313 aa  114  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.930732  normal  0.515923 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1569  hypothetical protein  32.09 
 
 		 326 aa  107  2e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0945587  normal  0.178884 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2045  hypothetical protein  30.3 
 
 		 331 aa  105  8e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2629  hypothetical protein  31.33 
 
 		 270 aa  105  1e-21  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.712331  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2498  hypothetical protein  34.36 
 
 		 322 aa  102  7e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.250275  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2810  hypothetical protein  32.87 
 
 		 321 aa  101  1e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0632  meta-pathway phenol degradation-like protein  26.1 
 
 		 316 aa  68.2  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1047  MetA-pathway of phenol degradation-like protein  25.72 
 
 		 307 aa  57.8  0.0000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.379936 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>