29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mchl_1417 on replicon NC_011757
Organism: Methylobacterium chloromethanicum CM4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011757  Mchl_1417  hypothetical protein  100 
 
 		 305 aa  618  1e-176  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.344999 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1256  hypothetical protein  99.67 
 
 		 305 aa  617  1e-176  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.168978 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1206  hypothetical protein  88.36 
 
 		 278 aa  492  9.999999999999999e-139  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.321887  normal  0.463504 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2218  hypothetical protein  48.97 
 
 		 294 aa  269  5e-71  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.062473 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5044  hypothetical protein  51.35 
 
 		 297 aa  264  1e-69  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.205192  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2261  hypothetical protein  50.74 
 
 		 295 aa  262  4e-69  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.106617 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2536  hypothetical protein  50.74 
 
 		 295 aa  262  4.999999999999999e-69  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.70197 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2095  hypothetical protein  45.39 
 
 		 303 aa  243  3.9999999999999997e-63  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0128666  normal  0.0122297 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2371  hypothetical protein  43.69 
 
 		 296 aa  231  1e-59  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.193146  normal  0.0336172 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5520  hypothetical protein  40.67 
 
 		 284 aa  214  9.999999999999999e-55  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.444925  normal  0.155172 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4179  hypothetical protein  39.52 
 
 		 278 aa  179  5.999999999999999e-44  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1462  hypothetical protein  34.32 
 
 		 290 aa  163  4.0000000000000004e-39  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5693  hypothetical protein  37.41 
 
 		 309 aa  156  4e-37  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.721893  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2195  hypothetical protein  33.75 
 
 		 334 aa  137  2e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2677  hypothetical protein  30.24 
 
 		 317 aa  124  2e-27  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.356132  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4359  hypothetical protein  33.68 
 
 		 313 aa  122  7e-27  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.100275  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4258  hypothetical protein  33.33 
 
 		 313 aa  118  9.999999999999999e-26  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.930732  normal  0.515923 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3890  hypothetical protein  33.33 
 
 		 330 aa  118  9.999999999999999e-26  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.526711  normal  0.295416 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2629  hypothetical protein  29.86 
 
 		 270 aa  112  1.0000000000000001e-23  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.712331  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1569  hypothetical protein  30.46 
 
 		 326 aa  110  4.0000000000000004e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0945587  normal  0.178884 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2045  hypothetical protein  29.91 
 
 		 331 aa  103  4e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2810  hypothetical protein  30.53 
 
 		 321 aa  102  9e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2498  hypothetical protein  31.41 
 
 		 322 aa  101  1e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.250275  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0632  meta-pathway phenol degradation-like protein  27.21 
 
 		 316 aa  71.6  0.00000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1047  MetA-pathway of phenol degradation-like protein  24.22 
 
 		 307 aa  55.8  0.0000009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.379936 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2404  hypothetical protein  24.39 
 
 		 329 aa  48.5  0.0001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.147622  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1956  hypothetical protein  25.78 
 
 		 322 aa  45.1  0.002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.235366  hitchhiker  0.00028826 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1377  MetA-pathway phenol degradation-like protein  22.9 
 
 		 324 aa  44.7  0.002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.351343  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1191  hypothetical protein  27.55 
 
 		 350 aa  42.7  0.008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.161242  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>