25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mchl_2536 on replicon NC_011757
Organism: Methylobacterium chloromethanicum CM4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010172  Mext_2261  hypothetical protein  99.66 
 
 		 295 aa  590  1e-168  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.106617 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2536  hypothetical protein  100 
 
 		 295 aa  592  1e-168  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.70197 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2218  hypothetical protein  92.54 
 
 		 294 aa  556  1e-157  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.062473 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5044  hypothetical protein  68.08 
 
 		 297 aa  360  1e-98  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.205192  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2095  hypothetical protein  57.54 
 
 		 303 aa  308  5e-83  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0128666  normal  0.0122297 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2371  hypothetical protein  55.97 
 
 		 296 aa  303  2.0000000000000002e-81  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.193146  normal  0.0336172 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5520  hypothetical protein  46.4 
 
 		 284 aa  265  8.999999999999999e-70  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.444925  normal  0.155172 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1206  hypothetical protein  50.37 
 
 		 278 aa  260  2e-68  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.321887  normal  0.463504 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1256  hypothetical protein  50.96 
 
 		 305 aa  258  1e-67  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.168978 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1417  hypothetical protein  50.57 
 
 		 305 aa  256  2e-67  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.344999 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4179  hypothetical protein  46.53 
 
 		 278 aa  226  2e-58  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1462  hypothetical protein  40.5 
 
 		 290 aa  184  2.0000000000000003e-45  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5693  hypothetical protein  41.7 
 
 		 309 aa  180  2.9999999999999997e-44  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.721893  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2677  hypothetical protein  35.56 
 
 		 317 aa  152  5e-36  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.356132  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2195  hypothetical protein  35.03 
 
 		 334 aa  137  3.0000000000000003e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2629  hypothetical protein  34.07 
 
 		 270 aa  135  6.0000000000000005e-31  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.712331  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1569  hypothetical protein  33.33 
 
 		 326 aa  134  9.999999999999999e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0945587  normal  0.178884 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4359  hypothetical protein  34.47 
 
 		 313 aa  134  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.100275  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2810  hypothetical protein  32.92 
 
 		 321 aa  133  3e-30  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3890  hypothetical protein  34.13 
 
 		 330 aa  133  3e-30  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.526711  normal  0.295416 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4258  hypothetical protein  34.13 
 
 		 313 aa  133  3.9999999999999996e-30  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.930732  normal  0.515923 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2498  hypothetical protein  32.79 
 
 		 322 aa  124  2e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.250275  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2045  hypothetical protein  30.86 
 
 		 331 aa  119  6e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0632  meta-pathway phenol degradation-like protein  26.55 
 
 		 316 aa  58.5  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1047  MetA-pathway of phenol degradation-like protein  25.96 
 
 		 307 aa  47.4  0.0003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.379936 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>