59 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msil_3122 on replicon NC_011666
Organism: Methylocella silvestris BL2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011666  Msil_3122  hypothetical protein  100 
 
 		 326 aa  655    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2795  hypothetical protein  45.91 
 
 		 327 aa  294  2e-78  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6752  hypothetical protein  42.09 
 
 		 337 aa  234  2.0000000000000002e-60  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00609082 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0531  hypothetical protein  39.62 
 
 		 345 aa  223  4e-57  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5144  hypothetical protein  38.24 
 
 		 331 aa  219  3.9999999999999997e-56  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.62916  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1191  hypothetical protein  40.69 
 
 		 350 aa  213  2.9999999999999995e-54  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.161242  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2404  hypothetical protein  35.16 
 
 		 329 aa  192  7e-48  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.147622  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3413  hypothetical protein  36.3 
 
 		 328 aa  181  2e-44  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.591496  normal  0.708141 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8068  hypothetical protein  36.12 
 
 		 341 aa  174  1.9999999999999998e-42  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2975  hypothetical protein  30.64 
 
 		 331 aa  127  2.0000000000000002e-28  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2203  hypothetical protein  31.08 
 
 		 349 aa  125  1e-27  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0598  hypothetical protein  38.04 
 
 		 364 aa  124  3e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.161242  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08780  hypothetical protein  31.52 
 
 		 268 aa  122  9.999999999999999e-27  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.299934  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2732  hypothetical protein  31.54 
 
 		 301 aa  120  3e-26  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.206778  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3305  MetA-pathway phenol degradation-like protein  31.09 
 
 		 299 aa  119  6e-26  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.853243 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2982  hypothetical protein  32.05 
 
 		 299 aa  110  4.0000000000000004e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.0000000220614  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1676  hypothetical protein  29.41 
 
 		 328 aa  97.8  2e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.275603  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1833  putative signal peptide protein  31.51 
 
 		 297 aa  97.4  3e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.714906  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30840  hypothetical protein  29.23 
 
 		 294 aa  93.6  4e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.856206  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3482  meta-pathway phenol degradation-like protein  30.43 
 
 		 318 aa  91.3  2e-17  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70300  putative enzyme  26.52 
 
 		 316 aa  90.5  3e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0883  hypothetical protein  28.17 
 
 		 309 aa  89  1e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.00462477  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2107  putative signal peptide protein  28.46 
 
 		 309 aa  88.2  2e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6101  putative lipoprotein  26.05 
 
 		 316 aa  87  4e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.540128  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5460  hypothetical protein  28.12 
 
 		 296 aa  87  4e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3168  hypothetical protein  27.61 
 
 		 315 aa  87  4e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS03076  putative signal peptide protein  32.73 
 
 		 311 aa  87  4e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2955  meta-pathway phenol degradation-like protein  26.75 
 
 		 300 aa  86.7  5e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.148613  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4501  MetA-pathway phenol degradation-like protein  27.94 
 
 		 295 aa  84  0.000000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3157  meta-pathway phenol degradation-like protein  27.3 
 
 		 295 aa  82.4  0.00000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6407  hypothetical protein  30.88 
 
 		 312 aa  81.6  0.00000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.579544 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6119  hypothetical protein  30.88 
 
 		 312 aa  80.5  0.00000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6970  hypothetical protein  29.56 
 
 		 340 aa  79.7  0.00000000000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000157214  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4536  phenol degradation protein  29.97 
 
 		 318 aa  79  0.0000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.375555  normal  0.225823 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5224  hypothetical protein  27.92 
 
 		 322 aa  78.2  0.0000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.347235 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0092  hypothetical protein  28.8 
 
 		 334 aa  77  0.0000000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.672977  normal  0.778879 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3274  hypothetical protein  27.91 
 
 		 312 aa  77  0.0000000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0193485 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4890  hypothetical protein  27.91 
 
 		 312 aa  77  0.0000000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32260  signal peptide protein  25.08 
 
 		 303 aa  76.6  0.0000000000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6917  hypothetical protein  27.61 
 
 		 312 aa  75.9  0.000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1838  phenol metabolism protein  27.96 
 
 		 310 aa  74.7  0.000000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.394031  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1588  hypothetical protein  27.4 
 
 		 320 aa  72.4  0.000000000009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.232894  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0190  hypothetical protein  28.7 
 
 		 307 aa  71.2  0.00000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4527  hypothetical protein  26.86 
 
 		 310 aa  71.6  0.00000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3846  hypothetical protein  28.22 
 
 		 334 aa  70.9  0.00000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0368  hypothetical protein  26.28 
 
 		 295 aa  70.5  0.00000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4267  hypothetical protein  35.71 
 
 		 297 aa  69.7  0.00000000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0355  hypothetical protein  26.13 
 
 		 295 aa  68.9  0.0000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3195  hypothetical protein  35.17 
 
 		 313 aa  67.4  0.0000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2127  phenol degradation-like protein  24.18 
 
 		 307 aa  62  0.00000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4488  protein involved in meta-pathway of phenol degradation  24.77 
 
 		 302 aa  58.5  0.0000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.796292  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2845  phenol degradation-like protein  23.4 
 
 		 306 aa  56.6  0.0000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0341  hypothetical protein  24.58 
 
 		 295 aa  53.1  0.000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.225999  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1272  meta-pathway phenol degradation-like protein  24.13 
 
 		 325 aa  49.3  0.00009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1376  meta-pathway phenol degradation protein  23.91 
 
 		 309 aa  48.1  0.0002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.768311 
 
 
-
 
NC_003296  RS05192  putative signal peptide protein  24.74 
 
 		 319 aa  48.1  0.0002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.00268581  normal  0.960066 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1728  hypothetical protein  23.87 
 
 		 334 aa  45.1  0.002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000180313 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2763  hypothetical protein  26.2 
 
 		 301 aa  45.1  0.002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_32640  hypothetical protein  26.2 
 
 		 303 aa  43.5  0.005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00101125  hitchhiker  0.00152263 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>