79 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Adeh_0341 on replicon NC_007760
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007760  Adeh_0341  hypothetical protein  100 
 
 
295 aa  592  1e-168  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.225999  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0355  hypothetical protein  94.58 
 
 
295 aa  571  1.0000000000000001e-162  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0368  hypothetical protein  93.56 
 
 
295 aa  563  1.0000000000000001e-159  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1838  phenol metabolism protein  37.33 
 
 
310 aa  181  2e-44  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.394031  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3482  meta-pathway phenol degradation-like protein  33.11 
 
 
318 aa  145  6e-34  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2982  hypothetical protein  31.94 
 
 
299 aa  145  1e-33  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.0000000220614  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2732  hypothetical protein  32.86 
 
 
301 aa  144  2e-33  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.206778  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2107  putative signal peptide protein  32.5 
 
 
309 aa  135  9.999999999999999e-31  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3305  MetA-pathway phenol degradation-like protein  32.38 
 
 
299 aa  132  5e-30  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.853243 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4527  hypothetical protein  33.46 
 
 
310 aa  127  3e-28  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0883  hypothetical protein  30.14 
 
 
309 aa  118  9.999999999999999e-26  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.00462477  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4501  MetA-pathway phenol degradation-like protein  30.85 
 
 
295 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS03076  putative signal peptide protein  33.98 
 
 
311 aa  117  3e-25  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30840  hypothetical protein  30.03 
 
 
294 aa  115  1.0000000000000001e-24  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.856206  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4890  hypothetical protein  31.52 
 
 
312 aa  113  4.0000000000000004e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3274  hypothetical protein  31.52 
 
 
312 aa  113  4.0000000000000004e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.0193485 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6917  hypothetical protein  31.52 
 
 
312 aa  112  5e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32260  signal peptide protein  30.74 
 
 
303 aa  112  7.000000000000001e-24  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3157  meta-pathway phenol degradation-like protein  30.51 
 
 
295 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6407  hypothetical protein  32.3 
 
 
312 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.579544 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6119  hypothetical protein  32.3 
 
 
312 aa  109  5e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2955  meta-pathway phenol degradation-like protein  31.03 
 
 
300 aa  109  7.000000000000001e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.148613  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1833  putative signal peptide protein  30.41 
 
 
297 aa  107  2e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.714906  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5460  hypothetical protein  29.55 
 
 
296 aa  107  2e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4267  hypothetical protein  29.62 
 
 
297 aa  108  2e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08780  hypothetical protein  29.78 
 
 
268 aa  107  3e-22  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.299934  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3195  hypothetical protein  27.45 
 
 
313 aa  100  3e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1377  MetA-pathway phenol degradation-like protein  30.65 
 
 
324 aa  100  3e-20  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.351343  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1588  hypothetical protein  30.86 
 
 
320 aa  98.6  1e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.232894  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0164  hypothetical protein  28.47 
 
 
306 aa  92  1e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.433262  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3839  regulation of phenolics degradation protein  30.98 
 
 
298 aa  89.4  6e-17  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4488  protein involved in meta-pathway of phenol degradation  28.28 
 
 
302 aa  87.8  2e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.796292  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0190  hypothetical protein  24 
 
 
307 aa  87  3e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70300  putative enzyme  25.62 
 
 
316 aa  85.5  9e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6101  putative lipoprotein  24.84 
 
 
316 aa  85.5  0.000000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.540128  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1931  hypothetical protein  25.97 
 
 
327 aa  82.4  0.000000000000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.903227  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2845  phenol degradation-like protein  23.91 
 
 
306 aa  81.6  0.00000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1728  hypothetical protein  28.68 
 
 
334 aa  81.6  0.00000000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000180313 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4832  hypothetical protein  26.67 
 
 
304 aa  79  0.00000000000009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.922561 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2127  phenol degradation-like protein  23.43 
 
 
307 aa  78.6  0.0000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3168  hypothetical protein  26.94 
 
 
315 aa  77.4  0.0000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5144  hypothetical protein  28.34 
 
 
331 aa  76.6  0.0000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.62916  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2098  hypothetical protein  27.51 
 
 
269 aa  72  0.00000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.591796  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1047  MetA-pathway of phenol degradation-like protein  26.64 
 
 
307 aa  67  0.0000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.379936 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2763  hypothetical protein  23.51 
 
 
301 aa  65.9  0.0000000009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_32640  hypothetical protein  23.51 
 
 
303 aa  65.1  0.000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00101125  hitchhiker  0.00152263 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0608  hypothetical protein  27.27 
 
 
330 aa  63.9  0.000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3413  hypothetical protein  27.54 
 
 
328 aa  63.9  0.000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.591496  normal  0.708141 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0632  meta-pathway phenol degradation-like protein  23.29 
 
 
316 aa  62.8  0.000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0531  hypothetical protein  26.6 
 
 
345 aa  60.8  0.00000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1956  hypothetical protein  27.21 
 
 
322 aa  61.2  0.00000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.235366  hitchhiker  0.00028826 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33380  hypothetical protein  23.81 
 
 
306 aa  60.1  0.00000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.72965  normal  0.084061 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1191  hypothetical protein  24.22 
 
 
350 aa  58.9  0.0000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.161242  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0295  hypothetical protein  27.46 
 
 
256 aa  58.9  0.0000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000520717 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3122  hypothetical protein  24.34 
 
 
326 aa  57  0.0000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7148  protein involved in meta-pathway of phenol degradation  26.7 
 
 
304 aa  55.5  0.000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.00536985  normal 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6775  protein involved in MetA-pathway of phenol degradation-like protein  25.49 
 
 
318 aa  54.7  0.000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.617497 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6305  protein involved in MetA-pathway of phenol degradation-like protein  25.49 
 
 
319 aa  54.7  0.000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.477506  normal  0.244867 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5489  protein involved in MetA-pathway of phenol degradation-like  25.49 
 
 
318 aa  54.7  0.000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2838  hypothetical protein  22.86 
 
 
306 aa  55.1  0.000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6009  protein involved in MetA-pathway of phenol degradation-like protein  25.68 
 
 
319 aa  54.3  0.000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8068  hypothetical protein  26.3 
 
 
341 aa  53.5  0.000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6363  MetA-pathway-like protein  25.49 
 
 
318 aa  53.1  0.000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6752  hypothetical protein  23.57 
 
 
337 aa  53.1  0.000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00609082 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7181  protein involved in meta-pathway of phenol degradation-like  24.68 
 
 
318 aa  52  0.00001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0516478 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2732  putative signal peptide  27.83 
 
 
315 aa  48.1  0.0002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.235663  normal  0.493951 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2388  hypothetical protein  23.08 
 
 
310 aa  47.4  0.0003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.806824 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1768  meta-pathway phenol degradation-like protein  27.08 
 
 
316 aa  46.6  0.0004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2404  hypothetical protein  23.91 
 
 
329 aa  45.4  0.001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.147622  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1272  meta-pathway phenol degradation-like protein  23.4 
 
 
325 aa  45.4  0.001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5224  hypothetical protein  23.32 
 
 
322 aa  44.7  0.002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.347235 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1676  hypothetical protein  24.03 
 
 
328 aa  44.3  0.002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.275603  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1376  meta-pathway phenol degradation protein  26.52 
 
 
309 aa  43.9  0.003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.768311 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2795  hypothetical protein  23.78 
 
 
327 aa  44.3  0.003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0092  hypothetical protein  25.97 
 
 
334 aa  43.5  0.004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.672977  normal  0.778879 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3846  hypothetical protein  24.04 
 
 
334 aa  43.5  0.004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS05192  putative signal peptide protein  24.57 
 
 
319 aa  43.9  0.004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.00268581  normal  0.960066 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5600  hypothetical protein  29.27 
 
 
383 aa  42.7  0.008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  unclonable  0.00091534  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1148  meta-pathway phenol degradation-like protein  21.05 
 
 
324 aa  42.7  0.008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>