63 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_1931 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_1931  hypothetical protein  100 
 
 		 327 aa  660    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.903227  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4832  hypothetical protein  44.41 
 
 		 304 aa  258  1e-67  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.922561 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0164  hypothetical protein  45.42 
 
 		 306 aa  243  5e-63  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.433262  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2388  hypothetical protein  37.96 
 
 		 310 aa  206  4e-52  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.806824 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5460  hypothetical protein  37.33 
 
 		 296 aa  194  2e-48  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2732  hypothetical protein  31.69 
 
 		 301 aa  144  2e-33  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.206778  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08780  hypothetical protein  29.79 
 
 		 268 aa  127  3e-28  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.299934  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4488  protein involved in meta-pathway of phenol degradation  31.83 
 
 		 302 aa  124  3e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.796292  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1838  phenol metabolism protein  32.42 
 
 		 310 aa  123  4e-27  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.394031  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3157  meta-pathway phenol degradation-like protein  29.81 
 
 		 295 aa  122  9e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32260  signal peptide protein  28.42 
 
 		 303 aa  120  3e-26  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4501  MetA-pathway phenol degradation-like protein  29.17 
 
 		 295 aa  120  3.9999999999999996e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3305  MetA-pathway phenol degradation-like protein  27.65 
 
 		 299 aa  110  3e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.853243 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3482  meta-pathway phenol degradation-like protein  27.8 
 
 		 318 aa  109  6e-23  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0883  hypothetical protein  29.41 
 
 		 309 aa  109  6e-23  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.00462477  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1833  putative signal peptide protein  29.41 
 
 		 297 aa  105  8e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.714906  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2982  hypothetical protein  27.33 
 
 		 299 aa  103  3e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.0000000220614  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2107  putative signal peptide protein  30.25 
 
 		 309 aa  104  3e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2955  meta-pathway phenol degradation-like protein  26.27 
 
 		 300 aa  98.6  1e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.148613  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3195  hypothetical protein  29.85 
 
 		 313 aa  94.7  2e-18  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4267  hypothetical protein  30.88 
 
 		 297 aa  94.7  2e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70300  putative enzyme  25.55 
 
 		 316 aa  90.5  4e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1377  MetA-pathway phenol degradation-like protein  26.38 
 
 		 324 aa  89.4  8e-17  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.351343  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03076  putative signal peptide protein  27.27 
 
 		 311 aa  87.4  3e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1588  hypothetical protein  26.23 
 
 		 320 aa  87  4e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.232894  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2127  phenol degradation-like protein  26.38 
 
 		 307 aa  85.9  8e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6407  hypothetical protein  29.63 
 
 		 312 aa  85.5  0.000000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.579544 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3168  hypothetical protein  26.2 
 
 		 315 aa  85.1  0.000000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30840  hypothetical protein  25.77 
 
 		 294 aa  85.1  0.000000000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.856206  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6119  hypothetical protein  29.63 
 
 		 312 aa  84.3  0.000000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0355  hypothetical protein  26.95 
 
 		 295 aa  84  0.000000000000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4527  hypothetical protein  26.48 
 
 		 310 aa  83.6  0.000000000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4890  hypothetical protein  28.4 
 
 		 312 aa  82.8  0.000000000000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3274  hypothetical protein  28.4 
 
 		 312 aa  82.8  0.000000000000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0193485 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2845  phenol degradation-like protein  26.74 
 
 		 306 aa  82.4  0.00000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6101  putative lipoprotein  25.86 
 
 		 316 aa  82  0.00000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.540128  n/a   
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6917  hypothetical protein  28.4 
 
 		 312 aa  82.4  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_32640  hypothetical protein  23.99 
 
 		 303 aa  81.6  0.00000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00101125  hitchhiker  0.00152263 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0341  hypothetical protein  25.76 
 
 		 295 aa  80.1  0.00000000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.225999  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2763  hypothetical protein  24.16 
 
 		 301 aa  79.7  0.00000000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0368  hypothetical protein  25.65 
 
 		 295 aa  79.3  0.00000000000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0190  hypothetical protein  25.77 
 
 		 307 aa  73.6  0.000000000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0632  meta-pathway phenol degradation-like protein  26.13 
 
 		 316 aa  71.2  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1047  MetA-pathway of phenol degradation-like protein  24.83 
 
 		 307 aa  71.6  0.00000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.379936 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5600  hypothetical protein  25 
 
 		 383 aa  65.5  0.000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  unclonable  0.00091534  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1272  meta-pathway phenol degradation-like protein  25.09 
 
 		 325 aa  65.1  0.000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2838  hypothetical protein  23.28 
 
 		 306 aa  63.5  0.000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33380  hypothetical protein  22.9 
 
 		 306 aa  59.7  0.00000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.72965  normal  0.084061 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1956  hypothetical protein  23.79 
 
 		 322 aa  55.8  0.000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.235366  hitchhiker  0.00028826 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1728  hypothetical protein  24.29 
 
 		 334 aa  55.1  0.000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000180313 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5144  hypothetical protein  24.92 
 
 		 331 aa  54.3  0.000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.62916  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2795  hypothetical protein  27.87 
 
 		 327 aa  52.8  0.000008  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1191  hypothetical protein  28.32 
 
 		 350 aa  50.8  0.00003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.161242  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7148  protein involved in meta-pathway of phenol degradation  24.32 
 
 		 304 aa  50.4  0.00004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.00536985  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2404  hypothetical protein  25.87 
 
 		 329 aa  48.1  0.0002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.147622  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0608  hypothetical protein  22.67 
 
 		 330 aa  48.1  0.0002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6752  hypothetical protein  27.38 
 
 		 337 aa  48.1  0.0002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00609082 
 
 
-
 
NC_003296  RS05192  putative signal peptide protein  23.84 
 
 		 319 aa  47.4  0.0004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.00268581  normal  0.960066 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0531  hypothetical protein  23.73 
 
 		 345 aa  47  0.0005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2975  hypothetical protein  27.6 
 
 		 331 aa  44.7  0.002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2098  hypothetical protein  21.22 
 
 		 269 aa  44.7  0.002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.591796  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3839  regulation of phenolics degradation protein  22.83 
 
 		 298 aa  43.9  0.003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8068  hypothetical protein  26.55 
 
 		 341 aa  43.9  0.004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>