43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_1148 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009441  Fjoh_1148  meta-pathway phenol degradation-like protein  100 
 
 
324 aa  662    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1728  hypothetical protein  29.11 
 
 
334 aa  135  9.999999999999999e-31  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000180313 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0295  hypothetical protein  27.52 
 
 
256 aa  114  3e-24  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000520717 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2098  hypothetical protein  26.36 
 
 
269 aa  110  3e-23  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.591796  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1376  meta-pathway phenol degradation protein  26.58 
 
 
309 aa  95.5  1e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.768311 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2099  Protein involved in meta-pathway of phenol degradation  29.48 
 
 
319 aa  90.5  3e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.119201  normal  0.245606 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3839  regulation of phenolics degradation protein  29.5 
 
 
298 aa  75.1  0.000000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1768  meta-pathway phenol degradation-like protein  23.95 
 
 
316 aa  73.9  0.000000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0190  hypothetical protein  22.49 
 
 
307 aa  67  0.0000000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2107  putative signal peptide protein  24.54 
 
 
309 aa  63.2  0.000000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS03076  putative signal peptide protein  24.74 
 
 
311 aa  61.2  0.00000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2982  hypothetical protein  22.46 
 
 
299 aa  60.8  0.00000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.0000000220614  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32260  signal peptide protein  25.7 
 
 
303 aa  58.9  0.0000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0883  hypothetical protein  23.33 
 
 
309 aa  58.2  0.0000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.00462477  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4527  hypothetical protein  25.9 
 
 
310 aa  56.6  0.0000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2732  hypothetical protein  24.05 
 
 
301 aa  56.2  0.0000008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.206778  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2955  meta-pathway phenol degradation-like protein  24.84 
 
 
300 aa  52.8  0.000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.148613  normal 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3482  meta-pathway phenol degradation-like protein  23.78 
 
 
318 aa  52.8  0.000007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8068  hypothetical protein  25.13 
 
 
341 aa  51.6  0.00002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3305  MetA-pathway phenol degradation-like protein  22.53 
 
 
299 aa  50.4  0.00004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.853243 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_32640  hypothetical protein  23.47 
 
 
303 aa  50.1  0.00005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00101125  hitchhiker  0.00152263 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6407  hypothetical protein  25 
 
 
312 aa  50.1  0.00006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.579544 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6752  hypothetical protein  23.53 
 
 
337 aa  49.3  0.00008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00609082 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5144  hypothetical protein  23.78 
 
 
331 aa  48.5  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.62916  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6119  hypothetical protein  25 
 
 
312 aa  48.9  0.0001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2975  hypothetical protein  24.18 
 
 
331 aa  48.9  0.0001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5460  hypothetical protein  25.43 
 
 
296 aa  47  0.0005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0531  hypothetical protein  20.82 
 
 
345 aa  46.6  0.0006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2838  hypothetical protein  25.93 
 
 
306 aa  46.2  0.0007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0355  hypothetical protein  21.88 
 
 
295 aa  45.4  0.001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1588  hypothetical protein  24.05 
 
 
320 aa  45.4  0.001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.232894  n/a   
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6917  hypothetical protein  23.71 
 
 
312 aa  45.4  0.001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2763  hypothetical protein  23.36 
 
 
301 aa  45.1  0.002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3195  hypothetical protein  23.97 
 
 
313 aa  44.7  0.002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1676  hypothetical protein  25.21 
 
 
328 aa  44.7  0.002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.275603  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4890  hypothetical protein  23.28 
 
 
312 aa  43.9  0.004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70300  putative enzyme  23.65 
 
 
316 aa  43.9  0.004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3274  hypothetical protein  23.28 
 
 
312 aa  43.9  0.004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.0193485 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1272  meta-pathway phenol degradation-like protein  23.47 
 
 
325 aa  43.5  0.005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33380  hypothetical protein  25.21 
 
 
306 aa  43.5  0.005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.72965  normal  0.084061 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6101  putative lipoprotein  23.65 
 
 
316 aa  43.1  0.006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.540128  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0598  hypothetical protein  23.5 
 
 
364 aa  43.1  0.006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.161242  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0341  hypothetical protein  21.05 
 
 
295 aa  42.7  0.008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.225999  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>