41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_1376 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008009  Acid345_1376  meta-pathway phenol degradation protein  100 
 
 		 309 aa  634    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.768311 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1148  meta-pathway phenol degradation-like protein  28.83 
 
 		 324 aa  94  3e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1728  hypothetical protein  24.54 
 
 		 334 aa  91.7  1e-17  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000180313 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2982  hypothetical protein  27.27 
 
 		 299 aa  78.6  0.0000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.0000000220614  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1768  meta-pathway phenol degradation-like protein  24.65 
 
 		 316 aa  74.7  0.000000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2732  hypothetical protein  27.05 
 
 		 301 aa  73.9  0.000000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.206778  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2098  hypothetical protein  21.64 
 
 		 269 aa  68.2  0.0000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.591796  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3839  regulation of phenolics degradation protein  25.27 
 
 		 298 aa  67.4  0.0000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0295  hypothetical protein  23.45 
 
 		 256 aa  67  0.0000000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000520717 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6407  hypothetical protein  24.28 
 
 		 312 aa  66.6  0.0000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.579544 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6119  hypothetical protein  24.28 
 
 		 312 aa  65.5  0.000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6917  hypothetical protein  27.62 
 
 		 312 aa  62.8  0.000000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2955  meta-pathway phenol degradation-like protein  26.24 
 
 		 300 aa  58.9  0.0000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.148613  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4890  hypothetical protein  26.52 
 
 		 312 aa  58.2  0.0000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3274  hypothetical protein  26.52 
 
 		 312 aa  58.2  0.0000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0193485 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2107  putative signal peptide protein  26.67 
 
 		 309 aa  57  0.0000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1588  hypothetical protein  24.67 
 
 		 320 aa  56.6  0.0000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.232894  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2404  hypothetical protein  24.48 
 
 		 329 aa  56.2  0.0000006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.147622  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2099  Protein involved in meta-pathway of phenol degradation  30.66 
 
 		 319 aa  55.8  0.0000009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.119201  normal  0.245606 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5144  hypothetical protein  20.75 
 
 		 331 aa  54.3  0.000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.62916  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08780  hypothetical protein  24.89 
 
 		 268 aa  53.5  0.000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.299934  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8068  hypothetical protein  22.6 
 
 		 341 aa  53.5  0.000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32260  signal peptide protein  25 
 
 		 303 aa  52  0.00001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3305  MetA-pathway phenol degradation-like protein  27.43 
 
 		 299 aa  52.4  0.00001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.853243 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70300  putative enzyme  26.98 
 
 		 316 aa  48.9  0.0001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0883  hypothetical protein  24.11 
 
 		 309 aa  48.5  0.0001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.00462477  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6101  putative lipoprotein  28.83 
 
 		 316 aa  48.1  0.0002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.540128  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1838  phenol metabolism protein  24.67 
 
 		 310 aa  47.8  0.0002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.394031  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0368  hypothetical protein  26.67 
 
 		 295 aa  46.6  0.0005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3122  hypothetical protein  23.91 
 
 		 326 aa  46.6  0.0005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6775  protein involved in MetA-pathway of phenol degradation-like protein  23.26 
 
 		 318 aa  45.8  0.001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.617497 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3168  hypothetical protein  25.79 
 
 		 315 aa  45.4  0.001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5600  hypothetical protein  25.25 
 
 		 383 aa  45.1  0.001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  unclonable  0.00091534  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6363  MetA-pathway-like protein  23.26 
 
 		 318 aa  45.8  0.001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5489  protein involved in MetA-pathway of phenol degradation-like  23.26 
 
 		 318 aa  45.8  0.001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7181  protein involved in meta-pathway of phenol degradation-like  23.64 
 
 		 318 aa  44.3  0.003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0516478 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1191  hypothetical protein  23.49 
 
 		 350 aa  43.9  0.003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.161242  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0341  hypothetical protein  26.58 
 
 		 295 aa  44.3  0.003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.225999  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6305  protein involved in MetA-pathway of phenol degradation-like protein  23.62 
 
 		 319 aa  44.3  0.003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.477506  normal  0.244867 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4488  protein involved in meta-pathway of phenol degradation  23.02 
 
 		 302 aa  42.7  0.007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.796292  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6009  protein involved in MetA-pathway of phenol degradation-like protein  23.62 
 
 		 319 aa  42.7  0.007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>