32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_2099 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013061  Phep_2099  Protein involved in meta-pathway of phenol degradation  100 
 
 		 319 aa  653    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.119201  normal  0.245606 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1148  meta-pathway phenol degradation-like protein  33.04 
 
 		 324 aa  90.1  4e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2098  hypothetical protein  25.5 
 
 		 269 aa  72.8  0.000000000007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.591796  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2982  hypothetical protein  28.32 
 
 		 299 aa  71.6  0.00000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.0000000220614  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0295  hypothetical protein  26.17 
 
 		 256 aa  69.7  0.00000000006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000520717 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1728  hypothetical protein  26.36 
 
 		 334 aa  66.2  0.0000000007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000180313 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2955  meta-pathway phenol degradation-like protein  27.4 
 
 		 300 aa  63.9  0.000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.148613  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2732  hypothetical protein  26.06 
 
 		 301 aa  59.7  0.00000006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.206778  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6119  hypothetical protein  26.05 
 
 		 312 aa  58.9  0.0000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6407  hypothetical protein  24.17 
 
 		 312 aa  59.3  0.0000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.579544 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1768  meta-pathway phenol degradation-like protein  27.62 
 
 		 316 aa  58.2  0.0000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6917  hypothetical protein  24.09 
 
 		 312 aa  55.1  0.000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2107  putative signal peptide protein  26.51 
 
 		 309 aa  53.9  0.000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1376  meta-pathway phenol degradation protein  25.57 
 
 		 309 aa  53.9  0.000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.768311 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5460  hypothetical protein  25.7 
 
 		 296 aa  53.1  0.000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70300  putative enzyme  28.28 
 
 		 316 aa  53.1  0.000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5144  hypothetical protein  27.22 
 
 		 331 aa  53.1  0.000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.62916  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1588  hypothetical protein  26.01 
 
 		 320 aa  52.4  0.000009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.232894  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6101  putative lipoprotein  29.93 
 
 		 316 aa  52.4  0.00001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.540128  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3274  hypothetical protein  23.18 
 
 		 312 aa  50.4  0.00004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0193485 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4890  hypothetical protein  23.18 
 
 		 312 aa  50.4  0.00004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2975  hypothetical protein  29.49 
 
 		 331 aa  49.7  0.00007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3168  hypothetical protein  27.5 
 
 		 315 aa  49.3  0.00008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS03076  putative signal peptide protein  24.08 
 
 		 311 aa  48.9  0.0001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0164  hypothetical protein  24.43 
 
 		 306 aa  48.9  0.0001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.433262  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3305  MetA-pathway phenol degradation-like protein  23.66 
 
 		 299 aa  45.1  0.002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.853243 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08780  hypothetical protein  24.39 
 
 		 268 aa  43.9  0.003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.299934  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8068  hypothetical protein  26.25 
 
 		 341 aa  44.3  0.003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0598  hypothetical protein  27.07 
 
 		 364 aa  43.1  0.006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.161242  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0092  hypothetical protein  29.51 
 
 		 334 aa  43.1  0.007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.672977  normal  0.778879 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4267  hypothetical protein  23.12 
 
 		 297 aa  42.7  0.009  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3195  hypothetical protein  26.83 
 
 		 313 aa  42.4  0.01  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>