64 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mext_0531 on replicon NC_010172
Organism: Methylobacterium extorquens PA1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010172  Mext_0531  hypothetical protein  100 
 
 		 345 aa  699    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6752  hypothetical protein  71.77 
 
 		 337 aa  503  1e-141  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00609082 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1191  hypothetical protein  62.95 
 
 		 350 aa  416  9.999999999999999e-116  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.161242  normal  1 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8068  hypothetical protein  55.11 
 
 		 341 aa  345  8e-94  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2404  hypothetical protein  52.23 
 
 		 329 aa  340  1e-92  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.147622  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3413  hypothetical protein  50.86 
 
 		 328 aa  307  1.0000000000000001e-82  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.591496  normal  0.708141 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5144  hypothetical protein  47.6 
 
 		 331 aa  291  1e-77  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.62916  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3122  hypothetical protein  40.48 
 
 		 326 aa  221  9.999999999999999e-57  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2795  hypothetical protein  36.68 
 
 		 327 aa  192  6e-48  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2203  hypothetical protein  35.09 
 
 		 349 aa  174  2.9999999999999996e-42  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2975  hypothetical protein  28.78 
 
 		 331 aa  150  3e-35  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0598  hypothetical protein  31.98 
 
 		 364 aa  149  9e-35  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.161242  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2732  hypothetical protein  31.25 
 
 		 301 aa  117  1.9999999999999998e-25  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.206778  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08780  hypothetical protein  30.31 
 
 		 268 aa  117  3e-25  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.299934  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30840  hypothetical protein  28.53 
 
 		 294 aa  111  2.0000000000000002e-23  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.856206  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3305  MetA-pathway phenol degradation-like protein  29.02 
 
 		 299 aa  111  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.853243 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2982  hypothetical protein  29.81 
 
 		 299 aa  106  6e-22  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.0000000220614  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3157  meta-pathway phenol degradation-like protein  31.02 
 
 		 295 aa  96.3  8e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1676  hypothetical protein  30.72 
 
 		 328 aa  95.9  8e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.275603  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0883  hypothetical protein  28.57 
 
 		 309 aa  95.1  2e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.00462477  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2107  putative signal peptide protein  28.8 
 
 		 309 aa  93.6  4e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3482  meta-pathway phenol degradation-like protein  28.66 
 
 		 318 aa  92.4  9e-18  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4501  MetA-pathway phenol degradation-like protein  30.36 
 
 		 295 aa  92.4  9e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6101  putative lipoprotein  27.33 
 
 		 316 aa  91.7  2e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.540128  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1588  hypothetical protein  30.03 
 
 		 320 aa  88.6  1e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.232894  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5460  hypothetical protein  26.35 
 
 		 296 aa  85.9  9e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2955  meta-pathway phenol degradation-like protein  27.76 
 
 		 300 aa  85.5  0.000000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.148613  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70300  putative enzyme  27.91 
 
 		 316 aa  85.1  0.000000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0092  hypothetical protein  27.78 
 
 		 334 aa  84  0.000000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.672977  normal  0.778879 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32260  signal peptide protein  25.93 
 
 		 303 aa  83.2  0.000000000000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3846  hypothetical protein  27.36 
 
 		 334 aa  82.8  0.000000000000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1833  putative signal peptide protein  28.03 
 
 		 297 aa  82.8  0.000000000000008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.714906  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6970  hypothetical protein  28.75 
 
 		 340 aa  81.6  0.00000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000157214  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4536  phenol degradation protein  29.17 
 
 		 318 aa  79.3  0.00000000000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.375555  normal  0.225823 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3168  hypothetical protein  27.31 
 
 		 315 aa  79  0.0000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5224  hypothetical protein  28.3 
 
 		 322 aa  79  0.0000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.347235 
 
 
-
 
NC_003296  RS03076  putative signal peptide protein  26.92 
 
 		 311 aa  75.1  0.000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3195  hypothetical protein  28.4 
 
 		 313 aa  73.9  0.000000000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1838  phenol metabolism protein  26.76 
 
 		 310 aa  68.6  0.0000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.394031  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0190  hypothetical protein  25.62 
 
 		 307 aa  68.6  0.0000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6407  hypothetical protein  25.82 
 
 		 312 aa  67  0.0000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.579544 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4527  hypothetical protein  25.87 
 
 		 310 aa  66.2  0.0000000007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6119  hypothetical protein  25.49 
 
 		 312 aa  63.5  0.000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6917  hypothetical protein  26.8 
 
 		 312 aa  61.6  0.00000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4890  hypothetical protein  26.14 
 
 		 312 aa  60.8  0.00000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4267  hypothetical protein  24.14 
 
 		 297 aa  60.8  0.00000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3274  hypothetical protein  26.14 
 
 		 312 aa  60.8  0.00000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0193485 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2127  phenol degradation-like protein  22.14 
 
 		 307 aa  60.5  0.00000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0341  hypothetical protein  26.26 
 
 		 295 aa  59.3  0.00000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.225999  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1728  hypothetical protein  23.53 
 
 		 334 aa  56.2  0.0000009  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000180313 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0355  hypothetical protein  25.16 
 
 		 295 aa  55.8  0.000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4488  protein involved in meta-pathway of phenol degradation  24.23 
 
 		 302 aa  54.7  0.000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.796292  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0368  hypothetical protein  26.28 
 
 		 295 aa  55.1  0.000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2388  hypothetical protein  32 
 
 		 310 aa  54.7  0.000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.806824 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2845  phenol degradation-like protein  24 
 
 		 306 aa  53.9  0.000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0632  meta-pathway phenol degradation-like protein  26.76 
 
 		 316 aa  53.9  0.000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2098  hypothetical protein  22.46 
 
 		 269 aa  52.8  0.000009  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.591796  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3839  regulation of phenolics degradation protein  26.67 
 
 		 298 aa  52  0.00001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0164  hypothetical protein  26.4 
 
 		 306 aa  48.1  0.0002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.433262  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1931  hypothetical protein  23.73 
 
 		 327 aa  47  0.0005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.903227  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2838  hypothetical protein  22.08 
 
 		 306 aa  46.2  0.0007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1148  meta-pathway phenol degradation-like protein  20.82 
 
 		 324 aa  46.2  0.0008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1047  MetA-pathway of phenol degradation-like protein  24.7 
 
 		 307 aa  43.1  0.007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.379936 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1377  MetA-pathway phenol degradation-like protein  24.26 
 
 		 324 aa  43.1  0.007  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.351343  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>