78 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene A2cp1_0368 on replicon NC_011891
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011891  A2cp1_0368  hypothetical protein  100 
 
 		 295 aa  593  1e-169  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0355  hypothetical protein  93.22 
 
 		 295 aa  565  1e-160  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0341  hypothetical protein  93.56 
 
 		 295 aa  541  1e-153  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.225999  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1838  phenol metabolism protein  37.67 
 
 		 310 aa  183  3e-45  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.394031  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2982  hypothetical protein  31.94 
 
 		 299 aa  145  8.000000000000001e-34  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.0000000220614  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2732  hypothetical protein  32.5 
 
 		 301 aa  145  1e-33  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.206778  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3482  meta-pathway phenol degradation-like protein  31.42 
 
 		 318 aa  139  3.9999999999999997e-32  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3305  MetA-pathway phenol degradation-like protein  32.16 
 
 		 299 aa  135  8e-31  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.853243 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2107  putative signal peptide protein  32.5 
 
 		 309 aa  134  1.9999999999999998e-30  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4527  hypothetical protein  32.68 
 
 		 310 aa  123  3e-27  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03076  putative signal peptide protein  32.58 
 
 		 311 aa  118  9.999999999999999e-26  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0883  hypothetical protein  28.71 
 
 		 309 aa  115  7.999999999999999e-25  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.00462477  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30840  hypothetical protein  31.69 
 
 		 294 aa  114  2.0000000000000002e-24  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.856206  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4501  MetA-pathway phenol degradation-like protein  29.79 
 
 		 295 aa  113  4.0000000000000004e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5460  hypothetical protein  30.45 
 
 		 296 aa  111  2.0000000000000002e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32260  signal peptide protein  29.15 
 
 		 303 aa  109  7.000000000000001e-23  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3157  meta-pathway phenol degradation-like protein  29.49 
 
 		 295 aa  108  9.000000000000001e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2955  meta-pathway phenol degradation-like protein  30.53 
 
 		 300 aa  108  9.000000000000001e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.148613  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08780  hypothetical protein  29.41 
 
 		 268 aa  107  3e-22  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.299934  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4890  hypothetical protein  30.31 
 
 		 312 aa  107  3e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1377  MetA-pathway phenol degradation-like protein  31.92 
 
 		 324 aa  107  3e-22  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.351343  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3274  hypothetical protein  30.31 
 
 		 312 aa  107  3e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0193485 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6917  hypothetical protein  30.31 
 
 		 312 aa  106  4e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1588  hypothetical protein  31.25 
 
 		 320 aa  103  3e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.232894  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6407  hypothetical protein  29.53 
 
 		 312 aa  102  6e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.579544 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3195  hypothetical protein  27.05 
 
 		 313 aa  102  7e-21  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6119  hypothetical protein  29.53 
 
 		 312 aa  101  1e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4267  hypothetical protein  27.14 
 
 		 297 aa  101  1e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1833  putative signal peptide protein  29.05 
 
 		 297 aa  100  3e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.714906  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0164  hypothetical protein  30.07 
 
 		 306 aa  97.8  2e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.433262  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6101  putative lipoprotein  26.73 
 
 		 316 aa  92  9e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.540128  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70300  putative enzyme  26.88 
 
 		 316 aa  91.3  2e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3839  regulation of phenolics degradation protein  31.7 
 
 		 298 aa  90.5  3e-17  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0190  hypothetical protein  23.64 
 
 		 307 aa  89.4  7e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4832  hypothetical protein  27.39 
 
 		 304 aa  84.7  0.000000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.922561 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2845  phenol degradation-like protein  26.26 
 
 		 306 aa  84.3  0.000000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3168  hypothetical protein  25.31 
 
 		 315 aa  81.3  0.00000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4488  protein involved in meta-pathway of phenol degradation  27.33 
 
 		 302 aa  79.3  0.00000000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.796292  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1931  hypothetical protein  25.65 
 
 		 327 aa  79.3  0.00000000000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.903227  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1728  hypothetical protein  27.13 
 
 		 334 aa  78.6  0.0000000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000180313 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2127  phenol degradation-like protein  23.18 
 
 		 307 aa  74.3  0.000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5144  hypothetical protein  27.36 
 
 		 331 aa  74.3  0.000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.62916  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2098  hypothetical protein  26.64 
 
 		 269 aa  72.4  0.000000000009  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.591796  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0632  meta-pathway phenol degradation-like protein  22.61 
 
 		 316 aa  70.1  0.00000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1047  MetA-pathway of phenol degradation-like protein  26.79 
 
 		 307 aa  66.6  0.0000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.379936 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0608  hypothetical protein  27.72 
 
 		 330 aa  64.3  0.000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3122  hypothetical protein  25.16 
 
 		 326 aa  63.9  0.000000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2763  hypothetical protein  23.19 
 
 		 301 aa  63.2  0.000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33380  hypothetical protein  24.77 
 
 		 306 aa  62.8  0.000000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.72965  normal  0.084061 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1956  hypothetical protein  24.32 
 
 		 322 aa  62.8  0.000000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.235366  hitchhiker  0.00028826 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3413  hypothetical protein  28.28 
 
 		 328 aa  62.8  0.000000008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.591496  normal  0.708141 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_32640  hypothetical protein  22.81 
 
 		 303 aa  61.2  0.00000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00101125  hitchhiker  0.00152263 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8068  hypothetical protein  25.91 
 
 		 341 aa  57.8  0.0000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1191  hypothetical protein  25 
 
 		 350 aa  57.8  0.0000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.161242  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0295  hypothetical protein  27.66 
 
 		 256 aa  57.4  0.0000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000520717 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6775  protein involved in MetA-pathway of phenol degradation-like protein  26.27 
 
 		 318 aa  57  0.0000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.617497 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5489  protein involved in MetA-pathway of phenol degradation-like  26.27 
 
 		 318 aa  57  0.0000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6363  MetA-pathway-like protein  27.57 
 
 		 318 aa  56.6  0.0000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2838  hypothetical protein  22.9 
 
 		 306 aa  56.6  0.0000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7181  protein involved in meta-pathway of phenol degradation-like  25.65 
 
 		 318 aa  56.6  0.0000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0516478 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0531  hypothetical protein  26.28 
 
 		 345 aa  55.1  0.000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6305  protein involved in MetA-pathway of phenol degradation-like protein  24.71 
 
 		 319 aa  52.8  0.000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.477506  normal  0.244867 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6009  protein involved in MetA-pathway of phenol degradation-like protein  24.9 
 
 		 319 aa  52.4  0.000009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1676  hypothetical protein  24.89 
 
 		 328 aa  52  0.00001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.275603  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5224  hypothetical protein  24.84 
 
 		 322 aa  51.6  0.00002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.347235 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1768  meta-pathway phenol degradation-like protein  25.53 
 
 		 316 aa  51.2  0.00002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7148  protein involved in meta-pathway of phenol degradation  25.42 
 
 		 304 aa  49.7  0.00006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.00536985  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1272  meta-pathway phenol degradation-like protein  25.26 
 
 		 325 aa  48.9  0.00009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2732  putative signal peptide  27.68 
 
 		 315 aa  48.9  0.0001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.235663  normal  0.493951 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6752  hypothetical protein  23.57 
 
 		 337 aa  47.8  0.0002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00609082 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3846  hypothetical protein  26.79 
 
 		 334 aa  47.4  0.0003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2795  hypothetical protein  24.12 
 
 		 327 aa  47  0.0004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0092  hypothetical protein  25.22 
 
 		 334 aa  46.2  0.0006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.672977  normal  0.778879 
 
 
-
 
NC_003296  RS05192  putative signal peptide protein  23.81 
 
 		 319 aa  45.8  0.001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.00268581  normal  0.960066 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1376  meta-pathway phenol degradation protein  26.67 
 
 		 309 aa  44.7  0.002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.768311 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2388  hypothetical protein  27.33 
 
 		 310 aa  44.7  0.002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.806824 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5600  hypothetical protein  28.46 
 
 		 383 aa  44.7  0.002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  unclonable  0.00091534  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4536  phenol degradation protein  21.84 
 
 		 318 aa  43.5  0.004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.375555  normal  0.225823 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>