34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyr_0005 on replicon NC_007005
Organism: Pseudomonas syringae pv. syringae B728a



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007005  Psyr_0005  hypothetical protein  100 
 
 		 295 aa  608  1e-173  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.489422  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2725  meta-pathway phenol degradation-like protein  47.64 
 
 		 288 aa  266  2e-70  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6259  hypothetical protein  41.9 
 
 		 298 aa  230  2e-59  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.486413 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6545  hypothetical protein  41.9 
 
 		 297 aa  231  2e-59  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.688518  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3351  hypothetical protein  41.33 
 
 		 293 aa  227  2e-58  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0824985  normal  0.65514 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3232  hypothetical protein  40.61 
 
 		 297 aa  225  7e-58  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.389417  normal  0.383811 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4081  hypothetical protein  39.93 
 
 		 298 aa  221  9.999999999999999e-57  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4285  hypothetical protein  39.93 
 
 		 298 aa  221  9.999999999999999e-57  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.46217  normal  0.974652 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2099  putative signal peptide  41.76 
 
 		 296 aa  215  7e-55  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  decreased coverage  0.00558021  normal  0.7383 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4520  putative signal peptide  38.54 
 
 		 298 aa  206  4e-52  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.732087 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1158  putative signal peptide  40.66 
 
 		 298 aa  204  1e-51  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1460  putative signal peptide  38.66 
 
 		 306 aa  194  1e-48  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  decreased coverage  0.00422609  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3429  putative signal peptide  36.56 
 
 		 312 aa  184  2.0000000000000003e-45  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5137  hypothetical protein  40.38 
 
 		 282 aa  175  7e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.510015 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1344  putative signal peptide  35.76 
 
 		 294 aa  170  3e-41  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5058  putative signal peptide  35.67 
 
 		 323 aa  166  5.9999999999999996e-40  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0192886  normal  0.0905657 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3246  putative signal peptide  33 
 
 		 296 aa  160  2e-38  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.620994 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0548  hypothetical protein  42.76 
 
 		 152 aa  121  9.999999999999999e-27  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0826434  hitchhiker  0.00673364 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1259  conserved hypothetical protein; putative signal peptide  26.57 
 
 		 315 aa  116  3.9999999999999997e-25  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0181867 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3742  putative phenol degradation enzyme  28.47 
 
 		 287 aa  105  7e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2000  putative signal peptide  27.17 
 
 		 291 aa  104  2e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3016  phenol degradation enzyme  28.1 
 
 		 287 aa  102  9e-21  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2846  hypothetical protein  27.82 
 
 		 288 aa  100  2e-20  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15280  hypothetical protein  27.37 
 
 		 298 aa  75.1  0.000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0013273  hitchhiker  0.000000000000157451 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1344  hypothetical protein  27.37 
 
 		 298 aa  73.9  0.000000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.43261  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0551  hypothetical protein  37.82 
 
 		 151 aa  72.4  0.000000000009  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0319027  normal  0.148595 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2001  hypothetical protein  26.13 
 
 		 296 aa  68.6  0.0000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.949569  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08780  hypothetical protein  25.77 
 
 		 268 aa  52  0.00001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.299934  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1758  hypothetical protein  22.8 
 
 		 306 aa  48.9  0.0001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.404134  normal  0.0201554 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1088  hypothetical protein  23.88 
 
 		 285 aa  48.9  0.0001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.454901 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0486  hypothetical protein  27.48 
 
 		 201 aa  47.8  0.0002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0628681  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0207  hypothetical protein  32.43 
 
 		 326 aa  45.8  0.0008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.311208 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33380  hypothetical protein  23.26 
 
 		 306 aa  44.7  0.002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.72965  normal  0.084061 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2838  hypothetical protein  24.15 
 
 		 306 aa  43.5  0.004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>