25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpe_B0551 on replicon NC_008826
Organism: Methylibium petroleiphilum PM1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008826  Mpe_B0551  hypothetical protein  100 
 
 		 151 aa  302  1.0000000000000001e-81  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0319027  normal  0.148595 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1460  putative signal peptide  64.55 
 
 		 306 aa  149  8.999999999999999e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  decreased coverage  0.00422609  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3429  putative signal peptide  55.3 
 
 		 312 aa  145  2.0000000000000003e-34  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4520  putative signal peptide  54.78 
 
 		 298 aa  126  1.0000000000000001e-28  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.732087 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1158  putative signal peptide  50.43 
 
 		 298 aa  119  9.999999999999999e-27  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3351  hypothetical protein  48.25 
 
 		 293 aa  109  2.0000000000000002e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0824985  normal  0.65514 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2099  putative signal peptide  50 
 
 		 296 aa  109  2.0000000000000002e-23  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  decreased coverage  0.00558021  normal  0.7383 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3246  putative signal peptide  42.74 
 
 		 296 aa  87.4  6e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.620994 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1259  conserved hypothetical protein; putative signal peptide  42.86 
 
 		 315 aa  87  8e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0181867 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2725  meta-pathway phenol degradation-like protein  40 
 
 		 288 aa  82  0.000000000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3232  hypothetical protein  36.23 
 
 		 297 aa  80.9  0.000000000000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.389417  normal  0.383811 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4285  hypothetical protein  36.23 
 
 		 298 aa  80.5  0.000000000000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.46217  normal  0.974652 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4081  hypothetical protein  36.23 
 
 		 298 aa  80.5  0.000000000000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6545  hypothetical protein  38.89 
 
 		 297 aa  79.7  0.00000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.688518  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6259  hypothetical protein  38.89 
 
 		 298 aa  79.7  0.00000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.486413 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1344  putative signal peptide  39.01 
 
 		 294 aa  75.9  0.0000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2000  putative signal peptide  36.69 
 
 		 291 aa  73.2  0.000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5058  putative signal peptide  39.26 
 
 		 323 aa  73.2  0.000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0192886  normal  0.0905657 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0005  hypothetical protein  36.76 
 
 		 295 aa  72  0.000000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.489422  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2846  hypothetical protein  34.82 
 
 		 288 aa  64.7  0.0000000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3742  putative phenol degradation enzyme  34.23 
 
 		 287 aa  63.2  0.000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3016  phenol degradation enzyme  34.23 
 
 		 287 aa  63.2  0.000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5137  hypothetical protein  50.91 
 
 		 282 aa  58.2  0.00000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.510015 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15280  hypothetical protein  32.17 
 
 		 298 aa  52.8  0.000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0013273  hitchhiker  0.000000000000157451 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1344  hypothetical protein  30.7 
 
 		 298 aa  51.2  0.000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.43261  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>