28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpop_1259 on replicon NC_010725
Organism: Methylobacterium populi BJ001



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010725  Mpop_1259  conserved hypothetical protein; putative signal peptide  100 
 
 		 315 aa  634    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0181867 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3246  putative signal peptide  37.41 
 
 		 296 aa  211  1e-53  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.620994 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1344  putative signal peptide  38.11 
 
 		 294 aa  200  3e-50  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4520  putative signal peptide  39.08 
 
 		 298 aa  189  5.999999999999999e-47  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.732087 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5058  putative signal peptide  33.91 
 
 		 323 aa  185  9e-46  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0192886  normal  0.0905657 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1460  putative signal peptide  39.34 
 
 		 306 aa  179  5.999999999999999e-44  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  decreased coverage  0.00422609  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1158  putative signal peptide  35.23 
 
 		 298 aa  164  1.0000000000000001e-39  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3351  hypothetical protein  35.13 
 
 		 293 aa  160  3e-38  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0824985  normal  0.65514 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2099  putative signal peptide  34.05 
 
 		 296 aa  154  2e-36  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  decreased coverage  0.00558021  normal  0.7383 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3429  putative signal peptide  37.19 
 
 		 312 aa  150  3e-35  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6545  hypothetical protein  30.95 
 
 		 297 aa  126  6e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.688518  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3016  phenol degradation enzyme  30.88 
 
 		 287 aa  125  1e-27  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6259  hypothetical protein  30.1 
 
 		 298 aa  124  1e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.486413 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5137  hypothetical protein  34.56 
 
 		 282 aa  124  2e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.510015 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2725  meta-pathway phenol degradation-like protein  28.82 
 
 		 288 aa  124  3e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3742  putative phenol degradation enzyme  30.88 
 
 		 287 aa  123  4e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4285  hypothetical protein  29.64 
 
 		 298 aa  122  6e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.46217  normal  0.974652 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3232  hypothetical protein  30.14 
 
 		 297 aa  122  6e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.389417  normal  0.383811 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4081  hypothetical protein  29.64 
 
 		 298 aa  122  6e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0005  hypothetical protein  25.26 
 
 		 295 aa  118  9.999999999999999e-26  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.489422  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2000  putative signal peptide  27.6 
 
 		 291 aa  118  9.999999999999999e-26  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2846  hypothetical protein  27.24 
 
 		 288 aa  110  4.0000000000000004e-23  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0551  hypothetical protein  43.59 
 
 		 151 aa  87.4  3e-16  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0319027  normal  0.148595 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0548  hypothetical protein  29.61 
 
 		 152 aa  67.8  0.0000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0826434  hitchhiker  0.00673364 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15280  hypothetical protein  26.22 
 
 		 298 aa  61.2  0.00000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0013273  hitchhiker  0.000000000000157451 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1344  hypothetical protein  24.15 
 
 		 298 aa  60.5  0.00000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.43261  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0486  hypothetical protein  29.53 
 
 		 201 aa  49.7  0.00007  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0628681  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2001  hypothetical protein  22.38 
 
 		 296 aa  43.5  0.004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.949569  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>