30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_5137 on replicon NC_009507
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009507  Swit_5137  hypothetical protein  100 
 
 		 282 aa  579  1e-164  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.510015 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1460  putative signal peptide  57.94 
 
 		 306 aa  254  1.0000000000000001e-66  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  decreased coverage  0.00422609  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3351  hypothetical protein  46.44 
 
 		 293 aa  219  3e-56  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0824985  normal  0.65514 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1158  putative signal peptide  52.11 
 
 		 298 aa  215  5e-55  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3429  putative signal peptide  48.62 
 
 		 312 aa  208  6e-53  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4520  putative signal peptide  49.53 
 
 		 298 aa  209  6e-53  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.732087 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2099  putative signal peptide  47.93 
 
 		 296 aa  204  1e-51  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  decreased coverage  0.00558021  normal  0.7383 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0005  hypothetical protein  40.38 
 
 		 295 aa  175  7e-43  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.489422  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2725  meta-pathway phenol degradation-like protein  43.33 
 
 		 288 aa  158  1e-37  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1344  putative signal peptide  37.85 
 
 		 294 aa  143  3e-33  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6545  hypothetical protein  39.52 
 
 		 297 aa  142  8e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.688518  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6259  hypothetical protein  39.05 
 
 		 298 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.486413 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3232  hypothetical protein  39.52 
 
 		 297 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.389417  normal  0.383811 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0548  hypothetical protein  45.39 
 
 		 152 aa  139  6e-32  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0826434  hitchhiker  0.00673364 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4081  hypothetical protein  39.05 
 
 		 298 aa  137  2e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4285  hypothetical protein  39.05 
 
 		 298 aa  137  2e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.46217  normal  0.974652 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3246  putative signal peptide  39.17 
 
 		 296 aa  135  7.000000000000001e-31  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.620994 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1259  conserved hypothetical protein; putative signal peptide  34.56 
 
 		 315 aa  124  2e-27  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0181867 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5058  putative signal peptide  34.58 
 
 		 323 aa  122  6e-27  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0192886  normal  0.0905657 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2846  hypothetical protein  34.68 
 
 		 288 aa  119  6e-26  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2000  putative signal peptide  30.33 
 
 		 291 aa  97.1  3e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3742  putative phenol degradation enzyme  32.6 
 
 		 287 aa  85.1  0.000000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3016  phenol degradation enzyme  32.04 
 
 		 287 aa  81.6  0.00000000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15280  hypothetical protein  25.11 
 
 		 298 aa  70.5  0.00000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0013273  hitchhiker  0.000000000000157451 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1344  hypothetical protein  25.11 
 
 		 298 aa  67.8  0.0000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.43261  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1758  hypothetical protein  31.03 
 
 		 306 aa  62.8  0.000000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.404134  normal  0.0201554 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0551  hypothetical protein  50.91 
 
 		 151 aa  58.5  0.0000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0319027  normal  0.148595 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1088  hypothetical protein  30.77 
 
 		 285 aa  54.7  0.000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.454901 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2001  hypothetical protein  31.03 
 
 		 296 aa  52  0.00001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.949569  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0885  hypothetical protein  24.86 
 
 		 296 aa  48.5  0.0001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.00140795  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>