32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSP_3016 on replicon NC_007494
Organism: Rhodobacter sphaeroides 2.4.1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007494  RSP_3016  phenol degradation enzyme  100 
 
 		 287 aa  573  1.0000000000000001e-162  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3742  putative phenol degradation enzyme  99.3 
 
 		 287 aa  568  1e-161  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4520  putative signal peptide  35.49 
 
 		 298 aa  152  5.9999999999999996e-36  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.732087 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1158  putative signal peptide  34.41 
 
 		 298 aa  144  1e-33  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3351  hypothetical protein  34.3 
 
 		 293 aa  140  1.9999999999999998e-32  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0824985  normal  0.65514 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5058  putative signal peptide  32.19 
 
 		 323 aa  137  1e-31  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0192886  normal  0.0905657 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1259  conserved hypothetical protein; putative signal peptide  31.65 
 
 		 315 aa  132  5e-30  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0181867 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1344  putative signal peptide  33.57 
 
 		 294 aa  131  1.0000000000000001e-29  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1460  putative signal peptide  31.97 
 
 		 306 aa  129  5.0000000000000004e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  decreased coverage  0.00422609  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3246  putative signal peptide  31.76 
 
 		 296 aa  125  1e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.620994 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2725  meta-pathway phenol degradation-like protein  31.29 
 
 		 288 aa  117  3e-25  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2099  putative signal peptide  30.22 
 
 		 296 aa  113  3e-24  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  decreased coverage  0.00558021  normal  0.7383 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0005  hypothetical protein  27.92 
 
 		 295 aa  103  2e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.489422  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3232  hypothetical protein  26.94 
 
 		 297 aa  96.7  4e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.389417  normal  0.383811 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4285  hypothetical protein  26.94 
 
 		 298 aa  95.9  6e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.46217  normal  0.974652 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4081  hypothetical protein  26.94 
 
 		 298 aa  95.9  6e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2000  putative signal peptide  27.43 
 
 		 291 aa  90.1  4e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6545  hypothetical protein  26.22 
 
 		 297 aa  88.6  1e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.688518  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6259  hypothetical protein  26.22 
 
 		 298 aa  88.2  1e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.486413 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3429  putative signal peptide  26.83 
 
 		 312 aa  85.9  7e-16  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5137  hypothetical protein  32.04 
 
 		 282 aa  82  0.000000000000009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.510015 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2846  hypothetical protein  26.07 
 
 		 288 aa  77.4  0.0000000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0551  hypothetical protein  36.52 
 
 		 151 aa  72  0.00000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0319027  normal  0.148595 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15280  hypothetical protein  24.82 
 
 		 298 aa  61.6  0.00000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0013273  hitchhiker  0.000000000000157451 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1344  hypothetical protein  24.45 
 
 		 298 aa  57.4  0.0000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.43261  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1758  hypothetical protein  26.07 
 
 		 306 aa  54.3  0.000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.404134  normal  0.0201554 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0548  hypothetical protein  27.04 
 
 		 152 aa  51.6  0.00002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0826434  hitchhiker  0.00673364 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1833  putative signal peptide protein  34.57 
 
 		 297 aa  49.7  0.00006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.714906  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3157  meta-pathway phenol degradation-like protein  36.11 
 
 		 295 aa  48.5  0.0001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2001  hypothetical protein  24.52 
 
 		 296 aa  45.8  0.0009  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.949569  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1088  hypothetical protein  27.81 
 
 		 285 aa  45.4  0.001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.454901 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0486  hypothetical protein  24.46 
 
 		 201 aa  43.5  0.004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0628681  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>