30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spea_2001 on replicon NC_009901
Organism: Shewanella pealeana ATCC 700345



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009901  Spea_2001  hypothetical protein  100 
 
 		 296 aa  616  1e-175  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.949569  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1758  hypothetical protein  36.27 
 
 		 306 aa  206  3e-52  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.404134  normal  0.0201554 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0885  hypothetical protein  31.58 
 
 		 296 aa  186  3e-46  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.00140795  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1088  hypothetical protein  31.34 
 
 		 285 aa  170  2e-41  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.454901 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0207  hypothetical protein  31.34 
 
 		 326 aa  147  2.0000000000000003e-34  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.311208 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2846  hypothetical protein  25.67 
 
 		 288 aa  93.6  4e-18  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2000  putative signal peptide  23.36 
 
 		 291 aa  80.9  0.00000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0005  hypothetical protein  26.13 
 
 		 295 aa  68.6  0.0000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.489422  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6545  hypothetical protein  25.71 
 
 		 297 aa  67.4  0.0000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.688518  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6259  hypothetical protein  25.71 
 
 		 298 aa  67  0.0000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.486413 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0548  hypothetical protein  36.15 
 
 		 152 aa  65.9  0.0000000009  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0826434  hitchhiker  0.00673364 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4285  hypothetical protein  25.17 
 
 		 298 aa  62  0.00000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.46217  normal  0.974652 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4081  hypothetical protein  25.17 
 
 		 298 aa  62  0.00000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3232  hypothetical protein  24.83 
 
 		 297 aa  60.8  0.00000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.389417  normal  0.383811 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2099  putative signal peptide  35.9 
 
 		 296 aa  61.2  0.00000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  decreased coverage  0.00558021  normal  0.7383 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2725  meta-pathway phenol degradation-like protein  24.15 
 
 		 288 aa  60.5  0.00000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1460  putative signal peptide  24.9 
 
 		 306 aa  57.8  0.0000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  decreased coverage  0.00422609  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3351  hypothetical protein  30.5 
 
 		 293 aa  55.8  0.0000008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0824985  normal  0.65514 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15280  hypothetical protein  23.7 
 
 		 298 aa  53.1  0.000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0013273  hitchhiker  0.000000000000157451 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5137  hypothetical protein  31.03 
 
 		 282 aa  52  0.00001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.510015 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3246  putative signal peptide  24.1 
 
 		 296 aa  52  0.00001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.620994 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1344  hypothetical protein  24.6 
 
 		 298 aa  50.8  0.00003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.43261  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4520  putative signal peptide  36.36 
 
 		 298 aa  47.8  0.0003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.732087 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3429  putative signal peptide  20.91 
 
 		 312 aa  47.4  0.0003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5058  putative signal peptide  27.88 
 
 		 323 aa  47  0.0004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0192886  normal  0.0905657 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3846  hypothetical protein  24.16 
 
 		 334 aa  45.1  0.002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1259  conserved hypothetical protein; putative signal peptide  22.38 
 
 		 315 aa  43.9  0.003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0181867 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1344  putative signal peptide  25.29 
 
 		 294 aa  43.5  0.004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1158  putative signal peptide  32.29 
 
 		 298 aa  42.4  0.008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0092  hypothetical protein  22.47 
 
 		 334 aa  42.7  0.008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.672977  normal  0.778879 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>