23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnuc_0885 on replicon NC_009379
Organism: Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009379  Pnuc_0885  hypothetical protein  100 
 
 
296 aa  600  1.0000000000000001e-171  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.00140795  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2001  hypothetical protein  31.58 
 
 
296 aa  186  3e-46  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.949569  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1758  hypothetical protein  34.21 
 
 
306 aa  180  2.9999999999999997e-44  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.404134  normal  0.0201554 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1088  hypothetical protein  36.65 
 
 
285 aa  175  9.999999999999999e-43  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.454901 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0207  hypothetical protein  29.55 
 
 
326 aa  129  8.000000000000001e-29  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.311208 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3429  putative signal peptide  27.8 
 
 
312 aa  74.3  0.000000000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2846  hypothetical protein  27.27 
 
 
288 aa  73.2  0.000000000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2000  putative signal peptide  26.19 
 
 
291 aa  67.8  0.0000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6545  hypothetical protein  26.84 
 
 
297 aa  57  0.0000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.688518  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3246  putative signal peptide  28.65 
 
 
296 aa  57.4  0.0000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.620994 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6259  hypothetical protein  26.84 
 
 
298 aa  57  0.0000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.486413 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3232  hypothetical protein  26.27 
 
 
297 aa  56.6  0.0000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.389417  normal  0.383811 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4285  hypothetical protein  26.27 
 
 
298 aa  56.2  0.0000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.46217  normal  0.974652 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4081  hypothetical protein  26.27 
 
 
298 aa  56.2  0.0000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1460  putative signal peptide  25.53 
 
 
306 aa  54.3  0.000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  decreased coverage  0.00422609  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15280  hypothetical protein  22.73 
 
 
298 aa  53.9  0.000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0013273  hitchhiker  0.000000000000157451 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1344  hypothetical protein  22.48 
 
 
298 aa  53.1  0.000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.43261  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5137  hypothetical protein  24.86 
 
 
282 aa  48.5  0.0001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.510015 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3351  hypothetical protein  26.47 
 
 
293 aa  47.8  0.0002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0824985  normal  0.65514 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2725  meta-pathway phenol degradation-like protein  23.5 
 
 
288 aa  47.4  0.0003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5058  putative signal peptide  25.3 
 
 
323 aa  45.8  0.0009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0192886  normal  0.0905657 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1344  putative signal peptide  27.27 
 
 
294 aa  45.1  0.002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0548  hypothetical protein  27.72 
 
 
152 aa  43.5  0.004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0826434  hitchhiker  0.00673364 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>