32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_1344 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009720  Xaut_1344  putative signal peptide  100 
 
 		 294 aa  590  1e-168  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5058  putative signal peptide  73.33 
 
 		 323 aa  434  1e-120  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0192886  normal  0.0905657 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3246  putative signal peptide  41.08 
 
 		 296 aa  227  1e-58  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.620994 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4520  putative signal peptide  40.41 
 
 		 298 aa  220  1.9999999999999999e-56  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.732087 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1460  putative signal peptide  44.61 
 
 		 306 aa  209  3e-53  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  decreased coverage  0.00422609  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1158  putative signal peptide  39.78 
 
 		 298 aa  203  2e-51  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1259  conserved hypothetical protein; putative signal peptide  38.43 
 
 		 315 aa  199  3e-50  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0181867 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3429  putative signal peptide  39.93 
 
 		 312 aa  187  1e-46  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3351  hypothetical protein  37.23 
 
 		 293 aa  175  9e-43  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0824985  normal  0.65514 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0005  hypothetical protein  35.76 
 
 		 295 aa  170  3e-41  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.489422  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2099  putative signal peptide  33.81 
 
 		 296 aa  154  2e-36  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  decreased coverage  0.00558021  normal  0.7383 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2725  meta-pathway phenol degradation-like protein  33.33 
 
 		 288 aa  147  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5137  hypothetical protein  37.85 
 
 		 282 aa  143  3e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.510015 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6545  hypothetical protein  33.92 
 
 		 297 aa  139  4.999999999999999e-32  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.688518  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6259  hypothetical protein  33.92 
 
 		 298 aa  139  4.999999999999999e-32  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.486413 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3232  hypothetical protein  31.94 
 
 		 297 aa  132  9e-30  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.389417  normal  0.383811 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3742  putative phenol degradation enzyme  33.95 
 
 		 287 aa  130  2.0000000000000002e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4285  hypothetical protein  31.6 
 
 		 298 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.46217  normal  0.974652 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3016  phenol degradation enzyme  33.58 
 
 		 287 aa  127  2.0000000000000002e-28  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4081  hypothetical protein  31.6 
 
 		 298 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2000  putative signal peptide  31.1 
 
 		 291 aa  123  3e-27  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2846  hypothetical protein  32.02 
 
 		 288 aa  123  4e-27  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0548  hypothetical protein  36.18 
 
 		 152 aa  97.8  2e-19  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0826434  hitchhiker  0.00673364 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15280  hypothetical protein  29.86 
 
 		 298 aa  96.7  4e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0013273  hitchhiker  0.000000000000157451 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1344  hypothetical protein  29.14 
 
 		 298 aa  92  1e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.43261  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1758  hypothetical protein  27.37 
 
 		 306 aa  72.8  0.000000000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.404134  normal  0.0201554 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0551  hypothetical protein  41.74 
 
 		 151 aa  72  0.00000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0319027  normal  0.148595 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1088  hypothetical protein  27.52 
 
 		 285 aa  63.9  0.000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.454901 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0486  hypothetical protein  31.54 
 
 		 201 aa  56.6  0.0000004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0628681  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0883  hypothetical protein  26.32 
 
 		 309 aa  45.1  0.001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.00462477  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0885  hypothetical protein  27.27 
 
 		 296 aa  45.1  0.002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.00140795  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2001  hypothetical protein  25.29 
 
 		 296 aa  43.5  0.004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.949569  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>