31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msil_3429 on replicon NC_011666
Organism: Methylocella silvestris BL2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011666  Msil_3429  putative signal peptide  100 
 
 		 312 aa  635    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1460  putative signal peptide  55.19 
 
 		 306 aa  298  9e-80  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  decreased coverage  0.00422609  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4520  putative signal peptide  46.46 
 
 		 298 aa  259  3e-68  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.732087 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3351  hypothetical protein  44.53 
 
 		 293 aa  237  2e-61  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0824985  normal  0.65514 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1158  putative signal peptide  43.53 
 
 		 298 aa  233  4.0000000000000004e-60  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2099  putative signal peptide  46.04 
 
 		 296 aa  227  2e-58  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  decreased coverage  0.00558021  normal  0.7383 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5137  hypothetical protein  48.62 
 
 		 282 aa  208  7e-53  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.510015 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1344  putative signal peptide  39.93 
 
 		 294 aa  187  1e-46  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0005  hypothetical protein  36.56 
 
 		 295 aa  184  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.489422  normal  1 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0548  hypothetical protein  51.97 
 
 		 152 aa  172  5e-42  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0826434  hitchhiker  0.00673364 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2725  meta-pathway phenol degradation-like protein  38.04 
 
 		 288 aa  171  1e-41  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3246  putative signal peptide  37.98 
 
 		 296 aa  170  3e-41  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.620994 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6259  hypothetical protein  35.77 
 
 		 298 aa  158  9e-38  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.486413 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6545  hypothetical protein  35.77 
 
 		 297 aa  158  1e-37  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.688518  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3232  hypothetical protein  35.77 
 
 		 297 aa  155  8e-37  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.389417  normal  0.383811 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4285  hypothetical protein  35.4 
 
 		 298 aa  151  1e-35  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.46217  normal  0.974652 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4081  hypothetical protein  35.4 
 
 		 298 aa  151  1e-35  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1259  conserved hypothetical protein; putative signal peptide  37.19 
 
 		 315 aa  150  4e-35  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0181867 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5058  putative signal peptide  33.9 
 
 		 323 aa  148  9e-35  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0192886  normal  0.0905657 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0551  hypothetical protein  57.63 
 
 		 151 aa  139  3.9999999999999997e-32  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0319027  normal  0.148595 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2846  hypothetical protein  30.51 
 
 		 288 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2000  putative signal peptide  29.7 
 
 		 291 aa  107  3e-22  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3742  putative phenol degradation enzyme  25.81 
 
 		 287 aa  82.8  0.000000000000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15280  hypothetical protein  25.09 
 
 		 298 aa  80.1  0.00000000000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0013273  hitchhiker  0.000000000000157451 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3016  phenol degradation enzyme  25.45 
 
 		 287 aa  79.7  0.00000000000006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1344  hypothetical protein  25.09 
 
 		 298 aa  77.8  0.0000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.43261  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0885  hypothetical protein  27.8 
 
 		 296 aa  74.3  0.000000000003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.00140795  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1758  hypothetical protein  25.74 
 
 		 306 aa  60.1  0.00000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.404134  normal  0.0201554 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1088  hypothetical protein  24.48 
 
 		 285 aa  56.2  0.0000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.454901 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0486  hypothetical protein  26.87 
 
 		 201 aa  50.8  0.00003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0628681  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2001  hypothetical protein  20.91 
 
 		 296 aa  47.4  0.0003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.949569  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>