30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_1758 on replicon NC_007973
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007973  Rmet_1758  hypothetical protein  100 
 
 		 306 aa  622  1e-177  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.404134  normal  0.0201554 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1088  hypothetical protein  66.32 
 
 		 285 aa  400  9.999999999999999e-111  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.454901 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2001  hypothetical protein  36.27 
 
 		 296 aa  206  3e-52  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.949569  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0207  hypothetical protein  37.41 
 
 		 326 aa  194  1e-48  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.311208 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0885  hypothetical protein  34.21 
 
 		 296 aa  180  2.9999999999999997e-44  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.00140795  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2846  hypothetical protein  26.94 
 
 		 288 aa  79.3  0.00000000000007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1344  putative signal peptide  27.37 
 
 		 294 aa  72.8  0.000000000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1460  putative signal peptide  26.14 
 
 		 306 aa  69.3  0.00000000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  decreased coverage  0.00422609  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2725  meta-pathway phenol degradation-like protein  24.81 
 
 		 288 aa  67.8  0.0000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3246  putative signal peptide  26.96 
 
 		 296 aa  64.3  0.000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.620994 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5137  hypothetical protein  31.03 
 
 		 282 aa  62.8  0.000000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.510015 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5058  putative signal peptide  26.89 
 
 		 323 aa  62  0.00000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0192886  normal  0.0905657 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4520  putative signal peptide  24.83 
 
 		 298 aa  60.8  0.00000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.732087 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3429  putative signal peptide  25.74 
 
 		 312 aa  60.1  0.00000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3232  hypothetical protein  23.15 
 
 		 297 aa  60.1  0.00000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.389417  normal  0.383811 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4285  hypothetical protein  23.77 
 
 		 298 aa  59.3  0.00000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.46217  normal  0.974652 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4081  hypothetical protein  23.77 
 
 		 298 aa  59.3  0.00000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0548  hypothetical protein  27.61 
 
 		 152 aa  56.6  0.0000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0826434  hitchhiker  0.00673364 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6545  hypothetical protein  23 
 
 		 297 aa  56.6  0.0000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.688518  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3351  hypothetical protein  26.34 
 
 		 293 aa  56.6  0.0000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0824985  normal  0.65514 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6259  hypothetical protein  23 
 
 		 298 aa  56.2  0.0000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.486413 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3742  putative phenol degradation enzyme  25.79 
 
 		 287 aa  52.4  0.000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2099  putative signal peptide  31.3 
 
 		 296 aa  52.4  0.00001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  decreased coverage  0.00558021  normal  0.7383 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1158  putative signal peptide  26.29 
 
 		 298 aa  50.8  0.00003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3016  phenol degradation enzyme  25.4 
 
 		 287 aa  49.7  0.00006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0005  hypothetical protein  22.8 
 
 		 295 aa  48.9  0.0001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.489422  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2000  putative signal peptide  24.37 
 
 		 291 aa  47  0.0004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2896  RND efflux system outer membrane lipoprotein  33.86 
 
 		 477 aa  44.7  0.002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3157  meta-pathway phenol degradation-like protein  27.27 
 
 		 295 aa  44.3  0.003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6009  protein involved in MetA-pathway of phenol degradation-like protein  22.92 
 
 		 319 aa  42.4  0.01  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>