16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acry_0486 on replicon NC_009484
Organism: Acidiphilium cryptum JF-5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009484  Acry_0486  hypothetical protein  100 
 
 		 201 aa  404  1.0000000000000001e-112  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0628681  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5058  putative signal peptide  31.98 
 
 		 323 aa  76.6  0.0000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0192886  normal  0.0905657 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4520  putative signal peptide  29.1 
 
 		 298 aa  60.8  0.00000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.732087 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1158  putative signal peptide  28.36 
 
 		 298 aa  61.2  0.00000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6545  hypothetical protein  27.66 
 
 		 297 aa  56.6  0.0000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.688518  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1344  putative signal peptide  31.54 
 
 		 294 aa  56.6  0.0000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6259  hypothetical protein  27.66 
 
 		 298 aa  56.6  0.0000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.486413 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1460  putative signal peptide  27.82 
 
 		 306 aa  55.5  0.0000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  decreased coverage  0.00422609  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4081  hypothetical protein  27.66 
 
 		 298 aa  53.9  0.000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4285  hypothetical protein  27.66 
 
 		 298 aa  53.9  0.000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.46217  normal  0.974652 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3246  putative signal peptide  26.92 
 
 		 296 aa  53.9  0.000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.620994 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3232  hypothetical protein  27.66 
 
 		 297 aa  53.9  0.000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.389417  normal  0.383811 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3429  putative signal peptide  26.87 
 
 		 312 aa  50.4  0.00002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1259  conserved hypothetical protein; putative signal peptide  29.53 
 
 		 315 aa  49.3  0.00004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0181867 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0005  hypothetical protein  27.48 
 
 		 295 aa  47.4  0.0001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.489422  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2725  meta-pathway phenol degradation-like protein  26.62 
 
 		 288 aa  46.6  0.0003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>