264 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_5869 on replicon NC_011988
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011988  Avi_5869  Allophanate hydrolase subunit 1  100 
 
 		 291 aa  606  9.999999999999999e-173  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.495941  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2438  allophanate hydrolase subunit 1  76.39 
 
 		 289 aa  479  1e-134  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.549141  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3256  allophanate hydrolase subunit 1  66.78 
 
 		 291 aa  425  1e-118  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.350388  normal  0.431322 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0363  allophanate hydrolase, subunit 1  64.6 
 
 		 291 aa  410  1e-114  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1883  allophanate hydrolase, subunit 1  64.6 
 
 		 291 aa  410  1e-114  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1720  allophanate hydrolase, subunit 1  64.6 
 
 		 291 aa  410  1e-114  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0127  allophanate hydrolase subunit 1  64.58 
 
 		 294 aa  412  1e-114  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.821991  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2159  allophanate hydrolase, subunit 1  64.6 
 
 		 291 aa  410  1e-114  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0896  allophanate hydrolase, subunit 1  64.6 
 
 		 291 aa  410  1e-114  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1182  allophanate hydrolase, subunit 1  64.6 
 
 		 291 aa  410  1e-114  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0271  allophanate hydrolase, subunit 1  64.26 
 
 		 291 aa  409  1e-113  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0008  allophanate hydrolase subunit 1  63.23 
 
 		 303 aa  399  9.999999999999999e-111  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2954  allophanate hydrolase subunit 1  66.32 
 
 		 291 aa  400  9.999999999999999e-111  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.975999 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2771  allophanate hydrolase subunit 1  64.34 
 
 		 295 aa  398  9.999999999999999e-111  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4580  allophanate hydrolase subunit 1  63.19 
 
 		 311 aa  400  9.999999999999999e-111  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.632087  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2921  allophanate hydrolase subunit 1  63.99 
 
 		 313 aa  397  1e-109  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0366  allophanate hydrolase subunit 1  64.48 
 
 		 291 aa  395  1e-109  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.111698  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2861  allophanate hydrolase subunit 1  63.64 
 
 		 295 aa  397  1e-109  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.107171  normal  0.480296 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2721  hypothetical protein  63.29 
 
 		 290 aa  393  1e-108  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.919225  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2478  Allophanate hydrolase subunit 1  63.67 
 
 		 294 aa  392  1e-108  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2935  hypothetical protein  63.29 
 
 		 290 aa  390  1e-107  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.19158  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6283  allophanate hydrolase subunit 1  64.6 
 
 		 291 aa  390  1e-107  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.115287  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2382  Allophanate hydrolase subunit 1  63.19 
 
 		 293 aa  389  1e-107  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06460  hypothetical protein  61.67 
 
 		 292 aa  386  1e-106  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000360881  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2119  allophanate hydrolase subunit 1  62.94 
 
 		 295 aa  386  1e-106  Pseudomonas putida W619  Bacteria  decreased coverage  0.00766127  normal  0.384729 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0598  hypothetical protein  60.63 
 
 		 292 aa  381  1e-105  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4043  Allophanate hydrolase subunit 1  48.04 
 
 		 300 aa  289  3e-77  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.797104  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1574  Urea carboxylase  28.99 
 
 		 321 aa  108  1e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.96958  normal  0.273828 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4017  urea carboxylase  26.12 
 
 		 1176 aa  95.1  1e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.877001  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1595  allophanate hydrolase subunit 1  25.91 
 
 		 243 aa  93.2  5e-18  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_28452  urea amidolyase  27.21 
 
 		 1822 aa  92.8  6e-18  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.407983 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0178  Allophanate hydrolase subunit 1  28.08 
 
 		 242 aa  91.3  2e-17  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3722  urea carboxylase  26.12 
 
 		 1176 aa  91.3  2e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.848646  normal  0.673189 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0798  urea carboxylase  25.98 
 
 		 1208 aa  90.5  3e-17  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.467421  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1892  Urea carboxylase  25.81 
 
 		 1205 aa  89.7  5e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.434507  normal  0.299649 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1792  allophanate hydrolase subunit 2  26.03 
 
 		 1206 aa  89.7  5e-17  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.73882  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3669  urea amidolyase related protein  31.8 
 
 		 1234 aa  89  9e-17  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_02000  conserved hypothetical protein TIGR00370  25.58 
 
 		 242 aa  88.2  1e-16  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.620258 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1222  Urea carboxylase  26.13 
 
 		 1180 aa  87  3e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.26806  normal  1 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6517  urea carboxylase  26.21 
 
 		 1179 aa  85.9  7e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1270  Allophanate hydrolase subunit 1  25.71 
 
 		 221 aa  85.5  9e-16  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6105  urea carboxylase  26.26 
 
 		 1179 aa  85.1  0.000000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.164711  normal  0.417784 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5228  urea carboxylase  26.24 
 
 		 1203 aa  85.1  0.000000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.120809  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3888  urea amidolyase related protein  30.34 
 
 		 677 aa  84.7  0.000000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0446544  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2606  urea carboxylase  26.04 
 
 		 1172 aa  84  0.000000000000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0287573 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2304  urea carboxylase  25.53 
 
 		 1209 aa  83.2  0.000000000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.198231  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3900  urea carboxylase  26.12 
 
 		 1179 aa  83.6  0.000000000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.201135 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6430  urea carboxylase  27.08 
 
 		 1205 aa  83.2  0.000000000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.646743  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3095  allophanate hydrolase subunit 1  27.73 
 
 		 244 aa  82  0.00000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.686624  normal  0.352303 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1145  Allophanate hydrolase subunit 1  25.82 
 
 		 229 aa  81.3  0.00000000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.110827  normal  0.406689 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4531  allophanate hydrolase subunit 2  24.57 
 
 		 1183 aa  81.6  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3089  urea carboxylase  25.18 
 
 		 1204 aa  81.3  0.00000000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.176139  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0082  urea amidolyase related protein  26.02 
 
 		 539 aa  80.5  0.00000000000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0606  allophanate hydrolase subunit 2  27.34 
 
 		 1197 aa  80.5  0.00000000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0957568  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2727  biotin carboxylation domain-containing protein  27.14 
 
 		 1162 aa  80.5  0.00000000000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.321905  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0766  urea carboxylase  25.58 
 
 		 1201 aa  80.5  0.00000000000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3450  hypothetical protein  27.31 
 
 		 245 aa  80.1  0.00000000000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5558  allophanate hydrolase subunit 2  26.67 
 
 		 1205 aa  79.7  0.00000000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.453459  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5923  biotin carboxylation region  26.67 
 
 		 1205 aa  79.7  0.00000000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.559652  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1384  Urea amidolyase-related protein  26.3 
 
 		 1205 aa  79.3  0.00000000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.578782  normal  0.0177378 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2040  hypothetical protein  25.69 
 
 		 243 aa  79.3  0.00000000000008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.733064  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1588  urea carboxylase  24.56 
 
 		 1182 aa  79  0.00000000000009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4243  urea amidolyase-related protein  24.09 
 
 		 1226 aa  78.6  0.0000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1900  hypothetical protein  22.47 
 
 		 246 aa  78.2  0.0000000000001  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1358  biotin carboxylation domain-containing protein  23.27 
 
 		 1231 aa  78.2  0.0000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.306676  normal  0.336229 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2047  allophanate hydrolase subunit 1  27.72 
 
 		 244 aa  77.8  0.0000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.684193  normal  0.286348 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1527  hypothetical protein  22.47 
 
 		 246 aa  77.4  0.0000000000002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1821  biotin carboxylation domain-containing protein  25.45 
 
 		 1205 aa  77  0.0000000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.234186  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2163  urea carboxylase  25.98 
 
 		 1204 aa  77  0.0000000000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.278684  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1840  allophanate hydrolase  25.45 
 
 		 1205 aa  76.6  0.0000000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1887  biotin carboxylation domain-containing protein  25.45 
 
 		 1205 aa  76.6  0.0000000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2680  urea carboxylase  23.38 
 
 		 1200 aa  76.6  0.0000000000005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0521  Allophanate hydrolase subunit 1  26.72 
 
 		 253 aa  76.6  0.0000000000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0869  hypothetical protein  27.27 
 
 		 549 aa  76.3  0.0000000000006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0710  Allophanate hydrolase subunit 1  23.44 
 
 		 246 aa  76.3  0.0000000000006  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00179377  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1338  allophanate hydrolase subunit 2  23.16 
 
 		 1210 aa  75.5  0.0000000000009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0387482  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0943  allophanate hydrolase subunit 2  24.64 
 
 		 1212 aa  75.5  0.0000000000009  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.648902  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1419  Urea carboxylase  26.92 
 
 		 1207 aa  75.5  0.0000000000009  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2502  propionyl-coenzyme A carboxylase alpha polypeptide  24.31 
 
 		 1243 aa  75.5  0.000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1713  hypothetical protein  22.26 
 
 		 246 aa  75.1  0.000000000001  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.115565  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2958  Allophanate hydrolase subunit 1  25.42 
 
 		 242 aa  75.5  0.000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2188  allophanate hydrolase subunit 2  23.86 
 
 		 1183 aa  75.1  0.000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5847  hypothetical protein  28.03 
 
 		 541 aa  75.1  0.000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0879773  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1594  urea amidolyase related protein  28.3 
 
 		 663 aa  74.7  0.000000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3977  Urea amidolyase-related protein  26.92 
 
 		 1488 aa  74.3  0.000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3120  conserved hypothetical protein TIGR00370  23.72 
 
 		 237 aa  74.7  0.000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000284554  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1700  hypothetical protein  21.71 
 
 		 244 aa  73.6  0.000000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5380  allophanate hydrolase, putative  26.64 
 
 		 539 aa  73.9  0.000000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1666  hypothetical protein  21.71 
 
 		 244 aa  73.6  0.000000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.947071  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2502  urea carboxylase  25 
 
 		 1204 aa  73.6  0.000000000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2600  allophanate hydrolase subunit 1  29.08 
 
 		 204 aa  73.6  0.000000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1501  hypothetical protein  25.73 
 
 		 244 aa  73.6  0.000000000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.0895527 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2810  hypothetical protein  23.32 
 
 		 237 aa  72.4  0.000000000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4367  Allophanate hydrolase subunit 1  27.59 
 
 		 215 aa  72  0.000000000009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3121  hypothetical protein  23.32 
 
 		 237 aa  71.6  0.00000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.785464  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0499  Urea amidolyase-related protein  27.73 
 
 		 534 aa  71.6  0.00000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3097  hypothetical protein  23.72 
 
 		 237 aa  72  0.00000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.12026  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2393  urea carboxylase  22.3 
 
 		 1201 aa  71.6  0.00000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3102  conserved hypothetical protein TIGR00370  23.72 
 
 		 237 aa  72  0.00000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3430  allophanate hydrolase subunit 1  23.29 
 
 		 257 aa  72  0.00000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.381456  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>