More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_4062 on replicon NC_011989
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011989  Avi_4062  amidohydrolase  100 
 
 		 387 aa  790    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3897  amidohydrolase  71.69 
 
 		 387 aa  588  1e-167  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00269559 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3609  amidohydrolase  71.43 
 
 		 387 aa  582  1.0000000000000001e-165  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.752392  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2573  amidohydrolase  67.36 
 
 		 387 aa  523  1e-147  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0165265  normal  0.498174 
 
 
-
 
NC_004310  BR2037  M20/M25/M40 family peptidase  64.25 
 
 		 387 aa  509  1e-143  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.403946  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1959  M20/M25/M40 family peptidase  64.25 
 
 		 387 aa  509  1e-143  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.980827  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0901  amidohydrolase  64.08 
 
 		 387 aa  498  1e-140  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3872  hippurate hydrolase  63.05 
 
 		 387 aa  496  1e-139  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1734  peptidase M20D, amidohydrolase  61.44 
 
 		 389 aa  483  1e-135  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.169236  normal  0.0172136 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2982  putative amidohydrolase family protein  60.15 
 
 		 389 aa  475  1e-133  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0668203  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3056  amidohydrolase  63.38 
 
 		 387 aa  476  1e-133  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4586  putative amidohydrolase family protein  60.05 
 
 		 389 aa  473  1e-132  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3565  peptidase M20D, amidohydrolase  60.26 
 
 		 390 aa  471  1e-132  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2671  peptidase M20D, amidohydrolase  60.66 
 
 		 394 aa  473  1e-132  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  decreased coverage  0.00976662  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2262  peptidase M20D, amidohydrolase  61.18 
 
 		 389 aa  471  1.0000000000000001e-131  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.891111  normal  0.0931897 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1729  peptidase M20D, amidohydrolase  60.26 
 
 		 390 aa  470  1.0000000000000001e-131  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0022862 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4250  amidohydrolase  60.77 
 
 		 390 aa  464  1e-129  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.456638  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2919  amidohydrolase  58.55 
 
 		 388 aa  459  9.999999999999999e-129  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.54348  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0719  peptidase M20D, amidohydrolase  59.28 
 
 		 387 aa  454  1e-127  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.093275  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1288  amidohydrolase  59.69 
 
 		 388 aa  451  1e-125  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0866095  normal  0.389955 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2229  amidohydrolase  58.05 
 
 		 395 aa  446  1.0000000000000001e-124  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.359386  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2692  amidohydrolase  58.03 
 
 		 388 aa  439  9.999999999999999e-123  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2919  amidohydrolase  57.51 
 
 		 388 aa  438  9.999999999999999e-123  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.068301  normal  0.124085 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3187  amidohydrolase  57.51 
 
 		 388 aa  436  1e-121  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0033512 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2260  putative amidohydrolase family protein  56.59 
 
 		 390 aa  434  1e-120  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3289  peptidase M20D, amidohydrolase  56.85 
 
 		 387 aa  431  1e-119  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.286044 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5364  putative amidohydrolase family protein  56.33 
 
 		 390 aa  429  1e-119  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00388806 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2815  amidohydrolase  56.99 
 
 		 390 aa  427  1e-118  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.575474  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4367  amidohydrolase  54.03 
 
 		 388 aa  421  1e-117  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3584  amidohydrolase  55.7 
 
 		 390 aa  424  1e-117  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0132191 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0718  peptidase M20D, amidohydrolase  53.75 
 
 		 390 aa  418  1e-116  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.178083  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0245  amidohydrolase  56.74 
 
 		 388 aa  409  1e-113  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.352854  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3314  amidohydrolase  54.15 
 
 		 390 aa  409  1e-113  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0610  amidohydrolase  57.36 
 
 		 389 aa  410  1e-113  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  decreased coverage  0.00962709  normal  0.632979 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0937  peptidase M20D, amidohydrolase  51.96 
 
 		 387 aa  402  1e-111  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.47047  normal  0.0807888 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3086  peptidase M20D, amidohydrolase  52.85 
 
 		 389 aa  391  1e-107  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.985379  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1161  amidohydrolase  52.22 
 
 		 386 aa  387  1e-106  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1555  amidohydrolase  48.3 
 
 		 388 aa  382  1e-105  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.435924  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2910  metal-dependent amidase/aminoacylase/carboxypeptidase  48.3 
 
 		 388 aa  382  1e-105  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3007  peptidase M20D, amidohydrolase  48.99 
 
 		 397 aa  380  1e-104  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3113  amidohydrolase  47.86 
 
 		 396 aa  374  1e-102  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2343  peptidase M20D, amidohydrolase  48.69 
 
 		 386 aa  374  1e-102  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0732987  normal  0.851404 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4882  amidohydrolase  47.12 
 
 		 404 aa  372  1e-102  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.345507 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2748  amidohydrolase  47.61 
 
 		 396 aa  374  1e-102  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1110  amidohydrolase  49.61 
 
 		 388 aa  372  1e-102  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.247548  normal  0.0143187 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2687  amidohydrolase  47.86 
 
 		 397 aa  369  1e-101  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.453314  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3159  peptidase M20D, amidohydrolase  47.86 
 
 		 397 aa  369  1e-101  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0152  amidohydrolase  46.1 
 
 		 396 aa  367  1e-100  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.468392  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2111  peptidase M20D, amidohydrolase  47.1 
 
 		 398 aa  365  1e-100  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.959227  normal  0.0805645 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2533  peptidase M20D, amidohydrolase  48.23 
 
 		 397 aa  365  1e-100  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0030908 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2871  putative hippurate hydrolase protein  46.85 
 
 		 396 aa  364  1e-99  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.000867409  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3677  amidohydrolase  48.84 
 
 		 399 aa  364  2e-99  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2871  peptidase M20D, amidohydrolase  52.09 
 
 		 391 aa  364  2e-99  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0333  amidohydrolase  48.74 
 
 		 401 aa  362  8e-99  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1519  amidohydrolase  48.17 
 
 		 390 aa  361  1e-98  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2925  amidohydrolase  48.7 
 
 		 388 aa  360  3e-98  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2955  peptidase M20D, amidohydrolase  48.56 
 
 		 387 aa  359  5e-98  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0814312  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3484  amidohydrolase  46.35 
 
 		 398 aa  358  6e-98  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00282847  hitchhiker  0.00183478 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0472  putative hippurate carboxypeptidase, M20D- type  47.24 
 
 		 423 aa  358  9e-98  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0745924  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4664  amidohydrolase  51.22 
 
 		 388 aa  358  9.999999999999999e-98  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0687549  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3358  amidohydrolase  48.68 
 
 		 395 aa  357  1.9999999999999998e-97  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.445234  normal  0.0286495 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0444  amidohydrolase  47.64 
 
 		 401 aa  357  1.9999999999999998e-97  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.186163  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4372  hippurate hydrolase  50 
 
 		 379 aa  356  3.9999999999999996e-97  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.362461  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0453  amidohydrolase  47.38 
 
 		 401 aa  356  5e-97  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.719857  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1825  amidohydrolase  47.77 
 
 		 387 aa  355  7.999999999999999e-97  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0704154  normal  0.023648 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0770  amidohydrolase  46.25 
 
 		 403 aa  353  2e-96  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.824493 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0071  peptidase M20D, amidohydrolase  47.75 
 
 		 389 aa  353  2.9999999999999997e-96  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4300  peptidase M20D, amidohydrolase  46.32 
 
 		 412 aa  353  4e-96  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0252  peptidase M20D, amidohydrolase  49.07 
 
 		 396 aa  350  3e-95  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.24772  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5569  amidohydrolase  47.84 
 
 		 401 aa  350  3e-95  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.544377  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1090  amidohydrolase  48.03 
 
 		 424 aa  349  4e-95  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.321453  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0665  amidohydrolase  48.18 
 
 		 408 aa  349  5e-95  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.382123  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0687  amidohydrolase  48.18 
 
 		 408 aa  349  6e-95  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.422759  normal  0.057643 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4896  amidohydrolase  49.07 
 
 		 396 aa  348  6e-95  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.873901  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_2992  peptidase M20D, amidohydrolase  49.07 
 
 		 399 aa  348  8e-95  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5374  amidohydrolase  49.07 
 
 		 399 aa  348  8e-95  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26260  putative hydrolase  47.8 
 
 		 389 aa  348  1e-94  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.474103  normal  0.713071 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0172  amidohydrolase  50 
 
 		 388 aa  347  2e-94  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.564603 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2027  amidohydrolase  45.67 
 
 		 382 aa  346  4e-94  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0315101  normal  0.0503578 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5405  amidohydrolase  45.98 
 
 		 396 aa  346  4e-94  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1624  amidohydrolase  46.72 
 
 		 387 aa  346  5e-94  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.538958  hitchhiker  0.00444937 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5562  amidohydrolase  46.76 
 
 		 399 aa  346  5e-94  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.596197  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3615  peptidase M20D, amidohydrolase  45.45 
 
 		 397 aa  345  6e-94  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5250  amidohydrolase  49.07 
 
 		 396 aa  345  7e-94  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1649  amidohydrolase  46.72 
 
 		 387 aa  345  8.999999999999999e-94  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1169  peptidase M20D, amidohydrolase  46.72 
 
 		 387 aa  345  8.999999999999999e-94  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6067  amidohydrolase  48.05 
 
 		 395 aa  345  1e-93  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4721  amidohydrolase  48.81 
 
 		 396 aa  345  1e-93  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5843  amidohydrolase  47.97 
 
 		 396 aa  343  2e-93  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.575611  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3769  amidohydrolase  48.97 
 
 		 396 aa  343  2.9999999999999997e-93  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5199  hippurate hydrolase  45.99 
 
 		 403 aa  343  2.9999999999999997e-93  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4601  amidohydrolase  47.27 
 
 		 394 aa  342  9e-93  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0856359  hitchhiker  0.00046008 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6670  amidohydrolase  47.38 
 
 		 395 aa  341  1e-92  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1813  peptidase M20D, amidohydrolase  47.79 
 
 		 388 aa  341  1e-92  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.301487  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6435  peptidase M20D, amidohydrolase  47.38 
 
 		 395 aa  341  1e-92  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6268  amidohydrolase  47.38 
 
 		 395 aa  340  2e-92  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.843577  normal  0.0558872 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2175  peptidase M20D, amidohydrolase  48.68 
 
 		 396 aa  340  2e-92  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.20985 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3382  amidohydrolase  45.53 
 
 		 402 aa  340  2e-92  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5935  amidohydrolase  48.28 
 
 		 396 aa  340  2.9999999999999998e-92  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.456281  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0935  amidohydrolase  45.83 
 
 		 415 aa  340  2.9999999999999998e-92  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>