200 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ava_C0093 on replicon NC_007412
Organism: Anabaena variabilis ATCC 29413



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007412  Ava_C0093  endoribonuclease L-PSP  100 
 
 		 154 aa  324  3e-88  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0468551  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3087  Endoribonuclease L-PSP  57.14 
 
 		 140 aa  149  2e-35  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4473  Endoribonuclease L-PSP  54.74 
 
 		 141 aa  145  1.0000000000000001e-34  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.871533  normal  1 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07059  conserved hypothetical protein  40.3 
 
 		 135 aa  101  4e-21  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.219102  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_09338  L-PSP endoribonuclease family protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G03420)  45.04 
 
 		 192 aa  99.8  1e-20  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.920057 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_09123  hypothetical protein  38.24 
 
 		 143 aa  92.4  2e-18  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_04125  conserved hypothetical protein  40 
 
 		 135 aa  90.9  6e-18  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.386288 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0180  endoribonuclease L-PSP  33.58 
 
 		 131 aa  82.4  0.000000000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00581457  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2736  endoribonuclease L-PSP  29.27 
 
 		 138 aa  73.2  0.000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1433  Endoribonuclease L-PSP  35.96 
 
 		 132 aa  67.8  0.00000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.652248  normal  0.596243 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5714  endoribonuclease L-PSP  28.93 
 
 		 132 aa  64.3  0.0000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3080  endoribonuclease L-PSP  28.12 
 
 		 134 aa  64.3  0.0000000006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0669156  normal  0.0908777 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7050  endoribonuclease L-PSP  29.92 
 
 		 132 aa  63.9  0.0000000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.130103 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3756  putative mRNA endoribonuclease  32.77 
 
 		 207 aa  63.5  0.000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1302  endoribonuclease L-PSP  30.16 
 
 		 132 aa  62.8  0.000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6528  endoribonuclease L-PSP  30.16 
 
 		 132 aa  62.8  0.000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6135  endoribonuclease L-PSP  30.16 
 
 		 132 aa  63.2  0.000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6837  endoribonuclease L-PSP  27.82 
 
 		 137 aa  62.8  0.000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0440077  normal  0.0291041 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6580  endoribonuclease L-PSP  32.28 
 
 		 130 aa  62.8  0.000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.121518  normal  0.64556 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4362  endoribonuclease L-PSP  29.82 
 
 		 137 aa  61.6  0.000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS04775  putative transmembrane protein  33.61 
 
 		 145 aa  61.6  0.000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05662  hypothetical protein  33.61 
 
 		 145 aa  61.6  0.000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5043  endoribonuclease L-PSP  29.82 
 
 		 137 aa  61.6  0.000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.637864  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3242  endoribonuclease L-PSP  28.57 
 
 		 132 aa  61.6  0.000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.57366  normal  0.136593 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5817  endoribonuclease L-PSP  29.82 
 
 		 137 aa  61.6  0.000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6295  endoribonuclease L-PSP  32.28 
 
 		 130 aa  60.5  0.000000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.114963  hitchhiker  0.00251827 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4322  Endoribonuclease L-PSP  27.41 
 
 		 137 aa  60.1  0.00000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.366226  normal  0.0989131 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4432  Endoribonuclease L-PSP  27.41 
 
 		 137 aa  60.1  0.00000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0220877  normal  0.494212 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6387  endoribonuclease L-PSP  34.21 
 
 		 137 aa  57.8  0.00000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2196  endoribonuclease L-PSP  27.78 
 
 		 137 aa  57  0.00000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0707908  normal  0.188687 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4466  endoribonuclease L-PSP  28.87 
 
 		 134 aa  56.6  0.0000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.136863 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2280  endoribonuclease L-PSP  33.04 
 
 		 132 aa  55.5  0.0000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2178  endoribonuclease L-PSP  27.14 
 
 		 136 aa  55.1  0.0000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3090  endoribonuclease L-PSP  27.59 
 
 		 128 aa  55.1  0.0000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3176  endoribonuclease L-PSP  29.03 
 
 		 172 aa  54.3  0.0000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0208  YjgF-like protein  36.36 
 
 		 126 aa  53.5  0.000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0470  endoribonuclease L-PSP  38.38 
 
 		 126 aa  53.1  0.000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.720081  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2374  endoribonuclease L-PSP  24.41 
 
 		 131 aa  53.5  0.000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00553105 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0072  endoribonuclease L-PSP, putative  35.35 
 
 		 126 aa  52.8  0.000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2477  endoribonuclease L-PSP family protein  22.83 
 
 		 132 aa  52.8  0.000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.395896  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2263  endoribonuclease L-PSP  32.23 
 
 		 129 aa  52.4  0.000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.598957  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0130  endoribonuclease L-PSP  31.06 
 
 		 130 aa  52.4  0.000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0429607  normal  1 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6288  Endoribonuclease L-PSP  33.33 
 
 		 128 aa  52.4  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.296656  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6178  hypothetical protein  27.1 
 
 		 140 aa  51.6  0.000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71200  YjgF family translation initiation inhibitor  27.1 
 
 		 140 aa  51.6  0.000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2243  endoribonuclease L-PSP  22.4 
 
 		 133 aa  51.6  0.000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0340055  normal  0.738616 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3031  endoribonuclease L-PSP  27.74 
 
 		 144 aa  51.6  0.000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.00544929  normal  0.808496 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3519  endoribonuclease L-PSP  29.77 
 
 		 131 aa  51.6  0.000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.129578 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4166  endoribonuclease L-PSP  28.91 
 
 		 130 aa  50.8  0.000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5405  endoribonuclease L-PSP  31.86 
 
 		 149 aa  50.1  0.00001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0585911 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3267  endoribonuclease L-PSP  27.1 
 
 		 138 aa  50.1  0.00001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.431089  normal  0.0317231 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6992  endoribonuclease L-PSP  31.58 
 
 		 145 aa  49.7  0.00001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.615821  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0170  endoribonuclease L-PSP  35.35 
 
 		 126 aa  50.1  0.00001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0281593 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2961  endoribonuclease L-PSP  28.85 
 
 		 138 aa  49.7  0.00001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.211045  normal  0.463755 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7080  endoribonuclease L-PSP  31.86 
 
 		 145 aa  49.3  0.00002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0944873 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6423  endoribonuclease L-PSP  31.86 
 
 		 145 aa  49.3  0.00002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.954317 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0355  endoribonuclease L-PSP  31.18 
 
 		 127 aa  48.9  0.00002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000606003 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3818  endoribonuclease L-PSP  24.6 
 
 		 135 aa  49.7  0.00002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.515952  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5552  endoribonuclease L-PSP  34.34 
 
 		 126 aa  48.9  0.00002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.674901 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3130  Endoribonuclease L-PSP  31.62 
 
 		 131 aa  49.3  0.00002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5674  endoribonuclease L-PSP  31.86 
 
 		 145 aa  49.7  0.00002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.171739  normal  0.201016 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3522  endoribonuclease L-PSP  30.56 
 
 		 140 aa  48.5  0.00003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0348507  normal  0.770379 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1200  Endoribonuclease L-PSP  28.57 
 
 		 142 aa  48.9  0.00003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3951  Endoribonuclease L-PSP  31.67 
 
 		 130 aa  48.5  0.00003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0816657 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3838  Endoribonuclease L-PSP  31.67 
 
 		 130 aa  48.5  0.00003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.481327 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5043  Endoribonuclease L-PSP  32.38 
 
 		 132 aa  48.5  0.00003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2388  endoribonuclease L-PSP  27.56 
 
 		 145 aa  48.5  0.00003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5351  endoribonuclease L-PSP  34.34 
 
 		 126 aa  48.5  0.00003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.120193  normal  0.233615 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5303  endoribonuclease  34.34 
 
 		 126 aa  48.1  0.00004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.141797 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5769  endoribonuclease L-PSP family protein  28.12 
 
 		 131 aa  48.1  0.00004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.81717  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5212  putative endoribonuclease L-PSP  34.34 
 
 		 126 aa  48.1  0.00004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.36615 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1109  endoribonuclease L-PSP  26.15 
 
 		 132 aa  48.1  0.00004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.912712  normal  0.138441 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4836  endoribonuclease L-PSP family protein  28.12 
 
 		 131 aa  48.1  0.00004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1620  endoribonuclease L-PSP family protein  30.53 
 
 		 129 aa  48.1  0.00004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.384169  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4391  endoribonuclease L-PSP  33.33 
 
 		 126 aa  47.8  0.00006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0665991 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1720  endoribonuclease L-PSP family protein  28.91 
 
 		 129 aa  47.4  0.00007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.195572  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2480  endoribonuclease L-PSP  27.88 
 
 		 131 aa  47.4  0.00007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1735  hypothetical protein  30 
 
 		 132 aa  47.4  0.00007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.338014  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04115  predicted mRNA endoribonuclease  28.12 
 
 		 131 aa  47.4  0.00008  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4728  endoribonuclease L-PSP family protein  28.12 
 
 		 131 aa  47.4  0.00008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_04079  hypothetical protein  28.12 
 
 		 131 aa  47.4  0.00008  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4504  endoribonuclease L-PSP family protein  28.12 
 
 		 131 aa  47.4  0.00008  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.282438  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3748  Endoribonuclease L-PSP  28.12 
 
 		 131 aa  47  0.00009  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4835  endoribonuclease L-PSP  31.82 
 
 		 129 aa  47  0.00009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4820  endoribonuclease L-PSP family protein  28.12 
 
 		 131 aa  47  0.00009  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2252  endoribonuclease L-PSP  29.63 
 
 		 140 aa  47  0.00009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3764  endoribonuclease L-PSP  28.12 
 
 		 131 aa  47  0.00009  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4936  endoribonuclease L-PSP  31 
 
 		 150 aa  47  0.0001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.309405  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1336  endoribonuclease L-PSP  30.36 
 
 		 125 aa  46.6  0.0001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3698  peptidase S1C, Do  34.07 
 
 		 127 aa  46.6  0.0001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.239756 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1855  endoribonuclease L-PSP  26.67 
 
 		 141 aa  46.2  0.0001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.570502  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0362  putative endoribonuclease L-PSP  30.85 
 
 		 127 aa  46.6  0.0001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09920  putative translation initiation inhibitor  31.5 
 
 		 132 aa  46.6  0.0001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00640677  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0935  Endoribonuclease L-PSP  30 
 
 		 128 aa  46.2  0.0001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0443  endoribonuclease L-PSP  28.39 
 
 		 139 aa  46.6  0.0001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2061  endoribonuclease L-PSP  28.95 
 
 		 132 aa  46.6  0.0001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.199882 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5271  endoribonuclease L-PSP  29.13 
 
 		 140 aa  47  0.0001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2200  endoribonuclease L-PSP  28.21 
 
 		 138 aa  46.6  0.0001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.162776  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3465  hypothetical protein  28.39 
 
 		 145 aa  46.2  0.0002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.589893 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0823  endoribonuclease L-PSP  30.17 
 
 		 130 aa  45.8  0.0002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>