146 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ava_3204 on replicon NC_007413
Organism: Anabaena variabilis ATCC 29413



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007413  Ava_3204  sensor protein  100 
 
 
179 aa  373  1e-103  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0532438 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3764  putative GAF sensor protein  62.03 
 
 
217 aa  207  8e-53  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0939497 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4301  signal transduction histidine kinase  43.92 
 
 
2693 aa  138  4.999999999999999e-32  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0828  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with GAF sensor  39.49 
 
 
734 aa  132  3e-30  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.84548  normal  0.140102 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3673  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with GAF sensor  40.41 
 
 
1262 aa  127  7.000000000000001e-29  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0203  GAF sensor signal transduction histidine kinase  37.22 
 
 
928 aa  123  1e-27  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2776  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with GAF sensor  39.31 
 
 
1142 aa  119  1.9999999999999998e-26  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.380177 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1431  diguanylate cyclase with PAS/PAC and GAF sensors  38.78 
 
 
625 aa  119  1.9999999999999998e-26  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3341  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with GAF sensor  39.31 
 
 
1142 aa  120  1.9999999999999998e-26  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2674  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.25 
 
 
1305 aa  116  9.999999999999999e-26  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1457  diguanylate cyclase with PAS/PAC and GAF sensors  38.1 
 
 
624 aa  115  1.9999999999999998e-25  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.659998  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3735  signal transduction histidine kinase  40 
 
 
1183 aa  114  5e-25  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.709518  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0715  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with GAF sensor  39.13 
 
 
1313 aa  114  1.0000000000000001e-24  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0403272  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3457  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.29 
 
 
1070 aa  113  2.0000000000000002e-24  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3763  multi-sensor signal transduction histidine kinase  37.75 
 
 
1255 aa  112  3e-24  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0366  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  35.26 
 
 
1081 aa  112  4.0000000000000004e-24  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4210  GAF sensor signal transduction histidine kinase  34.94 
 
 
612 aa  112  4.0000000000000004e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4345  multi-sensor Signal transduction histidine kinase  35.37 
 
 
890 aa  111  5e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.5665  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2781  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with GAF sensor  33.55 
 
 
934 aa  111  5e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0674  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.26 
 
 
1021 aa  111  6e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2659  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.71 
 
 
1070 aa  109  3e-23  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.337944  normal  0.276356 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5298  signal transduction histidine kinase  31.58 
 
 
732 aa  108  3e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0858  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with phytochrome sensor  37.64 
 
 
1406 aa  108  6e-23  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0185965  normal  0.079214 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1113  signal transduction histidine kinase  37.41 
 
 
723 aa  106  1e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1390  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.88 
 
 
1977 aa  105  3e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1716  putative PAS/PAC sensor protein  34.16 
 
 
1099 aa  105  4e-22  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1740  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.16 
 
 
1319 aa  105  5e-22  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3771  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.29 
 
 
1391 aa  105  5e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2782  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with GAF sensor  34.72 
 
 
902 aa  104  6e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4701  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.43 
 
 
1274 aa  104  7e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0613664  normal  0.609464 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1370  signal transduction histidine kinase  36.14 
 
 
1560 aa  104  9e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.71177  normal  0.70667 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4421  GAF sensor signal transduction histidine kinase  36.88 
 
 
457 aa  103  1e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.45422 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3771  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.48 
 
 
714 aa  103  2e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.756709  normal  0.201817 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0320  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.58 
 
 
838 aa  103  2e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.88782 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3613  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.57 
 
 
1808 aa  100  8e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.643019 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2524  multi-sensor Signal transduction histidine kinase  32.68 
 
 
751 aa  100  1e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.45421 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2778  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with GAF sensor  38.78 
 
 
1153 aa  100  1e-20  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.970502 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3339  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with GAF sensor  38.78 
 
 
1153 aa  100  1e-20  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1855  GAF sensor hybrid histidine kinase  36.73 
 
 
1285 aa  100  1e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1210  multi-sensor Signal transduction histidine kinase  33.53 
 
 
1036 aa  99.4  2e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3004  Signal transduction histidine kinase  33.54 
 
 
941 aa  99  3e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1064  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with GAF sensor  38.98 
 
 
879 aa  98.6  4e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.698769  hitchhiker  0.00000570114 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2534  diguanylate cyclase with GAF sensor  29.71 
 
 
421 aa  97.8  8e-20  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.657544  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1805  diguanylate cyclase with PAS/PAC and GAF sensors  33.97 
 
 
960 aa  96.7  2e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3596  Serine/threonine protein kinase and Signal transduction histidine kinase (STHK) with GAF sensor  34.9 
 
 
2017 aa  95.9  3e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.107255 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4093  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.56 
 
 
937 aa  92  4e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0790  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.11 
 
 
566 aa  91.7  5e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.391268  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4417  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.84 
 
 
1548 aa  90.5  1e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.409401 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2814  GAF sensor hybrid histidine kinase  32 
 
 
763 aa  87.8  8e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.155467  normal  0.302046 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3302  GAF sensor hybrid histidine kinase  32 
 
 
763 aa  87.8  8e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3778  chemotaxis sensory transducer, phytochrome sensor  29.8 
 
 
1100 aa  87  1e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.275371 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0064  Signal transduction histidine kinase  29.93 
 
 
1714 aa  83.6  0.000000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.274411 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0521  multi-sensor Signal transduction histidine kinase  30 
 
 
1072 aa  84  0.000000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0819  multi-sensor hybrid histidine kinase  28.29 
 
 
844 aa  81.6  0.000000000000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0848  multi-sensor hybrid histidine kinase  28.29 
 
 
844 aa  81.6  0.000000000000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0288  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.96 
 
 
884 aa  80.1  0.00000000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2901  GAF sensor hybrid histidine kinase  31.29 
 
 
733 aa  80.1  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.248575  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1168  multi-sensor Signal transduction histidine kinase  30.11 
 
 
676 aa  78.6  0.00000000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4055  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with GAF sensor  28.97 
 
 
1781 aa  77.8  0.00000000000009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4017  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with GAF sensor  28.97 
 
 
1781 aa  77.4  0.00000000000009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0561  GAF sensor signal transduction histidine kinase  26.49 
 
 
640 aa  76.3  0.0000000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.393536  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2096  diguanylate cyclase with GAF sensor  27.74 
 
 
664 aa  72.8  0.000000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.76184 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1564  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.77 
 
 
1550 aa  72.4  0.000000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.047002  normal  0.324166 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4267  multi-sensor Signal transduction histidine kinase  25.56 
 
 
920 aa  71.6  0.000000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.427851  normal  0.366245 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4631  multi-sensor hybrid histidine kinase  27.5 
 
 
1672 aa  70.1  0.00000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.659803  normal  0.0232391 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3479  GAF sensor signal transduction histidine kinase  28.12 
 
 
744 aa  68.6  0.00000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.209747 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2624  GAF sensor signal transduction histidine kinase  28.12 
 
 
744 aa  68.6  0.00000000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5112  multi-sensor signal transduction histidine kinase  23.97 
 
 
1252 aa  67  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.758591 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1418  GAF sensor hybrid histidine kinase  27.78 
 
 
853 aa  65.9  0.0000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.237881  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0423  multi-sensor signal transduction histidine kinase  25.64 
 
 
799 aa  65.5  0.0000000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.721204  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5235  GAF sensor hybrid histidine kinase  27.22 
 
 
757 aa  64.7  0.0000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0099  multi-sensor signal transduction histidine kinase  25.14 
 
 
746 aa  63.5  0.000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03310  GAF domain protein  27.22 
 
 
625 aa  62  0.000000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0453757  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4749  multi-sensor signal transduction histidine kinase  25.15 
 
 
792 aa  59.7  0.00000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.157892  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2574  response regulator receiver modulated GAF sensor protein  27.11 
 
 
844 aa  59.3  0.00000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.969915 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5069  multi-sensor signal transduction histidine kinase  25 
 
 
748 aa  59.3  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.801669 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3496  bacteriophytochrome protein  25.45 
 
 
852 aa  58.5  0.00000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.552776  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3034  putative PAS/PAC sensor protein  25.83 
 
 
856 aa  54.3  0.0000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0858916  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4225  multi-sensor hybrid histidine kinase  24.12 
 
 
1322 aa  53.9  0.000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6244  response regulator receiver modulated GAF sensor protein  26.19 
 
 
849 aa  53.5  0.000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1309  putative PAS/PAC sensor protein  25.58 
 
 
722 aa  52.8  0.000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.543635 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0383  multi-sensor signal transduction histidine kinase  24.09 
 
 
746 aa  51.6  0.000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.269133 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4127  multi-sensor signal transduction histidine kinase  25.62 
 
 
743 aa  51.6  0.000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.313016  normal  0.0728263 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9083  bacteriophytochrome protein  26.98 
 
 
856 aa  51.2  0.000009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3788  phytochrome  24.71 
 
 
772 aa  50.4  0.00001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.0317187 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4270  GAF sensor signal transduction histidine kinase  26.49 
 
 
751 aa  50.4  0.00001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.235212 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1235  phytochrome-like protein  26.7 
 
 
506 aa  49.7  0.00002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3289  putative PAS/PAC sensor protein  24.5 
 
 
855 aa  50.1  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.363327  normal  0.145052 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3985  putative PAS/PAC sensor protein  25 
 
 
732 aa  49.3  0.00003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.525883  normal  0.142655 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3740  phytochrome  25 
 
 
732 aa  49.3  0.00003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.103591  decreased coverage  0.000116427 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1986  putative GAF sensor protein  22.94 
 
 
798 aa  49.3  0.00003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.932658  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1182  response regulator receiver modulated GAF sensor protein  22.91 
 
 
846 aa  49.3  0.00003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.75997  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10700  putative bacteriophytochrome  23.84 
 
 
728 aa  48.9  0.00004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2978  putative GAF sensor protein  24.16 
 
 
567 aa  48.5  0.00005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.186  normal  0.0306937 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3080  bacteriophytochrome  23.84 
 
 
783 aa  48.5  0.00005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1419  putative PAS/PAC sensor protein  25.93 
 
 
770 aa  48.5  0.00005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4458  putative GAF sensor protein  25.7 
 
 
844 aa  48.5  0.00005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2586  response regulator receiver modulated GAF sensor protein  27.38 
 
 
847 aa  48.5  0.00005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.251983 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1502  response regulator receiver modulated GAF sensor protein  21.26 
 
 
311 aa  48.5  0.00006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1475  response regulator receiver modulated GAF sensor protein  21.26 
 
 
311 aa  48.5  0.00006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>