More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ava_0535 on replicon NC_007413
Organism: Anabaena variabilis ATCC 29413



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007413  Ava_0535  Rieske (2Fe-2S) region  100 
 
 
460 aa  956    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4346  pheophorbide a oxygenase  61.86 
 
 
465 aa  586  1e-166  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.18517  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2931  Pheophorbide a oxygenase  60.63 
 
 
477 aa  575  1.0000000000000001e-163  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2189  Pheophorbide a oxygenase  58.76 
 
 
474 aa  568  1e-161  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00477289 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2164  cell death suppressor protein Lls1-like  51.35 
 
 
461 aa  478  1e-133  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.909867  normal  0.138548 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1781  cell death suppressor protein Lls1-like  53.46 
 
 
456 aa  436  1e-121  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.527136  normal  0.0843855 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0864  cell death suppressor protein Lls1-like  50.92 
 
 
438 aa  420  1e-116  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.658605  n/a   
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_43309  predicted protein  44.78 
 
 
492 aa  334  2e-90  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.231154  hitchhiker  0.00124797 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3116  Pheophorbide a oxygenase  36.79 
 
 
442 aa  247  3e-64  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1557  Rieske (2Fe-2S) domain protein  31.96 
 
 
450 aa  235  1.0000000000000001e-60  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0276963  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3793  pheophorbide a oxygenase  35.44 
 
 
443 aa  235  1.0000000000000001e-60  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.726  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1530  Rieske (2Fe-2S) domain protein  31.96 
 
 
450 aa  233  5e-60  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1303  Rieske (2Fe-2S) region  35.48 
 
 
443 aa  233  6e-60  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.418357  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2958  pheophorbide a oxygenase  34.73 
 
 
442 aa  231  2e-59  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0467803  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1056  Rieske (2Fe-2S) region  34.15 
 
 
499 aa  229  9e-59  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00144994  hitchhiker  0.000116875 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0795  Rieske (2Fe-2S) domain protein  32.24 
 
 
497 aa  209  7e-53  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.266613  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0769  Rieske (2Fe-2S) domain protein  31.78 
 
 
497 aa  206  5e-52  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_26228  predicted protein  29.48 
 
 
668 aa  184  4.0000000000000006e-45  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.281249  normal  0.273766 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0964  Rieske (2Fe-2S) domain protein  32.54 
 
 
468 aa  172  1e-41  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.1498 
 
 
-
 
NC_011700  PHATRDRAFT_50613  Tic55 component of chloroplast import machinery  29.02 
 
 
498 aa  160  5e-38  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_40637  predicted protein  29.11 
 
 
510 aa  149  1.0000000000000001e-34  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0807  vanillate O-demethylase oxygenase subunit  29.85 
 
 
331 aa  103  8e-21  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2918  Rieske (2Fe-2S) domain protein  29.41 
 
 
337 aa  102  2e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.333438  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2492  vanillate O-demethylase oxygenase subunit  28.9 
 
 
315 aa  100  7e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4769  Rieske (2Fe-2S) iron-sulphur domain protein  27.24 
 
 
367 aa  98.2  3e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.289545  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2050  Rieske (2Fe-2S) iron-sulphur domain protein  34.46 
 
 
327 aa  97.1  6e-19  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0319051  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2036  hypothetical protein  34.24 
 
 
334 aa  96.7  8e-19  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.502892  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5789  Rieske (2Fe-2S) region  33.33 
 
 
349 aa  95.9  1e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2919  Rieske (2Fe-2S) domain protein  32.97 
 
 
338 aa  95.5  2e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.563703  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0787  Rieske (2Fe-2S) protein  29.04 
 
 
351 aa  94.4  4e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.466147 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3542  vanillate O-demethylase oxygenase subunit  33.92 
 
 
345 aa  94  5e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.10385 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1136  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  36.36 
 
 
373 aa  93.6  7e-18  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.959251  normal  0.28876 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2037  Rieske (2Fe-2S) domain protein  34.67 
 
 
357 aa  93.2  9e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.950553  normal  0.781731 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1718  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  34.17 
 
 
357 aa  92.4  1e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.187317  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3671  oxidoreductase alpha subunit  27.54 
 
 
407 aa  91.7  2e-17  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0725789  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0127  Rieske (2Fe-2S) protein  32.45 
 
 
355 aa  91.7  2e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1096  Rieske (2Fe-2S) domain protein  34.67 
 
 
357 aa  91.7  2e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0810231  normal  0.184537 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2013  Rieske (2Fe-2S) family oxidoreductase large subunit  32.97 
 
 
348 aa  91.3  3e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2825  iron-sulfur cluster-binding protein, Rieske family  28.33 
 
 
358 aa  90.9  4e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.000971916  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2143  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  29.11 
 
 
372 aa  90.9  5e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.444634  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6610  vanillate demethylase oxygenase subunit  30.81 
 
 
380 aa  90.1  7e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.581564  normal  0.184804 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1184  Rieske (2Fe-2S) domain protein  31.79 
 
 
358 aa  90.1  8e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1185  Rieske (2Fe-2S) domain protein  31.02 
 
 
364 aa  90.1  8e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5546  putative vanillate O-demethylase oxygenase subunit (4-hydroxy- 3-methoxybenzoate demethylase)  32.02 
 
 
347 aa  89  2e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3024  vanillate monooxygenase  36.99 
 
 
361 aa  88.2  3e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2590  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  28.7 
 
 
341 aa  88.2  3e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.225432 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0222  vanillate O-demethylase oxygenase subunit oxidoreductase protein  31.44 
 
 
342 aa  87.8  4e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.0000016692  normal  0.0221534 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3621  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  28 
 
 
377 aa  87.4  5e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0573672 
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6483  Rieske (2Fe-2S) region  36.97 
 
 
358 aa  87  6e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0627  Rieske (2Fe-2S) domain protein  25.91 
 
 
361 aa  86.7  8e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4593  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  34.78 
 
 
353 aa  86.7  8e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.743349  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0648  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  25.51 
 
 
361 aa  85.9  0.000000000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.149026 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2688  Rieske (2Fe-2S) protein  33.33 
 
 
352 aa  86.3  0.000000000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3952  Rieske (2Fe-2S) protein  30.41 
 
 
340 aa  86.3  0.000000000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.13771  normal  0.112958 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1067  vanillate monooxygenase  31.64 
 
 
359 aa  86.3  0.000000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.535746  normal  0.0980736 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3212  Rieske 2Fe-2S family protein  29.58 
 
 
341 aa  85.5  0.000000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0659  Rieske (2Fe-2S) domain protein  25.51 
 
 
361 aa  85.5  0.000000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.210033 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0741  Rieske (2Fe-2S) protein  24.8 
 
 
382 aa  85.5  0.000000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0606248 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1389  putative oxygenase  31.31 
 
 
359 aa  85.5  0.000000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4516  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  26.93 
 
 
373 aa  85.1  0.000000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3396  vanillate monooxygenase  28.87 
 
 
348 aa  84.7  0.000000000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.00111775  normal  0.0140003 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1488  Rieske (2Fe-2S) protein  30.99 
 
 
351 aa  84.7  0.000000000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2035  hypothetical protein  28.64 
 
 
345 aa  84.3  0.000000000000004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1543  vanillate monooxygenase  32.43 
 
 
366 aa  84  0.000000000000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.111008  hitchhiker  0.00152746 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5628  vanillate O-demethylase oxygenase subunit  30.26 
 
 
351 aa  83.6  0.000000000000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.834519  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5126  vanillate monooxygenase  33.54 
 
 
352 aa  83.6  0.000000000000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10960  ferridoxin oxidoreductase subunit  31.12 
 
 
370 aa  83.6  0.000000000000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0418  Rieske (2Fe-2S) protein  34.12 
 
 
353 aa  83.2  0.000000000000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.842278  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3119  vanillate monooxygenase  31.68 
 
 
358 aa  82.4  0.00000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4895  Vanillate monooxygenase  31.4 
 
 
336 aa  82.8  0.00000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.802026  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3160  Rieske (2Fe-2S) domain protein  32 
 
 
347 aa  82.8  0.00000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1064  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  25 
 
 
387 aa  82.8  0.00000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.43547 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64800  vanillate O-demethylase oxygenase subunit  30.77 
 
 
351 aa  82.8  0.00000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0565633  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4245  Rieske (2Fe-2S) domain protein  33.52 
 
 
371 aa  81.6  0.00000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2133  twin-arginine translocation pathway signal  29.78 
 
 
484 aa  81.6  0.00000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.395399  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6982  phthalate 4,5-dioxygenase  31.55 
 
 
438 aa  81.6  0.00000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1355  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  32.57 
 
 
358 aa  82  0.00000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26080  vanillate demethylase subunit A  28.29 
 
 
377 aa  82  0.00000000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.819244  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2708  Rieske [2Fe-2S] region  32.31 
 
 
354 aa  81.6  0.00000000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.104354  normal  0.0620392 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5685  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  31.16 
 
 
353 aa  81.3  0.00000000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0319041  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1296  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  29.35 
 
 
367 aa  81.3  0.00000000000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.85642 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3214  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  32.18 
 
 
347 aa  80.9  0.00000000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0195459 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3413  vanillate monooxygenase  33.14 
 
 
345 aa  80.5  0.00000000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.166087 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1867  Rieske (2Fe-2S) iron-sulphur domain protein  38.05 
 
 
388 aa  80.5  0.00000000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.687816 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1686  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  31.18 
 
 
357 aa  80.1  0.00000000000008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0964  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  31.95 
 
 
341 aa  80.1  0.00000000000008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1501  Rieske family iron-sulfur cluster-binding protein  28.17 
 
 
355 aa  80.1  0.00000000000008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4244  Rieske (2Fe-2S) domain protein  30.98 
 
 
352 aa  80.1  0.00000000000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4330  vanillate monooxygenase  28.25 
 
 
366 aa  80.1  0.00000000000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.0440139 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3246  vanillate monooxygenase  28.42 
 
 
347 aa  79.7  0.00000000000009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.546586  normal  0.604076 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3968  Rieske (2Fe-2S) domain protein  30.89 
 
 
360 aa  79.7  0.00000000000009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0886212  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2904  vanillate O-demethylase, oxygenase subunit  31.28 
 
 
354 aa  79.3  0.0000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.179444  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5800  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  26.52 
 
 
354 aa  79.3  0.0000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00198597 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1575  Rieske (2Fe-2S) protein  30 
 
 
346 aa  78.6  0.0000000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.869006  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7059  Rieske (2Fe-2S) domain protein  27.38 
 
 
364 aa  78.6  0.0000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.2387  normal  0.465604 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0963  vanillate O-demethylase oxygenase subunit  30.29 
 
 
350 aa  78.6  0.0000000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0867  Rieske (2Fe-2S) region  28.18 
 
 
357 aa  79  0.0000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3154  Rieske (2Fe-2S) domain protein  28.32 
 
 
221 aa  78.6  0.0000000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.647374  normal  0.386497 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0630  Rieske (2Fe-2S) domain protein  27.96 
 
 
353 aa  79  0.0000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.494266  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1541  vanillate monooxygenase  31.68 
 
 
423 aa  78.2  0.0000000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.00031597  hitchhiker  0.00167065 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>