More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Athe_2687 on replicon NC_012034
Organism: Anaerocellum thermophilum DSM 6725



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012034  Athe_2687  beta-lactamase domain protein  100 
 
 		 591 aa  1208    Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1047  beta-lactamase domain-containing protein  24.74 
 
 		 426 aa  113  8.000000000000001e-24  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1910  beta-lactamase domain protein  24.59 
 
 		 652 aa  105  2e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.0000293974  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1938  beta-lactamase domain protein  28.47 
 
 		 821 aa  104  3e-21  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.199019  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0446  beta-lactamase domain-containing protein  26.29 
 
 		 428 aa  102  2e-20  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.279355  n/a   
 
 
-
 
NC_009974  Haur_5264  beta-lactamase domain-containing protein  24.4 
 
 		 830 aa  102  3e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0626  beta-lactamase domain-containing protein  25.26 
 
 		 422 aa  100  5e-20  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1292  beta-lactamase domain-containing protein  25.26 
 
 		 422 aa  100  7e-20  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.358627  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2554  beta-lactamase domain protein  25.61 
 
 		 667 aa  100  1e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.0000946841  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0197  beta-lactamase domain-containing protein  25 
 
 		 422 aa  99.4  2e-19  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.904798  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0691  beta-lactamase domain-containing protein  25.32 
 
 		 421 aa  97.8  4e-19  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5141  beta-lactamase domain-containing protein  23.44 
 
 		 577 aa  95.9  2e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.265268  normal  0.427463 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1107  beta-lactamase domain-containing protein  26.2 
 
 		 640 aa  90.1  1e-16  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.519523  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0060  beta-lactamase domain-containing protein  26.92 
 
 		 634 aa  89.7  1e-16  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.287706  normal  0.0538773 
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_28482  predicted protein  22.95 
 
 		 602 aa  89.7  1e-16  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.962764  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0049  beta-lactamase domain-containing protein  25.29 
 
 		 635 aa  89  2e-16  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0930  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  24.01 
 
 		 410 aa  89.4  2e-16  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1313  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  26.69 
 
 		 432 aa  88.6  3e-16  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.920627  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1548  beta-lactamase domain-containing protein  26.14 
 
 		 425 aa  87.8  5e-16  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  decreased coverage  0.00297769  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0064  beta-lactamase domain-containing protein  25.72 
 
 		 635 aa  86.7  0.000000000000001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0882  beta-lactamase domain-containing protein  25.67 
 
 		 635 aa  86.3  0.000000000000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.28665  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0190  beta-lactamase domain-containing protein  25.42 
 
 		 635 aa  85.1  0.000000000000003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1721  beta-lactamase domain-containing protein  25.42 
 
 		 635 aa  85.1  0.000000000000003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.959276 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1416  beta-lactamase domain-containing protein  25.07 
 
 		 433 aa  85.1  0.000000000000004  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.449675  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1206  beta-lactamase domain-containing protein  24.29 
 
 		 433 aa  84.3  0.000000000000005  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2609  mRNA 3-end processing factor  24.93 
 
 		 397 aa  84.3  0.000000000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.299083 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2254  beta-lactamase domain-containing protein  23.96 
 
 		 642 aa  84.7  0.000000000000005  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.311245 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1728  beta-lactamase domain-containing protein  25.85 
 
 		 425 aa  84.3  0.000000000000006  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.254192  decreased coverage  0.00045837 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0025  beta-lactamase domain-containing protein  23.63 
 
 		 432 aa  84  0.000000000000007  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0030  beta-lactamase domain-containing protein  26.49 
 
 		 634 aa  83.6  0.00000000000001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1572  beta-lactamase domain-containing protein  25.96 
 
 		 635 aa  82.8  0.00000000000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.342192  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1989  beta-lactamase domain-containing protein  25.42 
 
 		 422 aa  82.8  0.00000000000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.881158  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0558  beta-lactamase domain-containing protein  26.4 
 
 		 430 aa  82.4  0.00000000000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00303127 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1817  KH-domain/beta-lactamase-domain protein  26.26 
 
 		 635 aa  82  0.00000000000003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_33504  predicted protein  22.25 
 
 		 767 aa  82  0.00000000000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.174633 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1749  beta-lactamase domain-containing protein  28.63 
 
 		 428 aa  81.6  0.00000000000004  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00852065 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1199  beta-lactamase domain-containing protein  25.92 
 
 		 630 aa  81.3  0.00000000000005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0390608  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1428  beta-lactamase domain-containing protein  23.04 
 
 		 433 aa  81.3  0.00000000000005  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.1615  normal  0.318951 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00990  Endoribonuclease ysh1 (EC 3.1.27.-)(mRNA 3'-end-processing protein ysh1) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q5BEP0]  24.23 
 
 		 884 aa  80.9  0.00000000000006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1361  beta-lactamase domain protein  26.46 
 
 		 422 aa  80.5  0.00000000000007  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0552  hypothetical protein  23.32 
 
 		 347 aa  80.9  0.00000000000007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1727  beta-lactamase domain-containing protein  24.04 
 
 		 646 aa  80.1  0.0000000000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0637994 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0378  beta-lactamase domain protein  24.65 
 
 		 411 aa  79.7  0.0000000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.834555  normal  0.393865 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2052  beta-lactamase domain protein  27.38 
 
 		 640 aa  79  0.0000000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1893  beta-lactamase domain protein  24.92 
 
 		 411 aa  79.3  0.0000000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.411885  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0193  cleavage and polyadenylation specificity factor  29.78 
 
 		 637 aa  78.6  0.0000000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.209182  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0794  putative mRNA 3-end processing factor  24.78 
 
 		 349 aa  78.6  0.0000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.682803 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0480  beta-lactamase domain-containing protein  23.14 
 
 		 433 aa  79  0.0000000000003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.104405  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1539  beta-lactamase domain-containing protein  25.42 
 
 		 421 aa  77.8  0.0000000000006  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.0000502709 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2131  beta-lactamase domain protein  24.01 
 
 		 464 aa  77.4  0.0000000000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0455  beta-lactamase domain-containing protein  24.17 
 
 		 636 aa  77.4  0.0000000000007  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.263173 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1014  ADP-ribosylation/crystallin J1  24.69 
 
 		 636 aa  77.4  0.0000000000007  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.5583 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0309  beta-lactamase domain-containing protein  25.06 
 
 		 639 aa  77.4  0.0000000000007  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1600  beta-lactamase domain-containing protein  26.37 
 
 		 421 aa  77  0.000000000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.0760665 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0411  putative exonuclease protein involved in mRNA processing  23.78 
 
 		 329 aa  76.3  0.000000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.894409 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0734  hypothetical protein  25.24 
 
 		 328 aa  76.3  0.000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.536853  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4616  putative mRNA 3-end processing factor  23.41 
 
 		 351 aa  75.5  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0750  putative mRNA 3-end processing factor  23.73 
 
 		 356 aa  75.5  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.398364 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2598  KH-domain/beta-lactamase-domain protein  27.47 
 
 		 644 aa  75.5  0.000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3602  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  23.25 
 
 		 490 aa  75.1  0.000000000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00000350398  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0799  putative metallo-hydrolase/oxidoreductase  24 
 
 		 348 aa  75.5  0.000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.187593  normal  0.0112138 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0777  beta-lactamase domain protein  24.26 
 
 		 630 aa  75.5  0.000000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.867846  normal  0.0104567 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_07841  RNA processing exonuclease  24.36 
 
 		 328 aa  75.5  0.000000000003  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.160717  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3402  beta-lactamase domain protein  23 
 
 		 429 aa  74.7  0.000000000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1747  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  24.7 
 
 		 467 aa  74.3  0.000000000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0325  KH-domain/beta-lactamase-domain protein  27.47 
 
 		 644 aa  74.7  0.000000000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.04093  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1385  beta-lactamase domain-containing protein  23.43 
 
 		 639 aa  73.9  0.000000000007  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.741277  normal  0.763255 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4121  beta-lactamase domain-containing protein  26.48 
 
 		 457 aa  73.9  0.000000000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.729695 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0082  beta-lactamase domain-containing protein  25 
 
 		 635 aa  73.6  0.000000000009  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0966  beta-lactamase domain protein  25.75 
 
 		 641 aa  73.6  0.00000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0461  hypothetical protein  22.45 
 
 		 390 aa  73.2  0.00000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1210  beta-lactamase-like  23.32 
 
 		 453 aa  73.6  0.00000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.856378  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0096  beta-lactamase-like  27.88 
 
 		 411 aa  73.2  0.00000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.619146  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0260  putative mRNA 3-end processing factor  23.49 
 
 		 344 aa  72.8  0.00000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00946134 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0913  putative exonuclease protein involved in mRNA processing  22.69 
 
 		 336 aa  72.8  0.00000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.228952 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1043  putative mRNA 3-end processing factor  24.12 
 
 		 319 aa  72.4  0.00000000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.0008566 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0801  putative exonuclease protein involved in mRNA processing  22.69 
 
 		 336 aa  72.4  0.00000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.157265 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_07841  beta-lactamase fold exonuclease  23.72 
 
 		 328 aa  72.8  0.00000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.110589  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5891  beta-lactamase domain-containing protein  25.07 
 
 		 467 aa  72  0.00000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.273287  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3879  beta-lactamase-like  24.41 
 
 		 452 aa  72  0.00000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.486794  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1299  beta-lactamase domain protein  23.13 
 
 		 470 aa  72  0.00000000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.591175  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3180  beta-lactamase domain-containing protein  22.95 
 
 		 452 aa  72  0.00000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001774  metallo-beta-lactamase family protein RNA-specific  23.06 
 
 		 441 aa  70.9  0.00000000006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.122303  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1967  beta-lactamase-like  21.75 
 
 		 454 aa  70.9  0.00000000007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.166456  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1796  beta-lactamase domain protein  26.94 
 
 		 414 aa  70.9  0.00000000007  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0539  RNA-metabolizing metallo-beta-lactamase  23.73 
 
 		 480 aa  70.5  0.00000000008  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3492  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  23.73 
 
 		 480 aa  70.5  0.00000000008  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_89936  predicted protein  21.29 
 
 		 793 aa  70.5  0.00000000009  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.731556  normal  0.295472 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6202  beta-lactamase domain-containing protein  24.54 
 
 		 470 aa  70.1  0.0000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.19774 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3953  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  23.85 
 
 		 480 aa  70.1  0.0000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0726  beta-lactamase domain protein  23.97 
 
 		 465 aa  70.1  0.0000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.723322 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0992  Beta-lactamase-like:RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  23.7 
 
 		 470 aa  70.1  0.0000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3232  beta-lactamase domain-containing protein  22.56 
 
 		 489 aa  70.1  0.0000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0768  beta-lactamase domain protein  21.99 
 
 		 451 aa  70.1  0.0000000001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  decreased coverage  0.000108746  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3827  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  23.85 
 
 		 480 aa  70.1  0.0000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1266  beta-lactamase-like protein  23.82 
 
 		 469 aa  70.1  0.0000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.23851  normal  0.0118241 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0019  beta-lactamase-like protein  21.71 
 
 		 813 aa  69.7  0.0000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3334  beta-lactamase domain-containing protein  23.6 
 
 		 478 aa  68.9  0.0000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0845  beta-lactamase-like  24.5 
 
 		 629 aa  69.3  0.0000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.554835  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2642  hypothetical protein  23.06 
 
 		 455 aa  69.3  0.0000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>