98 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_4129 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008541  Arth_4129  intradiol ring-cleavage dioxygenase  100 
 
 		 303 aa  615  1e-175  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3911  intradiol ring-cleavage dioxygenase  74.58 
 
 		 308 aa  424  1e-118  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0924  intradiol ring-cleavage dioxygenase  49.33 
 
 		 318 aa  288  6e-77  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0108  twin-arginine translocation pathway signal  49.49 
 
 		 327 aa  285  5e-76  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.582013 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3841  intradiol ring-cleavage dioxygenase  48.15 
 
 		 343 aa  275  8e-73  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.353412  normal  0.439298 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2526  intradiol ring-cleavage dioxygenase  48.49 
 
 		 331 aa  266  2.9999999999999995e-70  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4377  intradiol ring-cleavage dioxygenase  50.35 
 
 		 319 aa  265  5.999999999999999e-70  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3940  intradiol ring-cleavage dioxygenase  48.82 
 
 		 325 aa  264  1e-69  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00187002 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3783  intradiol ring-cleavage dioxygenase  47.8 
 
 		 328 aa  261  1e-68  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.83161  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1781  intradiol ring-cleavage dioxygenase  55.88 
 
 		 323 aa  254  2.0000000000000002e-66  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.453856  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16460  protocatechuate 3,4-dioxygenase beta subunit  44.78 
 
 		 294 aa  248  1e-64  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.574366  normal  0.703195 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2841  intradiol ring-cleavage dioxygenase  49.53 
 
 		 304 aa  217  2e-55  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1809  intradiol ring-cleavage dioxygenase  51.16 
 
 		 311 aa  217  2e-55  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.510661  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3143  intradiol ring-cleavage dioxygenase  40.26 
 
 		 310 aa  213  2.9999999999999995e-54  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.529872  hitchhiker  0.00328294 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04370  protocatechuate 3,4-dioxygenase beta subunit  46.37 
 
 		 349 aa  213  2.9999999999999995e-54  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1876  intradiol ring-cleavage dioxygenase  42.81 
 
 		 313 aa  206  3e-52  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.103516  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2243  intradiol ring-cleavage dioxygenase  37.5 
 
 		 250 aa  130  3e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3769  intradiol ring-cleavage dioxygenase  35.27 
 
 		 237 aa  119  3.9999999999999996e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1680  intradiol ring-cleavage dioxygenase  34.76 
 
 		 236 aa  115  8.999999999999998e-25  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1587  intradiol ring-cleavage dioxygenase  31.94 
 
 		 299 aa  113  4.0000000000000004e-24  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0945  intradiol ring-cleavage dioxygenase  32.26 
 
 		 288 aa  112  5e-24  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3523  intradiol ring-cleavage dioxygenase  34.04 
 
 		 288 aa  101  1e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3772  intradiol ring-cleavage dioxygenase  31.16 
 
 		 281 aa  97.4  2e-19  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2416  intradiol ring-cleavage dioxygenase  30.66 
 
 		 256 aa  97.4  3e-19  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2095  intradiol ring-cleavage dioxygenase  33.19 
 
 		 245 aa  97.1  3e-19  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.781627  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1176  intradiol ring-cleavage dioxygenase  33.88 
 
 		 244 aa  97.4  3e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1128  protocatechuate 3 4-dioxygenase beta subunit like protein  31.25 
 
 		 252 aa  94  2e-18  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.608028  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2843  intradiol ring-cleavage dioxygenase  37.43 
 
 		 233 aa  90.5  4e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3212  intradiol ring-cleavage dioxygenase  32.86 
 
 		 250 aa  88.2  2e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.302097  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5241  twin-arginine translocation pathway signal  35.62 
 
 		 238 aa  88.2  2e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1942  intradiol ring-cleavage dioxygenase  34.48 
 
 		 234 aa  87  3e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.842989  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0037  intradiol ring-cleavage dioxygenase  33.03 
 
 		 237 aa  85.9  7e-16  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4772  intradiol ring-cleavage dioxygenase  37.86 
 
 		 309 aa  84.3  0.000000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7382  putative intradiol ring-cleavage dioxygenase  40.46 
 
 		 266 aa  82.4  0.000000000000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.203989  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0789  intradiol ring-cleavage dioxygenase  29.59 
 
 		 277 aa  81.6  0.00000000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0716  dioxygenase family protein  29.59 
 
 		 277 aa  81.6  0.00000000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0187  hypothetical protein  29.59 
 
 		 277 aa  81.6  0.00000000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00856526  hitchhiker  0.0000433457 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4839  intradiol ring-cleavage dioxygenase  30.95 
 
 		 282 aa  81.3  0.00000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5275  putative intradiol ring-cleavage dioxygenase  38.52 
 
 		 277 aa  77.8  0.0000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.317456  normal  0.187016 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1202  twin-arginine translocation pathway signal  32.16 
 
 		 252 aa  76.3  0.0000000000005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3226  intradiol ring-cleavage dioxygenase  33.73 
 
 		 248 aa  76.3  0.0000000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.281874 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4360  intradiol ring-cleavage dioxygenase  32.39 
 
 		 238 aa  75.5  0.000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01301  conserved hypothetical protein  28.1 
 
 		 383 aa  75.5  0.000000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2567  intradiol ring-cleavage dioxygenase  35.04 
 
 		 258 aa  70.9  0.00000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07161  extracellular dioxygenase, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G03070)  28.51 
 
 		 377 aa  69.7  0.00000000005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0585073  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2254  intradiol ring-cleavage dioxygenase  34.31 
 
 		 258 aa  69.7  0.00000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.802404 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05328  GPI anchored dioxygenase, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G01800)  30.38 
 
 		 396 aa  65.5  0.000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.628853  normal  1 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05398  extracellular dioxygenase, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G14630)  29.67 
 
 		 376 aa  64.7  0.000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_09268  conserved hypothetical protein  29.2 
 
 		 280 aa  60.5  0.00000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_04203  conserved hypothetical protein  26.83 
 
 		 343 aa  59.7  0.00000006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.587359 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3903  intradiol ring-cleavage dioxygenase  31.08 
 
 		 327 aa  58.9  0.0000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0806083 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1486  intradiol ring-cleavage dioxygenase  40.28 
 
 		 220 aa  55.1  0.000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0474  intradiol ring-cleavage dioxygenase  30.83 
 
 		 247 aa  55.8  0.000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7854  Protocatechuate 3 4-dioxygenase beta subunit- like protein  38.2 
 
 		 277 aa  55.5  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2592  intradiol ring-cleavage dioxygenase  40.91 
 
 		 193 aa  53.9  0.000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2988  intradiol ring-cleavage dioxygenase  32.12 
 
 		 228 aa  52.4  0.000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_07946  conserved hypothetical protein  35.71 
 
 		 280 aa  52.8  0.000008  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006692  CNG03340  conserved hypothetical protein  25.5 
 
 		 318 aa  52  0.00001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0104433  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4881  Catechol 1,2-dioxygenase  32.62 
 
 		 307 aa  51.6  0.00002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.405251  normal  0.494696 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4070  intradiol ring-cleavage dioxygenase  33.33 
 
 		 192 aa  50.8  0.00003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0120  intradiol ring-cleavage dioxygenase  33.33 
 
 		 191 aa  50.1  0.00005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0339331 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3458  intradiol ring-cleavage dioxygenase  32.63 
 
 		 216 aa  49.3  0.00007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.898737  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2786  intradiol ring-cleavage dioxygenase  37.31 
 
 		 190 aa  47.8  0.0002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.228941  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1176  catechol 1,2-dioxygenase  31.45 
 
 		 312 aa  47.8  0.0002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.598074  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3237  catechol 1,2-dioxygenase  35.71 
 
 		 311 aa  47.4  0.0003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.315319 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1307  catechol 1,2-dioxygenase  30.58 
 
 		 316 aa  46.2  0.0006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6523  catechol 1,2-dioxygenase  30.58 
 
 		 316 aa  46.2  0.0006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2372  catechol 1,2-dioxygenase  34.88 
 
 		 309 aa  46.2  0.0007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7045  catechol 1,2-dioxygenase  36 
 
 		 314 aa  45.1  0.001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.274631 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6300  catechol 1,2-dioxygenase  30.89 
 
 		 317 aa  45.8  0.001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00636694 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6585  catechol 1,2-dioxygenase  30.89 
 
 		 314 aa  45.4  0.001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.933821 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5025  protocatechuate 3,4-dioxygenase, beta subunit  29.71 
 
 		 233 aa  45.1  0.002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.32623  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5063  hydroxyquinol 1,2-dioxygenase  28.03 
 
 		 309 aa  44.3  0.002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2441  intradiol ring-cleavage dioxygenase  40.79 
 
 		 301 aa  44.7  0.002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1328  catechol 1,2-dioxygenase  35.37 
 
 		 313 aa  45.1  0.002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.27374  normal  0.0586972 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1933  catechol 1,2-dioxygenase  35 
 
 		 297 aa  43.9  0.003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6130  catechol 1,2-dioxygenase  30.08 
 
 		 316 aa  44.3  0.003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4357  catechol 1,2-dioxygenase  33.73 
 
 		 304 aa  44.3  0.003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1351  protocatechuate 3,4-dioxygenase, beta subunit  35.09 
 
 		 244 aa  43.9  0.004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.010139  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1427  catechol 1,2-dioxygenase  41.82 
 
 		 311 aa  43.5  0.004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.322187 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0394  protocatechuate 3,4-dioxygenase, beta subunit  35.09 
 
 		 234 aa  43.5  0.004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.187163  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0245  protocatechuate 3,4-dioxygenase, beta subunit  35.09 
 
 		 244 aa  43.9  0.004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  0.000128841  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1845  protocatechuate 3,4-dioxygenase, beta subunit  35.09 
 
 		 244 aa  43.9  0.004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0795201  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1760  protocatechuate 3,4-dioxygenase, beta subunit  35.09 
 
 		 244 aa  43.9  0.004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  decreased coverage  0.00117633  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1849  protocatechuate 3,4-dioxygenase, beta subunit  31.41 
 
 		 234 aa  43.9  0.004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0318  protocatechuate 3,4-dioxygenase, beta subunit  35.09 
 
 		 234 aa  43.5  0.004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1363  catechol 1,2-dioxygenase  41.82 
 
 		 311 aa  43.5  0.004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0971616  normal  0.0619689 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0981  protocatechuate 3,4-dioxygenase, beta subunit  35.09 
 
 		 234 aa  43.5  0.004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  decreased coverage  0.00626299  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0130  intradiol ring-cleavage dioxygenase  39.44 
 
 		 300 aa  43.1  0.005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1294  catechol 1,2-dioxygenase  40.74 
 
 		 283 aa  43.5  0.005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2732  catechol 1,2-dioxygenase  29.81 
 
 		 310 aa  43.1  0.005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4013  protocatechuate (dihdydroxy benzoate) 3,4-dioxygenase subunit beta  26.76 
 
 		 237 aa  43.1  0.006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5941  protocatechuate 3,4-dioxygenase, beta subunit  28.33 
 
 		 249 aa  43.1  0.006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0409676 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3128  intradiol ring-cleavage dioxygenase  30.39 
 
 		 317 aa  43.1  0.006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0702064  normal  0.886792 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7079  protocatechuate 3,4-dioxygenase, beta subunit  27.5 
 
 		 249 aa  42.7  0.007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0898388  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1590  catechol 1,2-dioxygenase  40.98 
 
 		 311 aa  42.7  0.008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.31335  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1912  intradiol ring-cleavage dioxygenase  31.62 
 
 		 312 aa  42.4  0.009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.806008  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1782  intradiol ring-cleavage dioxygenase  32.35 
 
 		 287 aa  42.4  0.01  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0988363  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>