More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_2743 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008541  Arth_2743  PDZ/DHR/GLGF domain-containing protein  100 
 
 		 545 aa  1067    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2466  PDZ/DHR/GLGF domain protein  64.54 
 
 		 556 aa  544  1e-153  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000469127 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3273  Trypsin-like protein serine protease typically periplasmic containing C-terminal PDZ domain-like protein  43.72 
 
 		 485 aa  249  7e-65  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7239  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  45.78 
 
 		 569 aa  249  1e-64  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.108633  normal  0.212332 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1904  HtrA2 peptidase  46.71 
 
 		 423 aa  243  7e-63  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.775402  normal  0.334422 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0658  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  43.75 
 
 		 434 aa  239  1e-61  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0353  trypsin-like serine protease  44.84 
 
 		 583 aa  238  2e-61  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.326819  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4679  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  38.31 
 
 		 440 aa  231  2e-59  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0383364 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4299  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  38.31 
 
 		 440 aa  231  2e-59  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.143756  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4385  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  38.31 
 
 		 440 aa  231  2e-59  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0459  2-alkenal reductase  39.71 
 
 		 584 aa  231  4e-59  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21640  trypsin-like serine protease with C-terminal PDZ domain  42.22 
 
 		 417 aa  226  7e-58  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  decreased coverage  0.00345268  normal  0.0571371 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0069  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  44.48 
 
 		 579 aa  221  1.9999999999999999e-56  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3684  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  38.25 
 
 		 518 aa  221  3e-56  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.358044  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07340  trypsin-like serine protease with C-terminal PDZ domain  35.4 
 
 		 552 aa  216  9.999999999999999e-55  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.191801 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0620  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  41.3 
 
 		 674 aa  214  3.9999999999999995e-54  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.5236  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32730  trypsin-like serine protease with C-terminal PDZ domain protein  41.42 
 
 		 443 aa  213  4.9999999999999996e-54  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.229019  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4062  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  43.53 
 
 		 524 aa  213  7e-54  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.286322 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11001  serine protease pepD  43.4 
 
 		 464 aa  213  9e-54  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000053367  normal  0.424973 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0886  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  41.64 
 
 		 916 aa  211  2e-53  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.421013 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1398  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  43.29 
 
 		 349 aa  211  2e-53  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.515072  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1889  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  40.29 
 
 		 515 aa  211  3e-53  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.271087 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1593  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  40.92 
 
 		 512 aa  210  4e-53  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.421913  normal  0.822638 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5199  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  40.66 
 
 		 640 aa  210  5e-53  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.219359  normal  0.800514 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5142  PDZ/DHR/GLGF domain-containing protein  41.23 
 
 		 614 aa  210  7e-53  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.309432  normal  0.441282 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2919  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  39.09 
 
 		 558 aa  208  2e-52  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.101168  hitchhiker  0.00800528 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10940  trypsin-like serine protease with C-terminal PDZ domain protein  41.96 
 
 		 539 aa  207  3e-52  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  decreased coverage  0.0000345024  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2158  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  42.99 
 
 		 507 aa  207  3e-52  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0489221  normal  0.0113989 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0884  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  41.67 
 
 		 417 aa  206  6e-52  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.63894  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24150  trypsin-like serine protease with C-terminal PDZ domain  34.48 
 
 		 515 aa  206  8e-52  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2476  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  39.57 
 
 		 486 aa  206  1e-51  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4006  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  32.41 
 
 		 497 aa  205  2e-51  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.503851  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8413  Trypsin-like protein serine protease typically periplasmic containing C-terminal PDZ domain-like protein  37.91 
 
 		 527 aa  205  2e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.595687  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1186  HtrA2 peptidase  38.86 
 
 		 597 aa  204  4e-51  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.934322  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1008  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  37.72 
 
 		 487 aa  202  9e-51  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4842  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  40.12 
 
 		 456 aa  201  1.9999999999999998e-50  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.369386 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0705  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  39.88 
 
 		 439 aa  199  1.0000000000000001e-49  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3830  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  40.06 
 
 		 515 aa  199  1.0000000000000001e-49  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.778945  normal  0.0341938 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06450  trypsin-like serine protease with C-terminal PDZ domain protein  40.12 
 
 		 517 aa  199  1.0000000000000001e-49  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1859  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  39.5 
 
 		 544 aa  198  2.0000000000000003e-49  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.308507  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3622  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  44.06 
 
 		 486 aa  196  1e-48  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0344622  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3992  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  35.48 
 
 		 501 aa  195  1e-48  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4066  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  35.48 
 
 		 501 aa  195  1e-48  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3234  2-alkenal reductase  38.46 
 
 		 575 aa  195  2e-48  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.222667  normal  0.0363808 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3284  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  36.44 
 
 		 420 aa  195  2e-48  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.71487  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1212  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  39.3 
 
 		 471 aa  194  2e-48  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.152583  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0507  trypsin-like serine protease  35.95 
 
 		 489 aa  194  3e-48  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0856  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  38.96 
 
 		 475 aa  193  7e-48  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0131628  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0850  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  38.96 
 
 		 475 aa  193  7e-48  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0867  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  38.96 
 
 		 475 aa  193  7e-48  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0797  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  38.37 
 
 		 512 aa  192  1e-47  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0534  2-alkenal reductase  39 
 
 		 395 aa  191  2.9999999999999997e-47  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11247  serine protease htrA  36.71 
 
 		 528 aa  191  4e-47  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.039312  hitchhiker  0.00292251 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2721  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  39.56 
 
 		 545 aa  189  1e-46  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.331753  normal  0.316507 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3032  Serine protease do-like precursor  37.95 
 
 		 365 aa  189  1e-46  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.722688 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1344  trypsin  38.37 
 
 		 594 aa  187  3e-46  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.0379667 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2202  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  37.96 
 
 		 497 aa  187  5e-46  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.718376  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2320  PDZ/DHR/GLGF  36.19 
 
 		 351 aa  186  9e-46  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.47953 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1673  protease Do  41.16 
 
 		 505 aa  186  1.0000000000000001e-45  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0684799  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1353  trypsin-like serine protease  40.18 
 
 		 673 aa  185  2.0000000000000003e-45  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4494  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  37.04 
 
 		 496 aa  185  2.0000000000000003e-45  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.18457  normal  0.102663 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3457  protease Do  39.56 
 
 		 476 aa  183  7e-45  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2934  trypsin-like serine protease  38.56 
 
 		 374 aa  183  8.000000000000001e-45  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3298  peptidase S1C, Do  40.25 
 
 		 511 aa  183  8.000000000000001e-45  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0813  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  41.06 
 
 		 485 aa  182  2e-44  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3888  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  35.14 
 
 		 506 aa  181  2e-44  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1007  protease Do  39.44 
 
 		 453 aa  181  2e-44  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.00000000215082  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1305  2-alkenal reductase  35.75 
 
 		 389 aa  182  2e-44  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3394  protease Do  38.92 
 
 		 476 aa  181  4e-44  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0792545  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25880  trypsin-like serine protease with C-terminal PDZ domain  38.12 
 
 		 537 aa  180  7e-44  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2464  HtrA2 peptidase  32.26 
 
 		 415 aa  179  8e-44  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23630  trypsin-like serine protease with C-terminal PDZ domain  35.9 
 
 		 577 aa  179  1e-43  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.31083 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0100  protease DO  38.24 
 
 		 456 aa  179  1e-43  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000901293  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0031  protease Do  38.24 
 
 		 453 aa  179  1e-43  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00831551  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1855  protease Do  39.44 
 
 		 504 aa  179  1e-43  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.19147  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0712  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  40.41 
 
 		 426 aa  179  1e-43  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.482576 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1115  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  38.14 
 
 		 442 aa  179  2e-43  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0193596  normal  0.0193298 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2857  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  36.28 
 
 		 394 aa  179  2e-43  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.122647  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0715  protease Do  39.31 
 
 		 500 aa  178  3e-43  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00445387  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3242  putative trypsin-like serine protease  36.36 
 
 		 483 aa  178  3e-43  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.263085  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1750  2-alkenal reductase  35.39 
 
 		 418 aa  177  3e-43  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.137948  normal  0.435495 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3978  protease Do  36.36 
 
 		 483 aa  178  3e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0104728  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3965  protease Do  37.65 
 
 		 514 aa  177  4e-43  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.938465  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2149  2-alkenal reductase  34.65 
 
 		 412 aa  177  4e-43  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0134489  hitchhiker  0.00552688 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0879  protease Do  37.19 
 
 		 476 aa  177  5e-43  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000781376  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3025  2-alkenal reductase  38.77 
 
 		 413 aa  177  6e-43  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0951822  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1270  serine protease  37.5 
 
 		 442 aa  176  7e-43  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  unclonable  0.000000000000478038  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0171  serine endoprotease  38.17 
 
 		 474 aa  176  7e-43  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0166  serine endoprotease  38.17 
 
 		 474 aa  176  8e-43  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0165  serine endoprotease  38.17 
 
 		 474 aa  176  8e-43  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0977  protease do  36.74 
 
 		 471 aa  176  8e-43  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00160  serine endoprotease (protease Do), membrane-associated  38.17 
 
 		 474 aa  176  9.999999999999999e-43  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3441  protease Do  38.17 
 
 		 474 aa  176  9.999999999999999e-43  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3498  serine endoprotease  38.17 
 
 		 474 aa  176  9.999999999999999e-43  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0154  serine endoprotease  38.17 
 
 		 474 aa  176  9.999999999999999e-43  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02461  serine protease  36.42 
 
 		 395 aa  176  9.999999999999999e-43  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1580  2-alkenal reductase  36.5 
 
 		 443 aa  175  1.9999999999999998e-42  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0204264 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0494  peptidase S1C, Do  40.89 
 
 		 506 aa  175  1.9999999999999998e-42  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1014  peptidase S1C, Do  36.73 
 
 		 476 aa  175  1.9999999999999998e-42  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3437  peptidase S1C, Do  37.5 
 
 		 472 aa  175  1.9999999999999998e-42  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>