252 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_2608 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008541  Arth_2608  ATP synthase F1, delta subunit  100 
 
 		 275 aa  539  9.999999999999999e-153  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.31166  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2341  ATP synthase F1, delta subunit  85.82 
 
 		 275 aa  424  1e-118  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000891359 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1267  ATP synthase F1, delta subunit  41.01 
 
 		 276 aa  183  3e-45  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.1417 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08150  ATP synthase, F1 delta subunit  42.75 
 
 		 271 aa  176  2e-43  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1215  F0F1 ATP synthase subunit delta  37.28 
 
 		 271 aa  167  2e-40  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2410  F0F1 ATP synthase subunit delta  37.55 
 
 		 269 aa  165  5.9999999999999996e-40  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3919  ATP synthase F1, delta subunit  38.27 
 
 		 275 aa  163  3e-39  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1777  ATP synthase F1, delta subunit  34.05 
 
 		 271 aa  159  6e-38  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0897  ATP synthase F1 subunit delta  36.4 
 
 		 269 aa  157  2e-37  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.856664 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0333  ATP synthase F1, delta subunit  34.75 
 
 		 274 aa  157  2e-37  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.397871 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2123  ATP synthase F1, delta subunit  35.82 
 
 		 274 aa  150  2e-35  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00290566  hitchhiker  0.00595269 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10000  ATP synthase, F1 delta subunit  33.45 
 
 		 271 aa  148  9e-35  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.179635  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6139  ATP synthase F1, delta subunit  35.2 
 
 		 275 aa  147  2.0000000000000003e-34  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0650  F0F1 ATP synthase subunit delta  33.81 
 
 		 274 aa  145  5e-34  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.299616  normal  0.3492 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19160  ATP synthase, F1 delta subunit  34.3 
 
 		 271 aa  142  6e-33  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1304  ATP synthase F1, delta subunit  35.86 
 
 		 271 aa  142  8e-33  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.141889  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2451  ATP synthase F1, delta subunit  36.56 
 
 		 271 aa  135  9.999999999999999e-31  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1668  F0F1-type ATP synthase delta subunit-like protein  35.83 
 
 		 270 aa  133  3e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1760  ATP synthase F1, delta subunit  34.66 
 
 		 275 aa  129  4.0000000000000003e-29  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.337923  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29580  ATP synthase, F1 delta subunit  34.4 
 
 		 273 aa  129  5.0000000000000004e-29  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4015  ATP synthase F1, delta subunit  33.33 
 
 		 274 aa  125  7e-28  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000505558 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1313  ATP synthase F1 subunit delta  29.43 
 
 		 275 aa  120  3e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.357155  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_18230  ATP synthase, F1 delta subunit  29.14 
 
 		 271 aa  119  4.9999999999999996e-26  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.524835  normal  0.215855 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4139  ATP synthase F1, delta subunit  32.94 
 
 		 290 aa  118  9.999999999999999e-26  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.390254  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1069  ATP synthase F1, delta subunit  37.2 
 
 		 270 aa  113  3e-24  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2315  F0F1 ATP synthase subunit delta  32.1 
 
 		 445 aa  109  4.0000000000000004e-23  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3879  F0F1 ATP synthase subunit delta  29.84 
 
 		 443 aa  109  4.0000000000000004e-23  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3953  F0F1 ATP synthase subunit delta  29.84 
 
 		 443 aa  109  4.0000000000000004e-23  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0109284 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3865  F0F1 ATP synthase subunit delta  29.84 
 
 		 443 aa  109  4.0000000000000004e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0308391 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4331  F0F1 ATP synthase subunit delta  30.87 
 
 		 445 aa  109  5e-23  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0727186 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1918  ATP synthase F1, delta subunit  30.99 
 
 		 449 aa  108  1e-22  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3633  ATP synthase F1, delta subunit  32.3 
 
 		 274 aa  108  1e-22  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.254759  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1126  F0F1 ATP synthase subunit delta  29.6 
 
 		 278 aa  108  1e-22  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1252  ATP synthase F1, delta subunit  30.52 
 
 		 448 aa  99.4  7e-20  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.849245  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11334  F0F1 ATP synthase subunit delta  27.35 
 
 		 446 aa  94.4  2e-18  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1021  F0F1 ATP synthase subunit delta  29.47 
 
 		 279 aa  90.9  2e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3710  F0F1 ATP synthase subunit delta  27.06 
 
 		 276 aa  86.7  3e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0177  F0F1 ATP synthase subunit delta  27.85 
 
 		 186 aa  70.1  0.00000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3153  F0F1 ATP synthase subunit delta  29.41 
 
 		 181 aa  70.1  0.00000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0405  F0F1 ATP synthase subunit delta  27.04 
 
 		 186 aa  69.3  0.00000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.973166  normal  0.0739759 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1223  F0F1 ATP synthase subunit delta  32.08 
 
 		 186 aa  64.7  0.000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3515  F0F1 ATP synthase subunit delta  37.04 
 
 		 178 aa  63.9  0.000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.218117  hitchhiker  0.000331491 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2168  ATP synthase F1, delta subunit  35.14 
 
 		 178 aa  63.5  0.000000003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000494918  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3497  F0F1 ATP synthase subunit delta  33.96 
 
 		 180 aa  63.9  0.000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0214054  normal  0.242714 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3320  F0F1 ATP synthase subunit delta  37.96 
 
 		 178 aa  63.5  0.000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.0028725  normal  0.130024 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3190  F0F1 ATP synthase subunit delta  37.04 
 
 		 178 aa  63.2  0.000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0174  F0F1 ATP synthase subunit delta  32.94 
 
 		 186 aa  63.2  0.000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0487  F0F1 ATP synthase subunit delta  34.75 
 
 		 182 aa  63.2  0.000000005  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.298952  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0066  ATP synthase F1, delta subunit  29.01 
 
 		 179 aa  62.4  0.000000008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0268  F0F1 ATP synthase subunit delta  32.94 
 
 		 186 aa  62  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.397097 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2847  ATP synthase F1, delta subunit  27.4 
 
 		 179 aa  62  0.00000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.187337 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06107  ATP synthase F1, delta subunit  37.66 
 
 		 180 aa  61.2  0.00000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1462  ATP synthase F1, delta subunit  28.76 
 
 		 194 aa  61.2  0.00000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.47648  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0429  F0F1 ATP synthase subunit delta  31.76 
 
 		 186 aa  60.8  0.00000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.675771  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2925  F0F1 ATP synthase subunit delta  28.85 
 
 		 188 aa  60.8  0.00000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6065  ATP synthase F1, delta subunit  30.38 
 
 		 179 aa  60.8  0.00000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4168  F0F1 ATP synthase subunit delta  30.97 
 
 		 182 aa  61.2  0.00000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0816987  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0023  ATP synthase F1, delta subunit  44.3 
 
 		 178 aa  60.5  0.00000003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0910717  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0145  ATP synthase F1, delta subunit  42.42 
 
 		 193 aa  60.1  0.00000004  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0533  F0F1 ATP synthase subunit delta  25.95 
 
 		 186 aa  59.7  0.00000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3215  F0F1 ATP synthase subunit delta  27.63 
 
 		 180 aa  59.3  0.00000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.270872  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0019  ATP synthase F1, delta subunit  43.04 
 
 		 178 aa  59.3  0.00000007  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.000000168594  hitchhiker  0.000447823 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1735  F0F1 ATP synthase subunit delta  28.48 
 
 		 186 aa  58.9  0.00000008  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1802  F0F1 ATP synthase subunit delta  28.48 
 
 		 186 aa  58.9  0.00000009  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.145572  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3897  F0F1 ATP synthase subunit delta  33.81 
 
 		 179 aa  58.9  0.00000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.890159  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1102  F0F1 ATP synthase subunit delta  29.14 
 
 		 186 aa  58.5  0.0000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4794  F0F1 ATP synthase subunit delta  27.74 
 
 		 178 aa  58.5  0.0000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.163043  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0509  F0F1-type ATP synthase delta subunit-like protein  34.29 
 
 		 135 aa  58.5  0.0000001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2399  F0F1 ATP synthase subunit delta  25.63 
 
 		 190 aa  57.8  0.0000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2455  F0F1 ATP synthase subunit delta  23.2 
 
 		 179 aa  58.2  0.0000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1678  ATP synthase F1, delta subunit  33.94 
 
 		 197 aa  57  0.0000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2385  ATP synthase F1 delta subunit  38.33 
 
 		 182 aa  56.6  0.0000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3030  F0F1 ATP synthase subunit delta  35.58 
 
 		 179 aa  56.6  0.0000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2605  ATP synthase F1, delta subunit  24.64 
 
 		 188 aa  56.6  0.0000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3529  F0F1 ATP synthase subunit delta  40.98 
 
 		 177 aa  56.2  0.0000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0244392 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2952  F0F1 ATP synthase subunit delta  33.64 
 
 		 179 aa  56.2  0.0000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.226604  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2165  F0F1 ATP synthase subunit delta  22.65 
 
 		 179 aa  56.2  0.0000006  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0103  F0F1 ATP synthase subunit delta  33.64 
 
 		 179 aa  56.2  0.0000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0559682  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0477  F0F1 ATP synthase subunit delta  36.14 
 
 		 183 aa  56.2  0.0000006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.199048  normal  0.651283 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0119  F0F1 ATP synthase subunit delta  33.64 
 
 		 179 aa  56.2  0.0000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.231197  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4110  F0F1 ATP synthase subunit delta  27.61 
 
 		 193 aa  55.8  0.0000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0037  F0F1 ATP synthase subunit delta  33.81 
 
 		 179 aa  55.8  0.0000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0129228  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0515  H+-transporting two-sector ATPase, delta (OSCP) subunit  44.07 
 
 		 158 aa  55.5  0.0000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.169103  normal  0.589792 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2800  F-type H+-transporting ATP synthase, delta (OSCP) subunit  30 
 
 		 178 aa  55.1  0.000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.31614  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0324  F0F1 ATP synthase subunit delta  43.28 
 
 		 176 aa  55.1  0.000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.201646  normal  0.377172 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0556  F0F1 ATP synthase subunit delta  30 
 
 		 186 aa  55.1  0.000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0985785 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0103  F0F1 ATP synthase subunit delta  33.64 
 
 		 179 aa  55.5  0.000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.163792  normal  0.702124 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0620  F0F1 ATP synthase subunit delta  29.07 
 
 		 184 aa  55.1  0.000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0094  F0F1 ATP synthase subunit delta  33.64 
 
 		 179 aa  55.5  0.000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.244879  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0252  F0F1 ATP synthase subunit delta  43.28 
 
 		 179 aa  55.1  0.000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1268  H+transporting two-sector ATPase delta (OSCP) subunit  42.37 
 
 		 158 aa  54.7  0.000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3655  F0F1 ATP synthase subunit delta  24.05 
 
 		 188 aa  54.3  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2027  F0F1 ATP synthase subunit delta  31.45 
 
 		 207 aa  54.7  0.000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.00873114  normal  0.0511628 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3349  F0F1 ATP synthase subunit delta  31.13 
 
 		 179 aa  54.7  0.000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.363795  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3944  F0F1 ATP synthase subunit delta  24.05 
 
 		 188 aa  54.3  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.754294  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3285  F0F1 ATP synthase subunit delta  33.64 
 
 		 179 aa  54.7  0.000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.724178  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1028  ATP synthase F1, delta subunit  22.67 
 
 		 173 aa  54.7  0.000002  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2805  ATP synthase F1, delta subunit  32.48 
 
 		 179 aa  54.7  0.000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.365033  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0103  F0F1 ATP synthase subunit delta  33.64 
 
 		 179 aa  54.3  0.000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00560737  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2192  F0F1 ATP synthase subunit delta  27.01 
 
 		 183 aa  54.3  0.000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>