More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_0968 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008541  Arth_0968  UspA domain-containing protein  100 
 
 		 151 aa  305  2.0000000000000002e-82  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.848779  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1740  UspA domain-containing protein  77.46 
 
 		 159 aa  222  2e-57  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0341137  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1742  UspA domain-containing protein  53.02 
 
 		 144 aa  139  9e-33  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0436973  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1447  UspA domain protein  40.82 
 
 		 147 aa  95.1  3e-19  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1412  hypothetical protein  45.99 
 
 		 305 aa  87.8  5e-17  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.48566  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1900  UspA domain-containing protein  41.84 
 
 		 277 aa  87.8  5e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0128633  normal  0.168058 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2760  hypothetical protein  42.45 
 
 		 339 aa  85.5  2e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1131  UspA domain-containing protein  41.13 
 
 		 138 aa  84.7  4e-16  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.922965  normal  0.348983 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0396  UspA domain-containing protein  44.06 
 
 		 155 aa  84  7e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0315  UspA domain-containing protein  44.83 
 
 		 146 aa  83.6  9e-16  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.242735  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5216  UspA domain-containing protein  40 
 
 		 298 aa  83.2  0.000000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.366232  normal  0.453672 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3451  UspA domain-containing protein  35.92 
 
 		 293 aa  82.4  0.000000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.936527 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3812  UspA domain protein  37.86 
 
 		 143 aa  82.4  0.000000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2190  UspA domain-containing protein  42.76 
 
 		 148 aa  80.9  0.000000000000006  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2042  UspA domain protein  41.26 
 
 		 277 aa  80.5  0.000000000000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000218244  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3475  UspA domain-containing protein  37.67 
 
 		 291 aa  80.5  0.000000000000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4822  UspA domain-containing protein  38.03 
 
 		 289 aa  79.7  0.00000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3659  UspA domain-containing protein  37.32 
 
 		 293 aa  79.7  0.00000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.153996  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3476  UspA domain-containing protein  31.88 
 
 		 296 aa  77  0.00000000000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2334  UspA domain-containing protein  35.33 
 
 		 290 aa  77.4  0.00000000000007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3775  UspA domain-containing protein  41.26 
 
 		 138 aa  77  0.00000000000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.309835  normal  0.427023 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1111  UspA domain protein  42.18 
 
 		 321 aa  77  0.00000000000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.213436  normal  0.375797 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1891  UspA domain-containing protein  37.59 
 
 		 277 aa  76.6  0.0000000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.098004  hitchhiker  0.00323142 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0913  UspA domain-containing protein  39.16 
 
 		 138 aa  76.6  0.0000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0346302 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0776  UspA domain protein  39.29 
 
 		 308 aa  75.5  0.0000000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3621  hypothetical protein  40.97 
 
 		 293 aa  75.9  0.0000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.820337  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3694  UspA domain-containing protein  40.97 
 
 		 293 aa  75.9  0.0000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.34077  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1097  hypothetical protein  33.78 
 
 		 294 aa  75.1  0.0000000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.185588  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3457  UspA domain-containing protein  38.57 
 
 		 159 aa  75.1  0.0000000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1125  UspA domain-containing protein  33.78 
 
 		 294 aa  75.1  0.0000000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1114  UspA domain-containing protein  33.78 
 
 		 294 aa  75.1  0.0000000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.98551 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3626  UspA domain-containing protein  40.28 
 
 		 293 aa  74.7  0.0000000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.208272  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4831  hypothetical protein  40.85 
 
 		 292 aa  74.7  0.0000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.335515  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3447  UspA domain-containing protein  35.71 
 
 		 296 aa  74.3  0.0000000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.728231  normal  0.505813 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1274  UspA domain-containing protein  35 
 
 		 145 aa  74.3  0.0000000000005  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.331528 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1912  UspA domain protein  40.71 
 
 		 155 aa  74.3  0.0000000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3658  UspA domain-containing protein  33.8 
 
 		 296 aa  73.6  0.0000000000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0641627  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1963  UspA domain-containing protein  40.41 
 
 		 294 aa  73.6  0.0000000000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.351193  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1814  UspA domain protein  36.54 
 
 		 192 aa  73.6  0.0000000000008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.582822  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4830  hypothetical protein  38.57 
 
 		 283 aa  73.6  0.0000000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.148513  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1425  UspA domain-containing protein  37.14 
 
 		 297 aa  73.2  0.000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1935  UspA domain protein  38.51 
 
 		 144 aa  73.2  0.000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.3004  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1532  UspA domain-containing protein  35.17 
 
 		 289 aa  73.2  0.000000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000990893 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4841  hypothetical protein  36.81 
 
 		 302 aa  72.4  0.000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4804  Universal stress protein UspA and related nucleotide-binding protein-like protein  37.41 
 
 		 299 aa  72.4  0.000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.21431 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4807  Universal stress protein UspA and related nucleotide-binding protein-like protein  35.37 
 
 		 288 aa  72  0.000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.839178 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4681  Universal stress protein UspA and related nucleotide-binding protein-like protein  42.67 
 
 		 288 aa  72.8  0.000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.153677 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5276  UspA domain protein  40.43 
 
 		 302 aa  72.8  0.000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0383  UspA domain-containing protein  37.32 
 
 		 343 aa  72  0.000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1581  UspA domain-containing protein  38.62 
 
 		 288 aa  72  0.000000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.582811 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_19610  universal stress protein UspA-like protein  37.09 
 
 		 306 aa  71.6  0.000000000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.697757  normal  0.0279477 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5439  Universal stress protein UspA and related nucleotide-binding protein-like protein  39.86 
 
 		 284 aa  72  0.000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.132119 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0292  UspA domain protein  36.17 
 
 		 303 aa  71.6  0.000000000004  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.838221  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0118  UspA domain-containing protein  35.33 
 
 		 381 aa  71.2  0.000000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3526  hypothetical protein  34.46 
 
 		 288 aa  71.2  0.000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.369083  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0884  UspA domain protein  39.01 
 
 		 310 aa  71.2  0.000000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.314663 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22880  universal stress protein UspA-like protein  38.41 
 
 		 303 aa  71.2  0.000000000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.538505  normal  0.514457 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4059  UspA domain protein  36.24 
 
 		 288 aa  70.9  0.000000000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12028  hypothetical protein  36.81 
 
 		 317 aa  70.9  0.000000000006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000248719  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06810  universal stress protein UspA-like protein  34.69 
 
 		 322 aa  70.9  0.000000000007  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.715632  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5277  UspA domain protein  34.84 
 
 		 308 aa  70.5  0.000000000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1042  UspA domain protein  38.36 
 
 		 289 aa  70.5  0.000000000009  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0592  UspA domain protein  34.51 
 
 		 139 aa  69.7  0.00000000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  hitchhiker  0.000217039  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3032  hypothetical protein  37.24 
 
 		 307 aa  70.1  0.00000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1986  UspA domain protein  35.29 
 
 		 317 aa  69.7  0.00000000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0009  universal stress protein  33.79 
 
 		 321 aa  70.1  0.00000000001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1589  UspA domain-containing protein  38.03 
 
 		 140 aa  68.9  0.00000000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  decreased coverage  0.000251397  normal  0.0131871 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3533  UspA domain protein  37.67 
 
 		 287 aa  69.3  0.00000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3034  hypothetical protein  41.26 
 
 		 314 aa  68.2  0.00000000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.941383  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1378  UspA domain-containing protein  37.58 
 
 		 297 aa  67.8  0.00000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.406073 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2620  UspA domain protein  34.72 
 
 		 143 aa  67.8  0.00000000005  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30750  universal stress protein UspA-like protein  38.57 
 
 		 305 aa  67.8  0.00000000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.537439  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1131  UspA domain-containing protein  35.66 
 
 		 292 aa  67.8  0.00000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.849287  normal  0.887084 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1774  UspA domain-containing protein  38.36 
 
 		 164 aa  67.8  0.00000000005  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01830  universal stress protein UspA-like protein  38.89 
 
 		 324 aa  67.8  0.00000000006  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9016  hypothetical protein  35.06 
 
 		 315 aa  67.4  0.00000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2043  UspA domain protein  39.16 
 
 		 291 aa  67.4  0.00000000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00000173989  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1466  UspA domain-containing protein  35.66 
 
 		 144 aa  67  0.00000000007  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.838968  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0948  UspA domain-containing protein  34.67 
 
 		 290 aa  67.4  0.00000000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  hitchhiker  0.00710468  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3452  UspA domain-containing protein  35.25 
 
 		 289 aa  66.6  0.0000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.936527 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0400  universal stress family protein  30.5 
 
 		 341 aa  67  0.0000000001  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2082  UspA domain protein  35 
 
 		 170 aa  66.2  0.0000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000637745 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1102  hypothetical protein  34.97 
 
 		 292 aa  66.2  0.0000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.608802  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1119  UspA domain-containing protein  34.97 
 
 		 292 aa  66.2  0.0000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.708169 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1242  UspA domain protein  35.17 
 
 		 294 aa  65.5  0.0000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.683026  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2008  UspA domain-containing protein  35.14 
 
 		 141 aa  65.5  0.0000000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0361  UspA domain protein  38.41 
 
 		 293 aa  65.9  0.0000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1647  UspA domain-containing protein  34.25 
 
 		 287 aa  65.5  0.0000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0769263  normal  0.795067 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4616  UspA domain protein  31.91 
 
 		 141 aa  65.9  0.0000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5362  UspA domain-containing protein  30.63 
 
 		 341 aa  65.9  0.0000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2526  UspA domain-containing protein  37.93 
 
 		 296 aa  65.9  0.0000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00294158 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4981  hypothetical protein  30.63 
 
 		 341 aa  65.9  0.0000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.196038  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1892  UspA domain-containing protein  33.55 
 
 		 294 aa  65.9  0.0000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.281928  hitchhiker  0.00296839 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4870  UspA domain-containing protein  37.91 
 
 		 276 aa  65.9  0.0000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1870  UspA domain-containing protein  37.06 
 
 		 147 aa  65.5  0.0000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5069  UspA domain-containing protein  30.63 
 
 		 341 aa  65.9  0.0000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1415  UspA domain-containing protein  33.33 
 
 		 295 aa  65.5  0.0000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.542243  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3036  hypothetical protein  61.22 
 
 		 296 aa  65.1  0.0000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.456769  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1787  universal stress protein  34.27 
 
 		 345 aa  65.1  0.0000000003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4809  hypothetical protein  36.05 
 
 		 282 aa  65.1  0.0000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.868158 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>