123 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amuc_1260 on replicon NC_010655
Organism: Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010655  Amuc_1260  glycoside hydrolase family 37  100 
 
 		 476 aa  998    Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0838  hypothetical protein  33.47 
 
 		 681 aa  247  3e-64  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.179051  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0996  hypothetical protein  27.47 
 
 		 477 aa  144  3e-33  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0383  trehalase  25.11 
 
 		 474 aa  135  1.9999999999999998e-30  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1011  glycoside hydrolase family protein  26.06 
 
 		 581 aa  101  3e-20  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.956563  normal  0.837929 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3625  cell wall surface anchor family protein  28.72 
 
 		 717 aa  93.2  9e-18  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.500986  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2027  glycoside hydrolase family 37  27.14 
 
 		 732 aa  91.3  3e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.203835 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4151  glycoside hydrolase family protein  30.54 
 
 		 721 aa  88.6  2e-16  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2737  glycoside hydrolase family 37  28.22 
 
 		 708 aa  87  7e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.886373  normal  0.227148 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4434  glycoside hydrolase family protein  27.41 
 
 		 718 aa  84.3  0.000000000000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.00000698524  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1844  hypothetical protein  29.57 
 
 		 510 aa  81.3  0.00000000000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3745  glycoside hydrolase family protein  28.79 
 
 		 738 aa  80.9  0.00000000000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00662603  decreased coverage  0.0000773633 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6037  glycoside hydrolase family 37  30 
 
 		 745 aa  74.7  0.000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.930873  normal  0.82415 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0360  cell wall surface anchor family protein  22.48 
 
 		 852 aa  73.6  0.000000000008  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.568384  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_39865  Mannosyl-oligosaccharide glucosidase (Processing A-glucosidase I) (Glucosidase I)  25.35 
 
 		 833 aa  72  0.00000000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.589522  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02949  predicted glycosyl hydrolase  29.01 
 
 		 783 aa  71.2  0.00000000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1841  hypothetical protein  27.83 
 
 		 509 aa  71.6  0.00000000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1553  Amylo-alpha-1,6-glucosidase  25.1 
 
 		 723 aa  71.6  0.00000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.92527  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02899  hypothetical protein  29.01 
 
 		 783 aa  71.2  0.00000000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0621  glycosyl hydrolase  29.01 
 
 		 783 aa  71.2  0.00000000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3262  putative glycosyl hydrolase  29.01 
 
 		 783 aa  71.2  0.00000000004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0620  putative glycosyl hydrolase  29.01 
 
 		 783 aa  71.2  0.00000000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3374  putative glycosyl hydrolase  29.01 
 
 		 783 aa  71.2  0.00000000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1970  putative glycosyl hydrolase  28.14 
 
 		 790 aa  70.5  0.00000000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.434752  normal  0.0141312 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4480  hypothetical protein  23.33 
 
 		 444 aa  68.6  0.0000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0558365  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3547  putative glycosyl hydrolase  27.78 
 
 		 783 aa  68.6  0.0000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.733119  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4394  putative glycosyl hydrolase  27.78 
 
 		 783 aa  68.6  0.0000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1825  Alpha,alpha-trehalase  27.86 
 
 		 509 aa  68.2  0.0000000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1774  glycoside hydrolase family 37  31.15 
 
 		 444 aa  68.2  0.0000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0503  glycoside hydrolase family 37  29.17 
 
 		 452 aa  66.2  0.000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1430  Alpha,alpha-trehalase  26.67 
 
 		 514 aa  64.7  0.000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00359339  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1396  Alpha,alpha-trehalase  26.67 
 
 		 514 aa  64.7  0.000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06606  mannosyl-oligosaccharide glucosidase, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G04210)  22.89 
 
 		 749 aa  64.3  0.000000005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.10149  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2376  hypothetical protein  27.98 
 
 		 441 aa  64.3  0.000000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.353866  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1426  glycoside hydrolase family protein  24.29 
 
 		 495 aa  62.8  0.00000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0668  hypothetical protein  30.38 
 
 		 423 aa  63.2  0.00000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.196254 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000897  putative isomerase  26.47 
 
 		 896 aa  62  0.00000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1034  Amylo-alpha-1,6-glucosidase  24.18 
 
 		 731 aa  60.8  0.00000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1779  Amylo-alpha-16-glucosidase  22.78 
 
 		 720 aa  61.2  0.00000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.120305 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4021  Amylo-alpha-16-glucosidase  24.4 
 
 		 734 aa  60.8  0.00000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5196  Amylo-alpha-16-glucosidase  23.51 
 
 		 736 aa  60.8  0.00000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.350513  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1143  Amylo-alpha-1,6-glucosidase  24.1 
 
 		 732 aa  60.5  0.00000006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0995661 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06895  putative glycosyl hydrolase  25.86 
 
 		 896 aa  60.1  0.00000009  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0360  amylo-alpha-1,6-glucosidase  24.02 
 
 		 734 aa  59.7  0.0000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5852  Amylo-alpha-16-glucosidase  25.45 
 
 		 736 aa  58.2  0.0000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0692  Amylo-alpha-1,6-glucosidase  21.66 
 
 		 734 aa  57.4  0.0000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.418529  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_64968  Neutral trehalase (Alpha,alpha-trehalase) (Alpha,alpha-trehalose glucohydrolase)  27.42 
 
 		 811 aa  57.4  0.0000005  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.332926  normal  0.0654828 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2783  hypothetical protein  23.9 
 
 		 733 aa  57.4  0.0000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0758936 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0922  Alpha,alpha-trehalase  24.86 
 
 		 544 aa  57.4  0.0000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.643949  hitchhiker  0.00590138 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0139  Amylo-alpha-1,6-glucosidase  28.57 
 
 		 733 aa  56.6  0.000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3211  Amylo-alpha-1,6-glucosidase  23.63 
 
 		 732 aa  55.5  0.000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1435  trehalase  27.03 
 
 		 460 aa  55.5  0.000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0656855  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3691  Amylo-alpha-1,6-glucosidase  22.06 
 
 		 734 aa  54.7  0.000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1229  Amylo-alpha-16-glucosidase  23.4 
 
 		 729 aa  53.9  0.000006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.526565  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2002  hypothetical protein  31.9 
 
 		 456 aa  53.5  0.000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000576814  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5014  Alpha,alpha-trehalase  21.27 
 
 		 535 aa  53.1  0.00001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1236  hypothetical protein  26.77 
 
 		 478 aa  52.8  0.00001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0457319  hitchhiker  0.00331425 
 
 
-
 
NC_006684  CNB02790  alpha,alpha-trehalase, putative  25.64 
 
 		 875 aa  52.4  0.00002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.347405  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2046  Alpha,alpha-trehalase  24.86 
 
 		 733 aa  52.4  0.00002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3259  Amylo-alpha-1,6-glucosidase  23.77 
 
 		 735 aa  51.6  0.00003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.574596  normal  0.459486 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0199  hypothetical protein  25.84 
 
 		 723 aa  51.2  0.00004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3939  Amylo-alpha-1,6-glucosidase  22.96 
 
 		 724 aa  51.2  0.00004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6048  Alpha,alpha-trehalase  25.81 
 
 		 503 aa  51.2  0.00004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3185  hypothetical protein  26.21 
 
 		 440 aa  50.4  0.00007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000929672  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0421  hypothetical protein  20.72 
 
 		 727 aa  50.1  0.00008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2789  Amylo-alpha-16-glucosidase  24.34 
 
 		 612 aa  48.9  0.0002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.878962 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2711  Amylo-alpha-16-glucosidase  23.79 
 
 		 733 aa  48.1  0.0003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7106  Alpha,alpha-trehalase  23.12 
 
 		 536 aa  48.5  0.0003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.649741  normal  0.559457 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0706  Amylo-alpha-16-glucosidase  26.34 
 
 		 726 aa  47.8  0.0004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0716  hypothetical protein  21.95 
 
 		 566 aa  47.8  0.0005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1262  Alpha,alpha-trehalase  25.37 
 
 		 621 aa  47.8  0.0005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0418  Amylo-alpha-1,6-glucosidase  23.01 
 
 		 735 aa  47.4  0.0006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5556  Amylo-alpha-16-glucosidase  21.57 
 
 		 765 aa  47.4  0.0006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.817057  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05635  Neutral trehalase (EC 3.2.1.28)(Alpha,alpha-trehalase)(Alpha,alpha-trehalose glucohydrolase) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:O42777]  24.7 
 
 		 751 aa  47  0.0007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.668191  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2125  Amylo-alpha-16-glucosidase  22.13 
 
 		 732 aa  47  0.0007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.964235 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1726  Amylo-alpha-16-glucosidase  21.66 
 
 		 698 aa  47  0.0008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0822  hypothetical protein  21.81 
 
 		 675 aa  46.2  0.001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0538951  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2111  amylo-alpha-1,6-glucosidase  23.41 
 
 		 741 aa  46.2  0.001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0038  amylo-alpha-1,6-glucosidase  21.81 
 
 		 776 aa  46.2  0.001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00000580185  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1583  amylo-alpha-1,6-glucosidase  21.81 
 
 		 776 aa  46.2  0.001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.000129612  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1625  Amylo-alpha-16-glucosidase  19.78 
 
 		 778 aa  46.6  0.001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0043283 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5070  Alpha,alpha-trehalase  24.62 
 
 		 537 aa  46.2  0.001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.379512 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3875  trehalase  28.04 
 
 		 549 aa  46.2  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3917  trehalase  28.04 
 
 		 549 aa  46.2  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.17594  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3978  trehalase  28.04 
 
 		 549 aa  46.2  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.744709  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03367  cytoplasmic trehalase  27.48 
 
 		 549 aa  45.4  0.002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  0.00222705  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0194  Alpha,alpha-trehalase  27.48 
 
 		 549 aa  45.4  0.002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0383252  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03320  hypothetical protein  27.48 
 
 		 549 aa  45.4  0.002  Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  0.000901964  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0328  amylo-alpha-1,6-glucosidase  21.89 
 
 		 733 aa  45.8  0.002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0486  Amylo-alpha-1,6-glucosidase  20.34 
 
 		 711 aa  45.4  0.002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.49575  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3563  Amylo-alpha-1,6-glucosidase  26.92 
 
 		 685 aa  45.4  0.002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3722  trehalase  27.48 
 
 		 549 aa  45.4  0.002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4007  trehalase  27.48 
 
 		 549 aa  45.4  0.002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2832  Alpha,alpha-trehalase  22.22 
 
 		 401 aa  45.4  0.002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.613992  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0198  trehalase  27.48 
 
 		 549 aa  45.4  0.002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.340258  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3823  trehalase  27.48 
 
 		 549 aa  45.4  0.002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.121975 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3922  trehalase  27.48 
 
 		 549 aa  45.4  0.002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.812338  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4882  trehalase  27.48 
 
 		 549 aa  45.4  0.002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1907  Amylo-alpha-16-glucosidase  19.78 
 
 		 778 aa  45.8  0.002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.801386  normal  0.417986 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0912  Amylo-alpha-16-glucosidase  22.55 
 
 		 746 aa  44.7  0.003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>