More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amuc_0443 on replicon NC_010655
Organism: Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010655  Amuc_0443  DNA protecting protein DprA  100 
 
 		 375 aa  759    Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0740883  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0839  DNA uptake Rossmann fold nucleotide-binding protein  46.69 
 
 		 362 aa  253  4.0000000000000004e-66  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00754519  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0049  DNA protecting protein DprA  40.17 
 
 		 368 aa  237  2e-61  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2444  DNA protecting protein DprA  39.19 
 
 		 389 aa  238  2e-61  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000433746  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07520  DNA protecting protein DprA  36.94 
 
 		 409 aa  235  8e-61  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.891455  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2712  DNA protecting protein DprA  39.67 
 
 		 359 aa  234  2.0000000000000002e-60  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.00267536  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1222  DNA protecting protein DprA  47.04 
 
 		 366 aa  233  4.0000000000000004e-60  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2057  DNA protecting protein DprA  36.84 
 
 		 374 aa  230  3e-59  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.448378  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2550  DNA processing protein DprA  45.91 
 
 		 356 aa  230  4e-59  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.304192  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1025  DNA processing protein DprA, putative  37.26 
 
 		 361 aa  229  4e-59  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00128425  unclonable  0.00000000696536 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0459  DNA protecting protein DprA  36.57 
 
 		 370 aa  229  6e-59  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000016133  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1528  DNA protecting protein DprA  39.39 
 
 		 359 aa  228  1e-58  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.42126e-31 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4590  DNA protecting protein DprA  40.56 
 
 		 360 aa  228  1e-58  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0180  DNA protecting protein DprA  42.12 
 
 		 382 aa  228  2e-58  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0890  SMF protein  39.18 
 
 		 358 aa  228  2e-58  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000185705  hitchhiker  0.000000000000633505 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1701  DNA protecting protein DprA  40.64 
 
 		 362 aa  227  2e-58  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.237617  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0599  DNA protecting protein DprA  39.39 
 
 		 394 aa  221  9.999999999999999e-57  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.148256  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3690  DNA protecting protein DprA  38.04 
 
 		 359 aa  221  1.9999999999999999e-56  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000216312  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1985  DNA protecting protein DprA  37.64 
 
 		 385 aa  220  3e-56  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1380  DNA protecting protein DprA  37.22 
 
 		 349 aa  220  3e-56  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.261121  normal  0.326941 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0212  DNA protecting protein DprA  37.87 
 
 		 386 aa  217  2e-55  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00622091  normal  0.258224 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3267  DNA protecting protein DprA  37.43 
 
 		 364 aa  217  2.9999999999999998e-55  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000733179  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0168  DNA protecting protein DprA  39.28 
 
 		 360 aa  214  1.9999999999999998e-54  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.208871  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3681  DNA protecting protein DprA  39.73 
 
 		 402 aa  214  1.9999999999999998e-54  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_625  Rossmann fold DNA uptake nucleotide-binding protein  37.57 
 
 		 373 aa  213  2.9999999999999995e-54  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0157  DNA protecting protein DprA  34.24 
 
 		 372 aa  213  4.9999999999999996e-54  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.835588  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4641  DNA processing protein DprA, putative  37 
 
 		 374 aa  213  5.999999999999999e-54  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0529  DNA protecting protein DprA  36.83 
 
 		 371 aa  212  7.999999999999999e-54  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0102387  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0068  SMF protein  38.3 
 
 		 401 aa  211  2e-53  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0408  Rossmann-fold nucleotide-binding protein  43.25 
 
 		 366 aa  211  2e-53  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000102128  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0395  DNA processing protein DprA, putative  38.23 
 
 		 372 aa  209  6e-53  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3358  DNA protecting protein DprA  42.37 
 
 		 401 aa  209  8e-53  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.496729  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0507  DNA protecting protein DprA  42.25 
 
 		 362 aa  207  2e-52  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.402405  hitchhiker  0.00180808 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3881  DNA protecting protein DprA  42.91 
 
 		 399 aa  207  3e-52  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.857304  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2630  DNA protecting protein DprA  37.2 
 
 		 379 aa  207  3e-52  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.196753  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0718  DNA processing protein DprA, putative  36.73 
 
 		 406 aa  206  4e-52  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.269351  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3394  DNA protecting protein DprA  37.78 
 
 		 386 aa  206  5e-52  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0567  DNA protecting protein DprA  34.25 
 
 		 356 aa  206  7e-52  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3792  SMF protein  36.99 
 
 		 372 aa  205  1e-51  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0703  DNA processing protein DprA, putative  41.72 
 
 		 402 aa  205  1e-51  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.055587  normal  0.280141 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1610  DNA protecting protein DprA  42.28 
 
 		 370 aa  205  1e-51  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5115  DNA protecting protein DprA  37.34 
 
 		 382 aa  204  2e-51  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.770654  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0571  DNA protecting protein DprA  36.19 
 
 		 375 aa  204  2e-51  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.607235  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0103  DNA protecting protein DprA  41.7 
 
 		 365 aa  204  2e-51  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1581  DNA processing protein DprA, putative  37.97 
 
 		 425 aa  204  3e-51  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.301322  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4686  DNA protecting protein DprA  36.55 
 
 		 408 aa  204  3e-51  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6479  SMF protein  35.89 
 
 		 448 aa  203  4e-51  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.848521 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4049  Fis family transcriptional regulator  37.53 
 
 		 386 aa  203  4e-51  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0034  DNA protecting protein DprA  37.03 
 
 		 389 aa  203  5e-51  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0653  DNA protecting protein DprA  36.22 
 
 		 373 aa  202  8e-51  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.412317  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1290  DNA protecting protein DprA  35.43 
 
 		 363 aa  201  9.999999999999999e-51  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00929772  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3144  DNA protecting protein DprA  36.34 
 
 		 422 aa  202  9.999999999999999e-51  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2841  DNA processing protein DprA, putative  36.16 
 
 		 364 aa  201  1.9999999999999998e-50  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3128  DNA protecting protein DprA  36.43 
 
 		 475 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.328888  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0194  DNA processing protein DprA, putative  40.33 
 
 		 377 aa  200  3e-50  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4084  DNA protecting protein DprA  37.5 
 
 		 399 aa  200  3e-50  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.168592  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2098  DNA processing protein  39.32 
 
 		 308 aa  200  3e-50  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.00923798  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0474  DNA protecting protein DprA  37.7 
 
 		 367 aa  200  3e-50  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.13893  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0019  SMF protein  45 
 
 		 358 aa  200  3.9999999999999996e-50  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.108355 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3410  SMF protein  36.39 
 
 		 379 aa  199  5e-50  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.487064  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1041  DNA protecting protein DprA  37.47 
 
 		 338 aa  199  5e-50  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.367593  normal  0.132089 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4546  DNA protecting protein DprA  36.48 
 
 		 369 aa  199  7.999999999999999e-50  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2514  DNA processing protein DprA, putative  36.18 
 
 		 475 aa  199  9e-50  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0175  DNA processing protein DprA, putative  37.84 
 
 		 394 aa  198  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0281  putative SMF protein  36.77 
 
 		 365 aa  198  2.0000000000000003e-49  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0175905 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2650  hypothetical protein  32.97 
 
 		 361 aa  197  2.0000000000000003e-49  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0088  DNA protecting protein DprA  38.98 
 
 		 296 aa  197  2.0000000000000003e-49  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000403325  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2520  hypothetical protein  32.7 
 
 		 361 aa  197  3e-49  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2324  DNA protecting protein DprA  36.94 
 
 		 388 aa  197  3e-49  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.257169  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3341  DNA processing protein DprA, putative  36.04 
 
 		 385 aa  197  3e-49  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0076  DNA protecting protein DprA  35.79 
 
 		 352 aa  197  4.0000000000000005e-49  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0019  SMF protein  37.84 
 
 		 366 aa  196  6e-49  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000611984  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3661  DNA protecting protein DprA  34.32 
 
 		 365 aa  196  6e-49  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.34529  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0037  DNA protecting protein DprA  36.29 
 
 		 368 aa  196  7e-49  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.249396  normal  0.109899 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0660  DNA protecting protein DprA  36.78 
 
 		 375 aa  196  8.000000000000001e-49  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.137383  normal  0.252364 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0012  SMF protein  40.2 
 
 		 320 aa  196  8.000000000000001e-49  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.143146 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1675  DNA protecting protein DprA  34.16 
 
 		 360 aa  196  8.000000000000001e-49  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0238407  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0189  DNA processing protein DprA, putative  39.46 
 
 		 336 aa  195  9e-49  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000738349 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0890  DNA protecting protein DprA  38.76 
 
 		 395 aa  194  1e-48  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.135631  normal  0.947282 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3718  DNA protecting protein DprA  46.09 
 
 		 389 aa  195  1e-48  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000018591  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0412  DNA processing chain A  42.47 
 
 		 368 aa  194  2e-48  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.232612  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0638  DNA protecting protein DprA  36.39 
 
 		 375 aa  193  3e-48  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0022  DNA-processing protein smf chain A  36.29 
 
 		 362 aa  192  7e-48  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.638184  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1957  DNA protecting protein DprA  34.16 
 
 		 360 aa  192  7e-48  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0193  smf protein  36.69 
 
 		 375 aa  190  2.9999999999999997e-47  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0663  DNA protecting protein DprA  31.78 
 
 		 364 aa  190  4e-47  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.802271  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0085  DNA protecting protein DprA  36.69 
 
 		 365 aa  190  4e-47  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.182517  decreased coverage  0.00000000000000667659 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0045  DNA protecting protein DprA  42.18 
 
 		 405 aa  189  5.999999999999999e-47  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3862  DNA processing protein DprA, putative  38.17 
 
 		 409 aa  189  7e-47  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2275  DNA protecting protein DprA  35.88 
 
 		 377 aa  188  1e-46  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00463646 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3772  DNA protecting protein DprA  39.66 
 
 		 374 aa  188  1e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4073  DNA protecting protein DprA  32.34 
 
 		 368 aa  188  1e-46  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2083  transcriptional regulator TrmB  34.72 
 
 		 337 aa  188  1e-46  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2933  DNA protecting protein DprA  38.54 
 
 		 380 aa  188  1e-46  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.608648  normal  0.51398 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002059  DNA uptake Rossmann fold nucleotide-binding protein  34.41 
 
 		 369 aa  187  2e-46  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1985  DNA protecting protein DprA  38.13 
 
 		 364 aa  188  2e-46  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.435802  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4608  DNA protecting protein DprA  39.04 
 
 		 374 aa  187  2e-46  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0168836  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0057  DNA protecting protein DprA  37.76 
 
 		 368 aa  188  2e-46  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0085  DNA protecting protein DprA  36.88 
 
 		 365 aa  187  3e-46  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.273214  normal  0.48909 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0023  filamentous haemagglutinin-like protein  34.13 
 
 		 399 aa  187  3e-46  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>