More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amuc_0120 on replicon NC_010655
Organism: Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010655  Amuc_0120  protein of unknown function UPF0118  100 
 
 
436 aa  880    Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2059  protein of unknown function UPF0118  27.91 
 
 
406 aa  133  6.999999999999999e-30  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1297  hypothetical protein  33.14 
 
 
382 aa  133  7.999999999999999e-30  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.675511  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1623  PerM family permease  29.01 
 
 
367 aa  131  3e-29  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.134997 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1439  hypothetical protein  28.12 
 
 
366 aa  131  3e-29  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0335022  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1855  hypothetical protein  28.25 
 
 
368 aa  129  7.000000000000001e-29  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0735664  normal  0.142574 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3149  hypothetical protein  29.4 
 
 
396 aa  129  9.000000000000001e-29  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.927452  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1998  transporter, putative  31.15 
 
 
370 aa  129  1.0000000000000001e-28  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.000649848  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1196  protein of unknown function UPF0118  28.46 
 
 
349 aa  129  1.0000000000000001e-28  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2050  hypothetical protein  29.84 
 
 
368 aa  129  1.0000000000000001e-28  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000116574  hitchhiker  0.00000000347502 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1577  permease  28.88 
 
 
379 aa  128  2.0000000000000002e-28  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0779  Lipocalin-related protein and Bos/Can/Equ allergen  30.51 
 
 
375 aa  125  2e-27  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.770407  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0929  hypothetical protein  27.59 
 
 
405 aa  124  3e-27  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2435  hypothetical protein  30.51 
 
 
358 aa  124  4e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0853714  normal  0.0537169 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1300  hypothetical protein  27.57 
 
 
434 aa  123  7e-27  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.493989  normal  0.64241 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1964  hypothetical protein  30.42 
 
 
378 aa  120  4.9999999999999996e-26  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1420  hypothetical protein  27.09 
 
 
402 aa  120  4.9999999999999996e-26  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0644646  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1448  hypothetical protein  27.09 
 
 
402 aa  120  4.9999999999999996e-26  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000360654  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0742  protein of unknown function UPF0118  26.98 
 
 
361 aa  120  6e-26  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05740  predicted permease  26.56 
 
 
351 aa  120  6e-26  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0159553  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1773  hypothetical protein  28.9 
 
 
357 aa  118  1.9999999999999998e-25  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000027115  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3329  hypothetical protein  29.41 
 
 
365 aa  118  1.9999999999999998e-25  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.63767  normal  0.12265 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2111  hypothetical protein  27.44 
 
 
363 aa  118  3e-25  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0492  hypothetical protein  28.28 
 
 
374 aa  117  3.9999999999999997e-25  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2536  hypothetical protein  27.88 
 
 
364 aa  117  3.9999999999999997e-25  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1347  permease  25.79 
 
 
393 aa  116  6.9999999999999995e-25  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0428205  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3199  hypothetical protein  27.95 
 
 
349 aa  114  3e-24  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0020334  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1194  hypothetical protein  24.69 
 
 
396 aa  113  6e-24  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0728  protein of unknown function UPF0118  25.81 
 
 
363 aa  113  6e-24  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0725  protein of unknown function UPF0118  29.95 
 
 
347 aa  113  7.000000000000001e-24  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0808655  hitchhiker  0.000000275011 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0571  hypothetical protein  29.95 
 
 
347 aa  113  7.000000000000001e-24  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.442056  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3575  protein of unknown function UPF0118  28.86 
 
 
344 aa  111  3e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00192559  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3308  protein of unknown function UPF0118  27.82 
 
 
452 aa  110  4.0000000000000004e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0783017  normal  0.176079 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2575  hypothetical protein  27.75 
 
 
415 aa  110  4.0000000000000004e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.41372  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1351  permease  26.86 
 
 
390 aa  110  4.0000000000000004e-23  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1647  hypothetical protein  28.85 
 
 
345 aa  109  1e-22  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0171139 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2025  protein of unknown function UPF0118  28.37 
 
 
370 aa  108  2e-22  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.653838 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2979  hypothetical protein  28.1 
 
 
387 aa  107  3e-22  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2339  protein of unknown function UPF0118  28.49 
 
 
370 aa  107  4e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1488  hypothetical protein  29.36 
 
 
341 aa  107  4e-22  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000137756  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2065  hypothetical protein  28.49 
 
 
370 aa  107  4e-22  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.76219  normal  0.0900338 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5545  protein of unknown function UPF0118  28.34 
 
 
375 aa  107  4e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0252141  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5162  hypothetical protein  28.15 
 
 
382 aa  106  1e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.235316  normal  0.0183443 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0400  hypothetical protein  28.25 
 
 
357 aa  105  1e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3129  hypothetical protein  26.81 
 
 
418 aa  105  1e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0793  hypothetical protein  26.5 
 
 
379 aa  105  2e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.114477  normal  0.678459 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2668  phosphoribosylaminoimidazole-succinocarboxamide synthase  28.1 
 
 
665 aa  105  2e-21  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1096  protein of unknown function UPF0118  27.03 
 
 
374 aa  104  3e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.771823  hitchhiker  0.00624948 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1242  protein of unknown function UPF0118  26.53 
 
 
374 aa  103  5e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.4957  hitchhiker  0.00297495 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3462  hypothetical protein  25.91 
 
 
418 aa  103  6e-21  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0247174 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1860  permease  25.14 
 
 
369 aa  102  1e-20  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0713  permease, putative  26.17 
 
 
382 aa  101  2e-20  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.658083  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1689  protein of unknown function UPF0118  26.77 
 
 
379 aa  101  2e-20  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.160428  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0961  protein of unknown function UPF0118  32.09 
 
 
382 aa  101  2e-20  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00685895 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0703  putative permease  26.6 
 
 
382 aa  101  3e-20  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0910  hypothetical protein  25.55 
 
 
379 aa  100  3e-20  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1056  hypothetical protein  25.6 
 
 
398 aa  101  3e-20  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2027  protein of unknown function UPF0118  28.09 
 
 
354 aa  100  5e-20  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.294883  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1225  hypothetical protein  24.53 
 
 
357 aa  100  6e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.220929  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4051  hypothetical protein  26.07 
 
 
354 aa  99.8  8e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02243  permease  27.57 
 
 
388 aa  99.8  8e-20  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.41641  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1265  hypothetical protein  27.51 
 
 
357 aa  99.8  9e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.0876555 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0196  hypothetical protein  26.84 
 
 
373 aa  99  1e-19  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1428  hypothetical protein  27.53 
 
 
547 aa  99.4  1e-19  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1635  hypothetical protein  26.15 
 
 
357 aa  99.4  1e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.546399  normal  0.110517 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1667  hypothetical protein  26.65 
 
 
357 aa  99  2e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.629251 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1702  permease, putative  26.28 
 
 
357 aa  97.4  4e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.303674  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3687  hypothetical protein  25.9 
 
 
357 aa  97.4  4e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000304887 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2481  hypothetical protein  25.54 
 
 
356 aa  97.8  4e-19  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.691389  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2164  hypothetical protein  29.5 
 
 
369 aa  97.4  5e-19  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3565  hypothetical protein  25.84 
 
 
356 aa  97.4  5e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.501523 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2541  protein of unknown function UPF0118  25.83 
 
 
392 aa  96.7  6e-19  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.407102  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4060  hypothetical protein  27.27 
 
 
404 aa  97.1  6e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000137982  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0766  hypothetical protein  25.71 
 
 
404 aa  96.7  7e-19  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.838264  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2994  hypothetical protein  27.01 
 
 
360 aa  95.9  1e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00687092 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1330  protein of unknown function UPF0118  27.64 
 
 
351 aa  95.9  1e-18  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0191  PerM family permease  35.33 
 
 
327 aa  95.5  2e-18  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.739217  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1713  hypothetical protein  26.33 
 
 
371 aa  95.5  2e-18  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.655848  normal  0.476202 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0224  protein of unknown function UPF0118  26.88 
 
 
345 aa  95.1  2e-18  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000000072412  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1950  hypothetical protein  26.03 
 
 
386 aa  94.7  3e-18  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0322  hypothetical protein  26.45 
 
 
487 aa  94.4  4e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.084246  hitchhiker  0.000224903 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1156  permease  29.86 
 
 
382 aa  94.4  4e-18  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0866214  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0657  permease  29.05 
 
 
384 aa  94  5e-18  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.036358  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0190  hypothetical protein  24.74 
 
 
356 aa  93.6  7e-18  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2201  hypothetical protein  25.89 
 
 
365 aa  93.6  7e-18  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  hitchhiker  0.000750597  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3083  hypothetical protein  26.93 
 
 
373 aa  92.8  9e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.000376158  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0279  hypothetical protein  25.24 
 
 
423 aa  93.2  9e-18  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0267805 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0768  hypothetical protein  24.04 
 
 
343 aa  92.4  1e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.011294  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1742  putative permease PerM  26.78 
 
 
354 aa  91.7  2e-17  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2478  hypothetical protein  32.69 
 
 
369 aa  92  2e-17  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2087  hypothetical protein  26.38 
 
 
353 aa  92  2e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.257402  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0457  hypothetical protein  25.6 
 
 
383 aa  92  2e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.775898 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0928  permease  25.41 
 
 
361 aa  92  2e-17  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.335153 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0555  protein of unknown function UPF0118  28.02 
 
 
364 aa  90.9  4e-17  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1973  hypothetical protein  24.23 
 
 
369 aa  90.9  5e-17  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0953876  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1236  protein of unknown function UPF0118  27.14 
 
 
439 aa  90.1  7e-17  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000518014 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2955  hypothetical protein  27.43 
 
 
373 aa  89.4  1e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0331656  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2637  permease  27.43 
 
 
348 aa  89.4  1e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.386693  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0971  protein of unknown function UPF0118  28.53 
 
 
389 aa  89.4  1e-16  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.0710399 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3012  protein of unknown function UPF0118  26.08 
 
 
369 aa  89.4  1e-16  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>