More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dbac_1689 on replicon NC_013173
Organism: Desulfomicrobium baculatum DSM 4028



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013173  Dbac_1689  protein of unknown function UPF0118  100 
 
 		 379 aa  744    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.160428  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1950  hypothetical protein  35.37 
 
 		 386 aa  219  6e-56  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3565  hypothetical protein  31.34 
 
 		 356 aa  134  3e-30  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.501523 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3308  protein of unknown function UPF0118  28.14 
 
 		 452 aa  129  6e-29  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0783017  normal  0.176079 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1577  permease  30.79 
 
 		 379 aa  118  1.9999999999999998e-25  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0120  protein of unknown function UPF0118  26.84 
 
 		 436 aa  115  1.0000000000000001e-24  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0492  hypothetical protein  29.63 
 
 		 374 aa  115  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1713  hypothetical protein  29.36 
 
 		 371 aa  113  5e-24  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.655848  normal  0.476202 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1488  hypothetical protein  24.21 
 
 		 341 aa  113  5e-24  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000137756  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1762  hypothetical protein  27.03 
 
 		 329 aa  111  2.0000000000000002e-23  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2111  hypothetical protein  28.18 
 
 		 363 aa  111  2.0000000000000002e-23  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0742  protein of unknown function UPF0118  27.69 
 
 		 361 aa  110  4.0000000000000004e-23  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02243  permease  28.95 
 
 		 388 aa  108  1e-22  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.41641  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1242  protein of unknown function UPF0118  27.71 
 
 		 374 aa  108  2e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.4957  hitchhiker  0.00297495 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2575  hypothetical protein  28.08 
 
 		 415 aa  107  4e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.41372  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1773  hypothetical protein  26.52 
 
 		 357 aa  107  4e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000027115  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4060  hypothetical protein  28.03 
 
 		 404 aa  107  4e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000137982  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1964  hypothetical protein  26.86 
 
 		 378 aa  106  8e-22  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1096  protein of unknown function UPF0118  29.48 
 
 		 374 aa  105  2e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.771823  hitchhiker  0.00624948 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1855  hypothetical protein  25.9 
 
 		 368 aa  103  4e-21  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0735664  normal  0.142574 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1297  hypothetical protein  27.78 
 
 		 382 aa  103  7e-21  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.675511  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1439  hypothetical protein  25.99 
 
 		 366 aa  102  1e-20  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0335022  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4286  hypothetical protein  24.55 
 
 		 355 aa  101  2e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4123  hypothetical protein  24.55 
 
 		 355 aa  101  2e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4134  hypothetical protein  24.55 
 
 		 355 aa  101  2e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0768  hypothetical protein  24.92 
 
 		 343 aa  101  2e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.011294  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4510  hypothetical protein  23.99 
 
 		 355 aa  101  2e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4618  hypothetical protein  24.55 
 
 		 355 aa  101  2e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.569611  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4470  hypothetical protein  24.55 
 
 		 355 aa  101  2e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000112475 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0726  hypothetical protein  23.99 
 
 		 355 aa  101  2e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0713  permease, putative  26.67 
 
 		 382 aa  101  3e-20  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.658083  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1623  PerM family permease  25.68 
 
 		 367 aa  100  3e-20  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.134997 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2491  protein of unknown function UPF0118  25.31 
 
 		 353 aa  100  3e-20  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1196  protein of unknown function UPF0118  23.91 
 
 		 349 aa  100  4e-20  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1860  permease  26.69 
 
 		 369 aa  99.8  7e-20  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1998  transporter, putative  24.17 
 
 		 370 aa  99.4  9e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.000649848  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2050  hypothetical protein  25.45 
 
 		 368 aa  99.4  9e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000116574  hitchhiker  0.00000000347502 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0703  putative permease  26.36 
 
 		 382 aa  99.4  9e-20  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4237  hypothetical protein  23.36 
 
 		 355 aa  99  1e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2339  protein of unknown function UPF0118  29.28 
 
 		 370 aa  99  1e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0725  protein of unknown function UPF0118  27.27 
 
 		 347 aa  98.6  1e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0808655  hitchhiker  0.000000275011 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2027  protein of unknown function UPF0118  26.59 
 
 		 354 aa  98.6  1e-19  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.294883  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0571  hypothetical protein  27.27 
 
 		 347 aa  98.6  1e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.442056  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2065  hypothetical protein  29.28 
 
 		 370 aa  99  1e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.76219  normal  0.0900338 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0961  protein of unknown function UPF0118  32.34 
 
 		 382 aa  98.2  2e-19  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00685895 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0061  hypothetical protein  27.61 
 
 		 383 aa  98.2  2e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3199  hypothetical protein  23.41 
 
 		 349 aa  97.4  3e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0020334  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0910  hypothetical protein  23.33 
 
 		 379 aa  97.4  4e-19  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1056  hypothetical protein  24.47 
 
 		 398 aa  97.4  4e-19  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0793  hypothetical protein  25 
 
 		 379 aa  97.4  4e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.114477  normal  0.678459 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2488  hypothetical protein  26.15 
 
 		 358 aa  96.7  6e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.568242 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2025  protein of unknown function UPF0118  29.47 
 
 		 370 aa  96.7  6e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.653838 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0779  Lipocalin-related protein and Bos/Can/Equ allergen  23.63 
 
 		 375 aa  96.3  7e-19  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.770407  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1855  hypothetical protein  27.9 
 
 		 380 aa  96.3  8e-19  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.631285 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3687  hypothetical protein  27.41 
 
 		 357 aa  95.5  1e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000304887 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5162  hypothetical protein  28.57 
 
 		 382 aa  95.5  1e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.235316  normal  0.0183443 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1420  hypothetical protein  25.62 
 
 		 402 aa  95.5  1e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0644646  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3129  hypothetical protein  26.43 
 
 		 418 aa  95.5  1e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2435  hypothetical protein  23.63 
 
 		 358 aa  95.9  1e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0853714  normal  0.0537169 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1448  hypothetical protein  25.62 
 
 		 402 aa  95.5  1e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000360654  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0196  hypothetical protein  23.71 
 
 		 373 aa  95.5  2e-18  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1300  hypothetical protein  27.33 
 
 		 434 aa  94.7  2e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.493989  normal  0.64241 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0555  protein of unknown function UPF0118  26.59 
 
 		 364 aa  94.4  3e-18  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3102  hypothetical protein  26.11 
 
 		 352 aa  94.4  3e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1351  permease  26.01 
 
 		 390 aa  94.4  3e-18  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3575  protein of unknown function UPF0118  25 
 
 		 344 aa  93.6  5e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00192559  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1647  hypothetical protein  29.36 
 
 		 345 aa  93.6  5e-18  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0171139 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02385  predicted inner membrane protein  27.69 
 
 		 353 aa  93.6  6e-18  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0762767  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1176  protein of unknown function UPF0118  27.69 
 
 		 353 aa  93.6  6e-18  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.412561  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2730  permease PerM  27.36 
 
 		 362 aa  93.2  6e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.659097  normal  0.956035 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2640  PerM family permease  27.69 
 
 		 353 aa  93.6  6e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2688  permease PerM  27.36 
 
 		 355 aa  93.6  6e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1183  hypothetical protein  27.69 
 
 		 353 aa  93.6  6e-18  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0538168 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2861  permease PerM  27.36 
 
 		 362 aa  93.2  6e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3715  putative permease, PerM family  27.69 
 
 		 353 aa  93.6  6e-18  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2640  permease PerM  27.36 
 
 		 355 aa  93.6  6e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.419277  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2775  PerM family permease  27.69 
 
 		 353 aa  93.6  6e-18  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0215248  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2627  PerM family permease  27.69 
 
 		 353 aa  93.6  6e-18  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2867  putative permease, PerM family  27.69 
 
 		 353 aa  93.6  6e-18  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.697689  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02347  hypothetical protein  27.69 
 
 		 353 aa  93.6  6e-18  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.106827  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2752  permease PerM  27.36 
 
 		 362 aa  93.2  7e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1347  permease  24.5 
 
 		 393 aa  92.8  9e-18  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0428205  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2721  hypothetical protein  22.29 
 
 		 361 aa  92.8  1e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00186421  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2994  hypothetical protein  25.84 
 
 		 360 aa  92  1e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00687092 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0672  hypothetical protein  27.73 
 
 		 353 aa  91.7  2e-17  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2774  hypothetical protein  29.15 
 
 		 356 aa  91.3  2e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0353755  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2059  protein of unknown function UPF0118  32.03 
 
 		 406 aa  92  2e-17  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1330  protein of unknown function UPF0118  24.37 
 
 		 351 aa  91.7  2e-17  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2536  hypothetical protein  25.85 
 
 		 364 aa  91.7  2e-17  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1144  hypothetical protein  21.35 
 
 		 354 aa  90.9  3e-17  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  unclonable  0.00155039  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1702  permease, putative  27.11 
 
 		 357 aa  91.3  3e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.303674  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4523  hypothetical protein  24.84 
 
 		 355 aa  90.5  4e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0610501  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2233  hypothetical protein  25.67 
 
 		 379 aa  90.5  4e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.195735  normal  1 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0191  PerM family permease  26.52 
 
 		 327 aa  90.5  4e-17  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.739217  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5545  protein of unknown function UPF0118  29.18 
 
 		 375 aa  90.5  4e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0252141  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1194  hypothetical protein  24.54 
 
 		 396 aa  90.1  5e-17  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1477  protein of unknown function UPF0118  25.65 
 
 		 329 aa  90.1  5e-17  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1995  hypothetical protein  22.45 
 
 		 361 aa  90.5  5e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0255666  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4473  hypothetical protein  24.22 
 
 		 356 aa  89.7  8e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.17401  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0400  hypothetical protein  24.04 
 
 		 357 aa  89.7  8e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>