More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_6895 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_6895  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  100 
 
 		 195 aa  379  1e-104  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38090  haloacid dehalogenase superfamily protein, subfamily IA, variant 3 with third motif having DD or ED  50.52 
 
 		 194 aa  193  1e-48  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.516929  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7952  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  44.56 
 
 		 206 aa  153  2e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3350  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  37.62 
 
 		 205 aa  108  7.000000000000001e-23  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00377718  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0142  HAD family hydrolase  33.69 
 
 		 212 aa  105  6e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0023385 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11470  haloacid dehalogenase superfamily protein, subfamily IA, variant 3 with third motif having DD or ED  37.63 
 
 		 230 aa  103  2e-21  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.241013  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7538  hydrolase (HAD superfamily)-like protein  35.26 
 
 		 232 aa  102  4e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.763652 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2117  HAD family hydrolase  37.16 
 
 		 210 aa  102  4e-21  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2108  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  36.98 
 
 		 203 aa  90.9  9e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.133386  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0441  putative L-2-haloalkanoic acid dehalogenase (HAD aspartate-nucleophile hydrolase)  37.93 
 
 		 207 aa  73.2  0.000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.238349  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30870  haloacid dehalogenase superfamily protein, subfamily IA, variant 3 with third motif having DD or ED  53.01 
 
 		 133 aa  72.4  0.000000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6303  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  48.31 
 
 		 133 aa  72  0.000000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3384  HAD family hydrolase  37.61 
 
 		 206 aa  71.2  0.000000000009  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2484  HAD family hydrolase  30.58 
 
 		 218 aa  70.5  0.00000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0468  HAD family hydrolase  29.56 
 
 		 202 aa  68.9  0.00000000004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.85334  hitchhiker  0.00430907 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0706  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  30.62 
 
 		 204 aa  68.9  0.00000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.182073  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3517  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  36.21 
 
 		 207 aa  67.8  0.0000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00913759  normal  0.088603 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0651  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  29.47 
 
 		 205 aa  67.4  0.0000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.286753 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2528  HAD family hydrolase  35.58 
 
 		 204 aa  67.4  0.0000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3116  HAD family hydrolase  34.23 
 
 		 193 aa  66.6  0.0000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.441667 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1100  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  48 
 
 		 219 aa  65.9  0.0000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3728  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  36.11 
 
 		 224 aa  66.2  0.0000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.93668  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1720  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  32.34 
 
 		 209 aa  66.2  0.0000000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  hitchhiker  0.00306678  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2121  epoxide hydrolase domain-containing phosphatase  29.9 
 
 		 215 aa  66.2  0.0000000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.581961  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0649  hydrolase  32.37 
 
 		 211 aa  65.5  0.0000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3413  epoxide hydrolase-like phosphatase  30.65 
 
 		 210 aa  65.9  0.0000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.15685  normal  0.959449 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18080  haloacid dehalogenase superfamily protein, subfamily IA, variant 3 with third motif having DD or ED  35.65 
 
 		 211 aa  65.1  0.0000000006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.588171  normal  0.386622 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2997  HAD family hydrolase  36.46 
 
 		 203 aa  64.3  0.000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.155804 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1128  HAD family hydrolase  31.96 
 
 		 214 aa  63.2  0.000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.893823  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0532  HAD superfamily hydrolase-like protein  35.29 
 
 		 163 aa  63.9  0.000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0976  HAD family hydrolase  26.47 
 
 		 198 aa  63.5  0.000000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1973  epoxide hydrolase  29.63 
 
 		 212 aa  62.4  0.000000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4019  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  41.11 
 
 		 232 aa  62.4  0.000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0842123  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0492  HAD superfamily hydrolase  29.23 
 
 		 205 aa  62  0.000000005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0784  HAD-superfamily hydrolase  32.8 
 
 		 216 aa  62  0.000000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0570  epoxide hydrolase domain-containing phosphatase  29.7 
 
 		 214 aa  61.2  0.000000009  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.457347  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0542  HAD family hydrolase  29.67 
 
 		 219 aa  60.5  0.00000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0173803  normal  0.811025 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1090  hydrolase  28.37 
 
 		 202 aa  60.8  0.00000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0043  HAD family hydrolase  34.55 
 
 		 200 aa  60.5  0.00000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.237358  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0887  HAD family hydrolase  37.38 
 
 		 206 aa  60.8  0.00000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0496  HAD superfamily hydrolase  29.23 
 
 		 205 aa  60.8  0.00000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2026  HAD family hydrolase  32.43 
 
 		 203 aa  60.1  0.00000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.151114  normal  0.583157 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1288  HAD family hydrolase  29.95 
 
 		 212 aa  60.5  0.00000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.888389  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4067  HAD-superfamily hydrolase, phosphatase  27.66 
 
 		 212 aa  59.7  0.00000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.144005  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0606  HAD family hydrolase  30.11 
 
 		 204 aa  59.3  0.00000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.49461  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1237  HAD family hydrolase  35.29 
 
 		 229 aa  59.3  0.00000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2882  HAD family hydrolase  35.59 
 
 		 207 aa  59.7  0.00000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0448644  normal  0.225863 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7621  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  38.04 
 
 		 200 aa  58.9  0.00000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09020  haloacid dehalogenase superfamily enzyme, subfamily IA  32.31 
 
 		 234 aa  58.9  0.00000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.532277  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4147  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  38.38 
 
 		 220 aa  58.9  0.00000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1856  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  30.29 
 
 		 224 aa  58.5  0.00000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2884  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  27.59 
 
 		 202 aa  58.5  0.00000006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2925  HAD-superfamily hydrolase  37.39 
 
 		 207 aa  58.2  0.00000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1688  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  31.93 
 
 		 230 aa  58.2  0.00000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.520793  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0848  HAD hydrolase, family IA, variant 3  31.82 
 
 		 216 aa  57.4  0.0000001  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3580  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  37.5 
 
 		 212 aa  57.8  0.0000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0509  HAD-superfamily hydrolase  36.44 
 
 		 207 aa  57.4  0.0000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1935  HAD family hydrolase  36.44 
 
 		 207 aa  57.4  0.0000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.729707  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3596  hydrolase  36.44 
 
 		 207 aa  57.4  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.623468  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4524  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  32.81 
 
 		 203 aa  57.4  0.0000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.655556  normal  0.0295033 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3607  HAD family hydrolase  36.44 
 
 		 207 aa  57.4  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0669  HAD family hydrolase  36.44 
 
 		 207 aa  57.4  0.0000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0965  HAD family hydrolase  36.44 
 
 		 207 aa  57.4  0.0000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.171916  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3582  HAD family hydrolase  36.44 
 
 		 207 aa  57.4  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.548756  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03770  phosphatase  27.17 
 
 		 199 aa  57  0.0000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.943463  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5332  phosphatase  27.17 
 
 		 199 aa  56.6  0.0000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.284807 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4101  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  27.17 
 
 		 199 aa  57  0.0000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2047  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  32.71 
 
 		 211 aa  56.6  0.0000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.044759 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5452  HAD-superfamily hydrolase  32.97 
 
 		 212 aa  56.6  0.0000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03719  hypothetical protein  27.17 
 
 		 199 aa  57  0.0000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.77682  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4133  phosphatase  27.17 
 
 		 199 aa  57  0.0000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2412  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  36.69 
 
 		 222 aa  56.6  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4363  phosphatase  27.17 
 
 		 199 aa  56.6  0.0000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4270  phosphatase  27.17 
 
 		 199 aa  56.6  0.0000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1543  HAD family hydrolase  31.54 
 
 		 218 aa  56.6  0.0000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.290377 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3008  HAD family hydrolase  35.42 
 
 		 206 aa  56.6  0.0000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.103903  normal  0.720985 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0412  HAD family hydrolase  24 
 
 		 223 aa  57  0.0000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4110  phosphatase  27.17 
 
 		 199 aa  57  0.0000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0806852  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4408  phosphatase  27.17 
 
 		 199 aa  57  0.0000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3459  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  37.11 
 
 		 216 aa  56.2  0.0000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0792688  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3787  HAD family hydrolase  35.87 
 
 		 238 aa  56.2  0.0000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.85061  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1251  HAD family phosphatase  23.79 
 
 		 202 aa  56.2  0.0000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000890892  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0488  HAD family hydrolase  34.19 
 
 		 207 aa  55.5  0.0000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0470  HAD-superfamily hydrolase, phosphatase  33.51 
 
 		 219 aa  55.8  0.0000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.261482  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3603  HAD family hydrolase  34.19 
 
 		 207 aa  55.8  0.0000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2588  HAD family hydrolase  34.19 
 
 		 207 aa  55.8  0.0000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0516  HAD family hydrolase  34.19 
 
 		 207 aa  55.8  0.0000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.374792  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1146  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  39.39 
 
 		 210 aa  55.8  0.0000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001299  CbbY family protein  33.71 
 
 		 216 aa  55.5  0.0000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.916657  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0446  HAD family hydrolase  34.19 
 
 		 207 aa  55.5  0.0000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.230544 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0764  HAD family hydrolase  29.65 
 
 		 203 aa  55.1  0.0000007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.523693  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5006  HAD family hydrolase  32.97 
 
 		 229 aa  54.7  0.0000008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1752  HAD family hydrolase  31.75 
 
 		 232 aa  54.7  0.0000009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5409  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  37.78 
 
 		 267 aa  54.7  0.0000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.470788 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0864  HAD family hydrolase  37.36 
 
 		 226 aa  54.7  0.0000009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4881  HAD family hydrolase  28.67 
 
 		 211 aa  54.3  0.000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5250  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  31.01 
 
 		 227 aa  54.3  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.922708  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0909  haloacid dehalogenase-like hydrolase  33.33 
 
 		 211 aa  53.9  0.000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.538395  normal  0.573349 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0420  HAD family hydrolase  33.33 
 
 		 207 aa  53.9  0.000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.802184  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05174  phosphoglycolate phosphatase  33.71 
 
 		 256 aa  54.3  0.000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>