More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_5934 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_5934  ammonium transporter  100 
 
 		 447 aa  865    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.80204  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4015  ammonium transporter  68.26 
 
 		 456 aa  549  1e-155  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0237759  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1393  ammonium transporter  66.82 
 
 		 445 aa  493  9.999999999999999e-139  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0218958  decreased coverage  0.0052659 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12934  ammonium-transport integral membrane protein amt  64.94 
 
 		 477 aa  494  9.999999999999999e-139  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  8.90633e-27  normal  0.349751 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0849  ammonium transporter  57.73 
 
 		 474 aa  473  1e-132  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5072  ammonium transporter  59.22 
 
 		 440 aa  469  1.0000000000000001e-131  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1301  ammonium transporter  60.29 
 
 		 417 aa  462  1e-129  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.500264  normal  0.607114 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3149  ammonium transporter  58.76 
 
 		 459 aa  459  9.999999999999999e-129  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000753064  hitchhiker  0.00186594 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1566  ammonium transporter  59.76 
 
 		 432 aa  459  9.999999999999999e-129  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.436096  normal  0.0257715 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1465  ammonium transporter  57.27 
 
 		 435 aa  452  1.0000000000000001e-126  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.811381  normal  0.520758 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23800  ammonium transporter  58.24 
 
 		 441 aa  454  1.0000000000000001e-126  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0789552  normal  0.338631 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4812  ammonium transporter  56.14 
 
 		 465 aa  449  1e-125  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0760347  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2907  ammonium transporter  58.85 
 
 		 442 aa  449  1e-125  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.790818  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8000  ammonium transporter  57.62 
 
 		 466 aa  446  1.0000000000000001e-124  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1162  ammonium transporter  57.88 
 
 		 438 aa  444  1e-123  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.317935  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3518  ammonium transporter  60.14 
 
 		 429 aa  444  1e-123  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0107825 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1187  ammonium transporter  57.92 
 
 		 478 aa  444  1e-123  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.569583  hitchhiker  0.00412014 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1298  ammonium transporter  57.68 
 
 		 456 aa  444  1e-123  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.270535  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5508  ammonium transporter  60.53 
 
 		 417 aa  441  9.999999999999999e-123  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.065677 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5259  ammonium transporter  60.62 
 
 		 417 aa  436  1e-121  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.553573 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4891  ammonium transporter  60.62 
 
 		 417 aa  436  1e-121  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4980  ammonium transporter  60.62 
 
 		 417 aa  436  1e-121  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2547  ammonium transporter  55.09 
 
 		 434 aa  429  1e-119  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.916988  normal  0.19301 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1936  ammonium transporter  52.56 
 
 		 446 aa  422  1e-117  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1956  ammonium transporter  52.56 
 
 		 446 aa  422  1e-117  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.77872  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2002  ammonium transporter  52.56 
 
 		 446 aa  422  1e-117  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.490754  normal  0.744364 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2178  ammonium transporter  53.47 
 
 		 450 aa  422  1e-117  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0850706  normal  0.724176 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0980  ammonium transporter  56.37 
 
 		 424 aa  419  1e-116  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0422  ammonium transporter  54.29 
 
 		 429 aa  419  1e-116  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1608  ammonium transporter  54.5 
 
 		 442 aa  420  1e-116  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.263179  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6204  ammonium transporter  52.35 
 
 		 427 aa  414  1e-114  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.442016  normal  0.0532211 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3427  ammonium transporter  60.57 
 
 		 433 aa  411  1e-113  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.0000283627  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4185  ammonium transporter  55.45 
 
 		 450 aa  405  1.0000000000000001e-112  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.306123 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0659  ammonium transporter  51.88 
 
 		 439 aa  402  1e-111  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0221  ammonium transporter  53.55 
 
 		 446 aa  397  1e-109  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0968  ammonium transporter  54.71 
 
 		 439 aa  394  1e-108  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.96365  normal  0.13962 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2492  ammonium transporter  53.13 
 
 		 450 aa  386  1e-106  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.262408  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2242  ammonium transporter  58.43 
 
 		 438 aa  384  1e-105  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0898942  normal  0.0592971 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2078  ammonium transporter  51.8 
 
 		 450 aa  380  1e-104  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.026274  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1785  ammonium transporter  55.53 
 
 		 439 aa  381  1e-104  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2232  ammonium transporter  53.13 
 
 		 451 aa  378  1e-103  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000018516 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0695  ammonium transporter  49.09 
 
 		 488 aa  374  1e-102  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.7335  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3269  ammonium transporter  52.31 
 
 		 441 aa  372  1e-102  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.075214  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0727  ammonium transporter  50.95 
 
 		 449 aa  370  1e-101  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.379173  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1508  ammonium transporter  49.32 
 
 		 515 aa  365  1e-100  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3530  ammonium transporter  51.41 
 
 		 443 aa  367  1e-100  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2708  ammonium transporter  48.86 
 
 		 515 aa  363  2e-99  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000035421 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3365  ammonium transporter  48.63 
 
 		 485 aa  363  4e-99  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0940  ammonium transporter  47.38 
 
 		 489 aa  359  5e-98  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0192  ammonium transporter  50.47 
 
 		 467 aa  358  9.999999999999999e-98  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2054  ammonium transporter  49.64 
 
 		 431 aa  357  1.9999999999999998e-97  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3244  ammonium transporter  51.33 
 
 		 457 aa  357  2.9999999999999997e-97  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2589  ammonium transporter  50.72 
 
 		 423 aa  355  5.999999999999999e-97  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000206103  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1889  ammonium transporter  51.06 
 
 		 434 aa  353  5e-96  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.39856  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1236  ammonia permease  49.88 
 
 		 431 aa  352  7e-96  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3048  ammonium transporter  48.93 
 
 		 405 aa  350  3e-95  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0471  ammonium transporter  47.96 
 
 		 496 aa  348  1e-94  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.122427  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1019  ammonium transporter  50.94 
 
 		 451 aa  346  4e-94  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.197623  normal  0.642415 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2862  ammonium transporter  46.86 
 
 		 457 aa  345  1e-93  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.33659  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1059  ammonium transporter  47.64 
 
 		 410 aa  345  1e-93  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.000000580155  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0487  ammonium transporter  48.19 
 
 		 507 aa  343  5e-93  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1269  ammonium transporter  47.41 
 
 		 411 aa  342  5.999999999999999e-93  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000000200287  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0032  ammonium transporter  48.93 
 
 		 462 aa  342  1e-92  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1313  ammonium transporter  47.52 
 
 		 410 aa  342  1e-92  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000021179  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1059  ammonium transporter  47.17 
 
 		 410 aa  339  5.9999999999999996e-92  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  6.498340000000001e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4131  ammonium transporter  47.04 
 
 		 410 aa  339  5.9999999999999996e-92  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.00000000588768  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1210  ammonium transporter  47.17 
 
 		 410 aa  339  7e-92  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000809734  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1056  ammonium transporter  46.93 
 
 		 410 aa  338  9.999999999999999e-92  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.000000003226  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1078  ammonium transporter  46.93 
 
 		 410 aa  338  1.9999999999999998e-91  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000106824  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2710  ammonium transporter  46.72 
 
 		 402 aa  337  2.9999999999999997e-91  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0743865  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1237  ammonium transporter  46.7 
 
 		 410 aa  336  5e-91  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_943  ammonium transporter  48.81 
 
 		 408 aa  335  7e-91  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1125  ammonium transporter  48.81 
 
 		 408 aa  334  2e-90  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0335009  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0142  ammonium transporter  50.6 
 
 		 464 aa  332  7.000000000000001e-90  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000211671  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0954  ammonium transporter  48.33 
 
 		 408 aa  332  7.000000000000001e-90  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0565  ammonium transporter  48.34 
 
 		 428 aa  332  1e-89  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.000000907445  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2267  ammonium transporter  46.21 
 
 		 405 aa  331  2e-89  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.828522  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1061  ammonium transporter  47.07 
 
 		 461 aa  329  8e-89  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.379928  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1831  ammonium transporter  49.16 
 
 		 402 aa  323  3e-87  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0343  ammonium transporter  45.8 
 
 		 436 aa  323  3e-87  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0598  ammonium transporter  45.7 
 
 		 463 aa  323  3e-87  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00419594 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0046  ammonium transporter  47.39 
 
 		 429 aa  321  9.999999999999999e-87  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  unclonable  0.0000000000000652471  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1686  ammonium transporter  45.93 
 
 		 402 aa  322  9.999999999999999e-87  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.531823  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1956  ammonium transporter  45.1 
 
 		 494 aa  321  1.9999999999999998e-86  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2311  ammonium transporter  49.28 
 
 		 401 aa  321  1.9999999999999998e-86  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.191525  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4808  ammonium transporter  43.51 
 
 		 456 aa  321  1.9999999999999998e-86  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2342  ammonium transporter  48.86 
 
 		 455 aa  320  3e-86  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.602093 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0086  ammonium transporter  45.56 
 
 		 444 aa  319  6e-86  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0959  ammonium transporter  47.73 
 
 		 433 aa  317  2e-85  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0566  ammonium transporter  44.21 
 
 		 427 aa  318  2e-85  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0404362  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2786  ammonium transporter  44.58 
 
 		 398 aa  316  5e-85  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.879755  normal  0.191146 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1999  ammonium transporter  47.63 
 
 		 444 aa  315  9.999999999999999e-85  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.92579  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0218  ammonium transporter  45.68 
 
 		 524 aa  314  1.9999999999999998e-84  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000738069 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2468  ammonium transporter  47.03 
 
 		 470 aa  314  1.9999999999999998e-84  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.47689  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0199  ammonium transporter  45.68 
 
 		 515 aa  314  1.9999999999999998e-84  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.356507 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1490  ammonium transporter  45.14 
 
 		 472 aa  314  1.9999999999999998e-84  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2672  ammonium transporter  47.42 
 
 		 443 aa  314  1.9999999999999998e-84  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.0000545054  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2911  ammonium transporter  46.08 
 
 		 438 aa  313  3.9999999999999997e-84  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2526  ammonium transporter  46.08 
 
 		 438 aa  313  3.9999999999999997e-84  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0866  ammonium transporter  47.97 
 
 		 402 aa  313  4.999999999999999e-84  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.366572 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>