More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_4009 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_4009  oxidoreductase domain protein  100 
 
 		 381 aa  773    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1086  oxidoreductase domain protein  77.13 
 
 		 382 aa  574  1.0000000000000001e-162  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0288482  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6724  oxidoreductase protein  73.09 
 
 		 380 aa  568  1e-161  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.544878  normal  0.826358 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1721  putative oxidoreductase  66.4 
 
 		 384 aa  545  1e-154  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.777157  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1077  oxidoreductase domain-containing protein  67.28 
 
 		 384 aa  536  1e-151  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2017  oxidoreductase domain protein  67.72 
 
 		 384 aa  526  1e-148  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.183817  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2179  oxidoreductase domain protein  62.92 
 
 		 389 aa  523  1e-147  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000944475 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29090  predicted dehydrogenase  64.58 
 
 		 387 aa  518  1e-146  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.252853  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0140  oxidoreductase domain protein  63.78 
 
 		 386 aa  520  1e-146  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2425  oxidoreductase domain-containing protein  62.14 
 
 		 389 aa  518  1e-146  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0607832  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3365  oxidoreductase domain protein  63.38 
 
 		 387 aa  515  1.0000000000000001e-145  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.23221  normal  0.0569216 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0896  oxidoreductase domain protein  65.62 
 
 		 388 aa  498  1e-140  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.106889  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06530  predicted dehydrogenase  63.35 
 
 		 387 aa  498  1e-140  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0363846  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2457  oxidoreductase domain-containing protein  61.15 
 
 		 383 aa  494  9.999999999999999e-139  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.79412  normal  0.791445 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4013  oxidoreductase domain protein  60.21 
 
 		 382 aa  488  1e-137  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3331  oxidoreductase domain-containing protein  61.27 
 
 		 382 aa  490  1e-137  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.782601 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4342  oxidoreductase domain protein  60.21 
 
 		 382 aa  488  1e-137  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0507395  decreased coverage  0.00000099897 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2855  oxidoreductase domain-containing protein  60.63 
 
 		 383 aa  487  1e-136  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4759  oxidoreductase domain protein  58.53 
 
 		 381 aa  481  1e-135  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.86109  normal  0.0244054 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1858  oxidoreductase domain protein  56.88 
 
 		 387 aa  439  9.999999999999999e-123  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.637102  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0616  oxidoreductase domain-containing protein  57.14 
 
 		 387 aa  441  9.999999999999999e-123  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2881  oxidoreductase domain-containing protein  55.91 
 
 		 381 aa  422  1e-117  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1105  oxidoreductase domain protein  53.4 
 
 		 385 aa  424  1e-117  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0546  oxidoreductase domain protein  27.6 
 
 		 327 aa  89  1e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.881948  normal  0.774462 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1725  oxidoreductase-like protein  31.33 
 
 		 387 aa  87  4e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0156  oxidoreductase domain protein  24.78 
 
 		 396 aa  86.7  6e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2400  oxidoreductase domain protein  29.18 
 
 		 378 aa  86.7  7e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1497  oxidoreductase domain-containing protein  26.19 
 
 		 376 aa  85.1  0.000000000000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.000000119616  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4042  oxidoreductase domain-containing protein  29.92 
 
 		 366 aa  83.6  0.000000000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.322448 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4379  oxidoreductase domain protein  29.2 
 
 		 369 aa  82.4  0.00000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.441684  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4094  oxidoreductase domain protein  30.65 
 
 		 378 aa  82  0.00000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3564  oxidoreductase domain-containing protein  27.73 
 
 		 376 aa  80.5  0.00000000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0520703 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2258  oxidoreductase domain protein  29.25 
 
 		 371 aa  79.3  0.0000000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0680457  normal  0.675266 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2722  oxidoreductase, Gfo/Idh/MocA family  30.56 
 
 		 382 aa  78.6  0.0000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.327917  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4032  oxidoreductase domain protein  23.82 
 
 		 385 aa  78.2  0.0000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0540753 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2455  oxidoreductase, N-terminal:oxidoreductase, C-terminal  30.9 
 
 		 382 aa  77.8  0.0000000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.834174  hitchhiker  0.00910269 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4458  oxidoreductase domain protein  26.13 
 
 		 386 aa  77.4  0.0000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0583  oxidoreductase domain-containing protein  28.03 
 
 		 396 aa  77.4  0.0000000000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0178455  normal  0.601726 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1830  oxidoreductase domain-containing protein  25.31 
 
 		 376 aa  77  0.0000000000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0800695  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1013  oxidoreductase domain-containing protein  27.13 
 
 		 337 aa  76.3  0.0000000000008  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1757  oxidoreductase domain protein  26.58 
 
 		 324 aa  76.3  0.0000000000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.564718  normal  0.948479 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2408  oxidoreductase domain protein  27.62 
 
 		 380 aa  75.5  0.000000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1729  oxidoreductase-like protein  27.76 
 
 		 396 aa  74.7  0.000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0833766  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50290  oxidoreductase  29.58 
 
 		 369 aa  74.7  0.000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.569794  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3459  oxidoreductase domain-containing protein  29.17 
 
 		 388 aa  75.1  0.000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1088  oxidoreductase domain protein  25.86 
 
 		 382 aa  74.7  0.000000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3940  oxidoreductase-like  27.85 
 
 		 330 aa  74.7  0.000000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.554966 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2755  oxidoreductase domain-containing protein  27.47 
 
 		 399 aa  73.9  0.000000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.943546  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0199  oxidoreductase domain-containing protein  24.38 
 
 		 374 aa  73.9  0.000000000004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1156  oxidoreductase domain protein  24.4 
 
 		 396 aa  74.3  0.000000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.741439 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1312  oxidoreductase domain-containing protein  27.14 
 
 		 331 aa  73.2  0.000000000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0706  putative oxidoreductase  26.44 
 
 		 331 aa  72.8  0.000000000008  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00559097  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3328  oxidoreductase domain-containing protein  25.29 
 
 		 359 aa  72.8  0.000000000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.686493  normal  0.496755 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2138  oxidoreductase domain protein  29.64 
 
 		 352 aa  72.8  0.000000000009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0137  oxidoreductase domain protein  27.31 
 
 		 377 aa  72.4  0.00000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1619  oxidoreductase domain protein  24.78 
 
 		 377 aa  71.6  0.00000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.699315 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1908  oxidoreductase domain protein  29.24 
 
 		 347 aa  71.6  0.00000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01200  predicted dehydrogenase  26.79 
 
 		 337 aa  71.6  0.00000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0681  oxidoreductase domain-containing protein  24.86 
 
 		 329 aa  72  0.00000000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.109969 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4918  oxidoreductase domain-containing protein  25.57 
 
 		 330 aa  71.6  0.00000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.482901 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0976  oxidoreductase domain protein  27.39 
 
 		 379 aa  71.6  0.00000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.239021  normal  0.0340208 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1461  oxidoreductase-like  27.8 
 
 		 386 aa  70.9  0.00000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.885347  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0988  oxidoreductase domain-containing protein  23.37 
 
 		 390 aa  70.9  0.00000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2234  oxidoreductase domain protein  28.51 
 
 		 354 aa  70.9  0.00000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1241  oxidoreductase domain protein  27.81 
 
 		 375 aa  70.5  0.00000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.101149 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3167  oxidoreductase domain protein  25.3 
 
 		 386 aa  70.5  0.00000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5584  oxidoreductase  23.5 
 
 		 356 aa  70.1  0.00000000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0916209  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4438  oxidoreductase domain protein  23.89 
 
 		 401 aa  70.1  0.00000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4484  oxidoreductase-like  25.67 
 
 		 343 aa  69.7  0.00000000007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.418021  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2153  oxidoreductase domain protein  25.51 
 
 		 387 aa  69.7  0.00000000007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.491696  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1343  oxidoreductase, putative  24.69 
 
 		 371 aa  68.9  0.0000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0599  oxidoreductase domain protein  30.05 
 
 		 381 aa  68.9  0.0000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2299  oxidoreductase domain protein  29.63 
 
 		 378 aa  69.3  0.0000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000000176131  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1303  putative oxidoreductase  24.69 
 
 		 371 aa  69.3  0.0000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2973  oxidoreductase domain protein  29.54 
 
 		 366 aa  68.9  0.0000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_09791  putative oxidoreductase  25.59 
 
 		 373 aa  68.6  0.0000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.678537  normal  0.0468377 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1572  oxidoreductase domain protein  23.38 
 
 		 368 aa  68.6  0.0000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0411  oxidoreductase-like  29.38 
 
 		 328 aa  67.4  0.0000000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3257  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  30.77 
 
 		 350 aa  67.8  0.0000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0040  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  26.32 
 
 		 346 aa  67.8  0.0000000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2134  oxidoreductase domain protein  27.4 
 
 		 385 aa  67.4  0.0000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4405  oxidoreductase domain-containing protein  30.53 
 
 		 369 aa  66.6  0.0000000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0571768  normal  0.145119 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003594  predicted dehydrogenase  29.87 
 
 		 346 aa  67  0.0000000006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1860  oxidoreductase domain-containing protein  31.67 
 
 		 336 aa  67  0.0000000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.123428  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1858  putative oxidoreductase  29.79 
 
 		 360 aa  66.6  0.0000000007  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.371104  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15590  predicted dehydrogenase  28.62 
 
 		 379 aa  66.6  0.0000000007  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.729265  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0887  oxidoreductase domain-containing protein  24.06 
 
 		 379 aa  66.2  0.0000000009  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.523237 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5216  oxidoreductase domain protein  23.96 
 
 		 382 aa  65.9  0.000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.647839  normal  0.501993 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2513  oxidoreductase domain-containing protein  26.18 
 
 		 399 aa  66.2  0.000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.591176 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1722  oxidoreductase domain-containing protein  29.57 
 
 		 377 aa  65.5  0.000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.996636  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0615  oxidoreductase domain-containing protein  29.19 
 
 		 379 aa  65.1  0.000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.537783  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_17291  putative oxidoreductase  28.29 
 
 		 369 aa  65.1  0.000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2197  oxidoreductase domain protein  26.13 
 
 		 363 aa  64.7  0.000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0117  oxidoreductase domain protein  26.28 
 
 		 398 aa  64.7  0.000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01950  predicted dehydrogenase  25.62 
 
 		 335 aa  64.7  0.000000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4490  oxidoreductase-like  27.81 
 
 		 345 aa  64.3  0.000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.724338  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3499  oxidoreductase domain-containing protein  30.16 
 
 		 366 aa  64.3  0.000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.66689  decreased coverage  0.000063824 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3569  oxidoreductase domain-containing protein  23.28 
 
 		 345 aa  64.3  0.000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1970  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  27 
 
 		 333 aa  64.7  0.000000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.410037  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4044  oxidoreductase domain protein  32.68 
 
 		 338 aa  63.9  0.000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.568923  normal  0.775986 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>