More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_3080 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_3080  beta-lactamase  100 
 
 		 440 aa  876    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2259  beta-lactamase  40.52 
 
 		 416 aa  257  4e-67  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.296569  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0151  beta-lactamase  36.53 
 
 		 394 aa  224  2e-57  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.288429 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6092  beta-lactamase  39.34 
 
 		 419 aa  215  9.999999999999999e-55  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.152854 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4043  beta-lactamase  32.15 
 
 		 361 aa  127  5e-28  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2573  beta-lactamase  29.89 
 
 		 476 aa  115  2.0000000000000002e-24  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.369136  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0439  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  28.43 
 
 		 392 aa  108  2e-22  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.919528 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0831  beta-lactamase  26.92 
 
 		 422 aa  105  1e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.146809  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0505  putative penicillin-binding protein  27.93 
 
 		 415 aa  105  2e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0859162  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2721  penicillin-binding protein  23.7 
 
 		 340 aa  103  6e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0897232  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37770  penicillin-binding protein, beta-lactamase class C  29.38 
 
 		 366 aa  103  6e-21  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.269534  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2668  penicillin-binding protein  25.07 
 
 		 348 aa  103  7e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00162016 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2433  penicillin-binding protein  25.07 
 
 		 340 aa  103  8e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0197006  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2394  penicillin-binding protein  25.07 
 
 		 340 aa  102  1e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.70958  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2469  penicillin-binding protein  24.78 
 
 		 340 aa  101  2e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.242822  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2650  penicillin-binding protein  24.78 
 
 		 340 aa  101  2e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2632  penicillin-binding protein  23.98 
 
 		 341 aa  100  5e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.149759  decreased coverage  0.000000240236 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4818  putative penicillin-binding protein  27.24 
 
 		 416 aa  100  7e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.618322  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0419  beta-lactamase  26.9 
 
 		 416 aa  99.8  9e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0483  putative penicillin-binding protein  27.3 
 
 		 412 aa  99.8  9e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0473  penicillin-binding protein  27.3 
 
 		 421 aa  99.4  1e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0416  beta-lactamase (penicillin-binding protein) (penicillinase)  27.3 
 
 		 421 aa  99.4  1e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0430511  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0502  penicillin-binding protein  27.3 
 
 		 412 aa  99.4  1e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0558  putative penicillin-binding protein  27.65 
 
 		 413 aa  99  2e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.622752  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0412  beta-lactamase (penicillin-binding protein) (penicillinase)  27.3 
 
 		 422 aa  96.7  8e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0555  penicillin-binding protein, putative  27.3 
 
 		 413 aa  96.3  9e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.389605  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2679  penicillin-binding protein  22.9 
 
 		 341 aa  96.3  1e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1906  beta-lactamase  23.75 
 
 		 369 aa  94.7  3e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0428  beta-lactamase  26.23 
 
 		 404 aa  94  5e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.354595  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0500  beta-lactamase  23.82 
 
 		 487 aa  94  5e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0544  beta-lactamase  25 
 
 		 578 aa  90.5  5e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.129057 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3518  putative penicillin-binding protein  25.36 
 
 		 377 aa  90.1  6e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3507  penicillin-binding protein, putative  25.36 
 
 		 375 aa  89  1e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3208  beta-lactamase  24.71 
 
 		 377 aa  85.9  0.000000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0230735  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3294  penicillin-binding protein  24.71 
 
 		 377 aa  85.5  0.000000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.678008  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1086  beta-lactamase  27.05 
 
 		 378 aa  85.5  0.000000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3511  putative penicillin-binding protein  24.71 
 
 		 377 aa  85.5  0.000000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3554  penicillin-binding protein  24.71 
 
 		 377 aa  85.5  0.000000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3872  beta-lactamase  27.98 
 
 		 375 aa  84.7  0.000000000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2208  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  26.27 
 
 		 442 aa  84.7  0.000000000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.474098  normal  0.561482 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4110  beta-lactamase  27.6 
 
 		 379 aa  84  0.000000000000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3264  beta-lactamase  24.12 
 
 		 377 aa  83.6  0.000000000000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.664291  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4174  beta-lactamase  27.6 
 
 		 378 aa  83.6  0.000000000000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000652338  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4152  beta-lactamase  26.56 
 
 		 378 aa  83.6  0.000000000000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0848463  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2638  beta-lactamase  26.06 
 
 		 445 aa  83.2  0.000000000000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.034507  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2294  penicillin-binding protein, putative  22.85 
 
 		 434 aa  82.8  0.00000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.272122  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0863  beta-lactamase  29.1 
 
 		 363 aa  81.3  0.00000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5150  beta-lactamase  28.07 
 
 		 369 aa  80.9  0.00000000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.175198  normal  0.654906 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl216  putative beta-lactamase  24.63 
 
 		 372 aa  80.9  0.00000000000005  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3498  beta-lactamase  23.19 
 
 		 375 aa  80.1  0.00000000000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2793  beta-lactamase  29.38 
 
 		 510 aa  79  0.0000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.879811  normal  0.340954 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3210  beta-lactamase  23.82 
 
 		 375 aa  79.7  0.0000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.767379  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3032  beta-lactamase  34.2 
 
 		 507 aa  78.2  0.0000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.436003 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4280  beta-lactamase  33.52 
 
 		 330 aa  78.2  0.0000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.161716 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1979  beta-lactamase  30.41 
 
 		 398 aa  77.8  0.0000000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.663801  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2589  beta-lactamase  30.41 
 
 		 398 aa  77.8  0.0000000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.224311  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1777  beta-lactamase  23.89 
 
 		 343 aa  77.4  0.0000000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00484911  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0159  beta-lactamase  26.37 
 
 		 410 aa  77.4  0.0000000000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2613  beta-lactamase  30.07 
 
 		 398 aa  77.4  0.0000000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01828  beta-lactamase precursor  28.27 
 
 		 366 aa  77  0.0000000000006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.284204  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3615  beta-lactamase  30.51 
 
 		 611 aa  77  0.0000000000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0663146 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4636  beta-lactamase  25.74 
 
 		 496 aa  77  0.0000000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01195  penicillin-binding protein  22.67 
 
 		 559 aa  77  0.0000000000006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.119719  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1750  beta-lactamase  22.9 
 
 		 375 aa  76.3  0.000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.339251  normal  0.99151 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3731  beta-lactamase  29.38 
 
 		 603 aa  76.3  0.000000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.227339 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2742  beta-lactamase  23.78 
 
 		 376 aa  75.5  0.000000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0750006  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3422  beta-lactamase  28.25 
 
 		 593 aa  74.7  0.000000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.126074  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2152  beta-lactamase  27.3 
 
 		 409 aa  73.6  0.000000000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.129133 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3512  beta-lactamase  27.75 
 
 		 364 aa  73.6  0.000000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2298  beta-lactamase  26.05 
 
 		 440 aa  73.2  0.000000000009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.322057  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5491  beta-lactamase  28.9 
 
 		 407 aa  72.4  0.00000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.442272  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4213  beta-lactamase  26.22 
 
 		 403 aa  72.4  0.00000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.161495  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6777  beta-lactamase  20.8 
 
 		 446 aa  71.6  0.00000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1551  beta-lactamase  33.51 
 
 		 333 aa  72  0.00000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.345066  normal  0.407276 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2080  beta-lactamase  30.39 
 
 		 370 aa  72.4  0.00000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.16247  normal  0.44675 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0814  beta-lactamase  27.7 
 
 		 422 aa  71.2  0.00000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3511  beta-lactamase  30.14 
 
 		 364 aa  71.2  0.00000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.700919  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1712  beta-lactamase  24.37 
 
 		 477 aa  71.2  0.00000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.419371  normal  0.191124 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0624  beta-lactamase  32.57 
 
 		 370 aa  70.5  0.00000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.540607  normal  0.110236 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1527  beta-lactamase  25.94 
 
 		 370 aa  70.5  0.00000000006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.129016  normal  0.599812 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1896  beta-lactamase  26.57 
 
 		 425 aa  70.1  0.00000000007  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.227365  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1832  beta-lactamase  25.4 
 
 		 446 aa  70.1  0.00000000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.29245  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2637  beta-lactamase  29.49 
 
 		 398 aa  69.7  0.0000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3751  beta-lactamase  23.91 
 
 		 395 aa  69.3  0.0000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000498352 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3702  beta-lactamase  24.51 
 
 		 430 aa  68.6  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0294  Beta-lactamase class C and other penicillin binding proteins-like protein  24.28 
 
 		 834 aa  68.9  0.0000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00108534  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4262  beta-lactamase  33.9 
 
 		 695 aa  68.2  0.0000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5338  beta-lactamase  36.62 
 
 		 525 aa  68.2  0.0000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.271651  normal  0.211898 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5243  beta-lactamase  25.57 
 
 		 362 aa  68.2  0.0000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2736  beta-lactamase  24.02 
 
 		 417 aa  67.8  0.0000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.416885  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0866  beta-lactamase  22.3 
 
 		 382 aa  67.8  0.0000000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4612  beta-lactamase  31.74 
 
 		 677 aa  67.4  0.0000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5920  Beta-lactamase  29.82 
 
 		 398 aa  67  0.0000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0708  beta-lactamase  29.43 
 
 		 396 aa  67  0.0000000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0410275  normal  0.41428 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2177  beta-lactamase  26.26 
 
 		 543 aa  67  0.0000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.816506 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0939  beta-lactamase  30.59 
 
 		 338 aa  67.4  0.0000000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.18746 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3688  beta-lactamase  26.26 
 
 		 543 aa  67  0.0000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.497517  normal  0.011807 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2881  beta-lactamase  25.89 
 
 		 338 aa  66.6  0.0000000009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.74645  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1762  beta-lactamase  24.24 
 
 		 431 aa  66.2  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.178293  normal  0.700473 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1713  beta-lactamase  27.94 
 
 		 347 aa  66.2  0.000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>