More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_1521 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_1521  TrkA-N domain protein  100 
 
 		 220 aa  441  1e-123  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.709024  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3756  TrkA-N domain protein  64.09 
 
 		 236 aa  287  8e-77  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000258956  normal  0.472401 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2473  TrkA domain-containing protein  63.47 
 
 		 223 aa  282  3.0000000000000004e-75  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.214066  normal  0.684987 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2197  TrkA-N  64.95 
 
 		 217 aa  280  1e-74  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2243  TrkA domain-containing protein  64.95 
 
 		 217 aa  280  1e-74  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.20721  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2186  TrkA domain-containing protein  64.95 
 
 		 217 aa  280  1e-74  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0106506 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12706  trk system potassium uptake protein ceoB  62.1 
 
 		 227 aa  277  1e-73  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3927  TrkA domain-containing protein  63.47 
 
 		 234 aa  273  1.0000000000000001e-72  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0233751  normal  0.499781 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1398  TrkA domain-containing protein  62.69 
 
 		 224 aa  262  2e-69  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.870164  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2257  TrkA-N domain protein  60.37 
 
 		 220 aa  259  3e-68  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.222998  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1451  TrkA domain-containing protein  59.55 
 
 		 221 aa  257  1e-67  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0437642  hitchhiker  0.00701703 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2285  TrkA-N domain-containing protein  59.36 
 
 		 221 aa  256  2e-67  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.311674 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4527  TrkA-N domain-containing protein  57.73 
 
 		 221 aa  253  2.0000000000000002e-66  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.680556  normal  0.621759 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1642  TrkA-N domain protein  59.45 
 
 		 219 aa  251  5.000000000000001e-66  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.623208  normal  0.0908337 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1877  TrkA-N domain protein  56.36 
 
 		 222 aa  250  1e-65  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.608746  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1486  TrkA domain-containing protein  58.18 
 
 		 221 aa  250  1e-65  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.370955  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6759  K+ transport systems NAD-binding component-like protein  56.36 
 
 		 221 aa  248  4e-65  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0519804 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2903  TrkA domain-containing protein  55.25 
 
 		 220 aa  243  9.999999999999999e-64  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1323  TrkA-like  57.34 
 
 		 264 aa  242  3.9999999999999997e-63  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.486625 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1562  TrkA-N domain protein  56.88 
 
 		 221 aa  241  7.999999999999999e-63  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.308966  normal  0.515995 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1917  TrkA-N domain protein  55.61 
 
 		 217 aa  233  1.0000000000000001e-60  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.678679  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1942  TrkA-N domain protein  56.13 
 
 		 216 aa  234  1.0000000000000001e-60  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0161521 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1405  TrkA-N domain protein  51.87 
 
 		 218 aa  232  3e-60  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.364271  normal  0.729476 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1713  TrkA-N domain protein  58.72 
 
 		 222 aa  230  1e-59  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16170  K+ transport system, NAD-binding component  49.54 
 
 		 221 aa  229  3e-59  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.11506 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1641  TrkA domain-containing protein  52.07 
 
 		 223 aa  218  5e-56  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0270311  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5191  TrkA domain-containing protein  56.62 
 
 		 243 aa  216  2e-55  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0357985  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1634  TrkA-N domain protein  52.51 
 
 		 224 aa  215  2.9999999999999998e-55  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000521907 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1708  TrkA-N domain protein  54.12 
 
 		 216 aa  214  5.9999999999999996e-55  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0311888  normal  0.0547174 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2874  TrkA-N domain protein  55.12 
 
 		 242 aa  204  6e-52  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.493191  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1928  putative potassium transporter  54.29 
 
 		 224 aa  199  3.9999999999999996e-50  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.292607  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_13070  K+ transport system, NAD-binding component  50.51 
 
 		 233 aa  190  2e-47  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  decreased coverage  0.00265603  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3072  TrkA domain-containing protein  44.33 
 
 		 214 aa  166  2.9999999999999998e-40  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2406  TrkA domain-containing protein  44.33 
 
 		 214 aa  165  4e-40  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.716891  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1923  TrkA-N domain protein  49.26 
 
 		 220 aa  154  1e-36  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2660  TrkA domain-containing protein  39.61 
 
 		 214 aa  147  1.0000000000000001e-34  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0646767  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3063  TrkA domain-containing protein  39.13 
 
 		 214 aa  146  3e-34  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00347584 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0243  TrkA-N domain protein  34.5 
 
 		 206 aa  132  5e-30  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0807  TrkA-N domain protein  50 
 
 		 137 aa  120  9.999999999999999e-27  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0637  TrkA-N  33.5 
 
 		 219 aa  117  9.999999999999999e-26  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.0432302 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0026  TrkA domain-containing protein  49.57 
 
 		 134 aa  117  9.999999999999999e-26  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0027  potassium uptake protein, putative  49.57 
 
 		 134 aa  116  1.9999999999999998e-25  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.248151  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_26  cation transport protein, Trk system  49.57 
 
 		 134 aa  117  1.9999999999999998e-25  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0437885  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00280  K+ transport system, NAD-binding component  34.65 
 
 		 219 aa  111  9e-24  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2083  TrkA-N domain protein  30 
 
 		 210 aa  102  3e-21  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.111398  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0250  TrkA-N domain protein  41.48 
 
 		 219 aa  101  7e-21  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1347  TrkA-N  39.37 
 
 		 134 aa  97.1  2e-19  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0274494  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01270  K+ transport system, NAD-binding component  39.84 
 
 		 219 aa  93.6  2e-18  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0253  TrkA-N domain protein  33.33 
 
 		 138 aa  93.6  2e-18  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.186298 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2911  TrkA-N domain protein  38.93 
 
 		 142 aa  88.6  6e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0359474  normal  0.209528 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1262  TrkA domain-containing protein  29.91 
 
 		 141 aa  86.3  3e-16  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1656  TrkA domain-containing protein  38.79 
 
 		 143 aa  85.1  7e-16  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000153236  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1729  TrkA domain-containing protein  37.93 
 
 		 143 aa  84  0.000000000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000411585  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0026  potassium uptake protein, putative  28.57 
 
 		 221 aa  82.8  0.000000000000004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.311155  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0025  TrkA domain-containing protein  28.57 
 
 		 221 aa  82  0.000000000000007  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2082  TrkA-N domain protein  27.05 
 
 		 218 aa  81.6  0.000000000000008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.124657  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0806  TrkA-N domain protein  25.49 
 
 		 218 aa  80.5  0.00000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04100  K+ transport system, NAD-binding component  36.84 
 
 		 152 aa  79.3  0.00000000000004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.453544  normal  0.632996 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_25  cation transport protein, Trk system  27.23 
 
 		 221 aa  78.2  0.00000000000009  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00178783  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0016  potassium transporter peripheral membrane component  29.03 
 
 		 457 aa  77.8  0.0000000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2912  TrkA-N domain protein  27.83 
 
 		 223 aa  77  0.0000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.031815  normal  0.106659 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0040  potassium transporter peripheral membrane component  27.35 
 
 		 469 aa  77  0.0000000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.165147 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0378  TrkA-N domain protein  31.03 
 
 		 626 aa  76.3  0.0000000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0032  potassium transporter peripheral membrane component  28.21 
 
 		 469 aa  75.1  0.0000000000007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0670474 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00019  potassium transporter peripheral membrane component  28.7 
 
 		 459 aa  74.7  0.0000000000009  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0180  Trk system potassium uptake protein TrkA  28.77 
 
 		 457 aa  74.7  0.000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1348  hypothetical protein  34.21 
 
 		 220 aa  74.3  0.000000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0533287  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0028  potassium transporter peripheral membrane component  27.35 
 
 		 469 aa  74.3  0.000000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0017  potassium transporter peripheral membrane component  29.3 
 
 		 458 aa  73.9  0.000000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3261  potassium transporter peripheral membrane component  32.05 
 
 		 484 aa  73.9  0.000000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.386779  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1318  TrkA-N domain protein  29.27 
 
 		 628 aa  73.6  0.000000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0014  TrkA domain-containing protein  27.03 
 
 		 457 aa  73.6  0.000000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0240987 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0021  potassium transporter peripheral membrane component  26.92 
 
 		 469 aa  73.9  0.000000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3912  potassium transporter peripheral membrane component  32.05 
 
 		 484 aa  73.9  0.000000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3183  potassium transporter peripheral membrane component  24.35 
 
 		 465 aa  73.6  0.000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00657284  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0026  potassium transporter peripheral membrane component  28.21 
 
 		 469 aa  73.2  0.000000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.570638  hitchhiker  0.00237688 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0024  potassium transporter peripheral membrane component  28.21 
 
 		 469 aa  73.2  0.000000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.738729  normal  0.0894147 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0032  potassium transporter peripheral membrane component  28.21 
 
 		 469 aa  73.2  0.000000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.21174  hitchhiker  0.00000689203 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0029  potassium transporter peripheral membrane component  28.21 
 
 		 469 aa  72.8  0.000000000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0021  potassium transporter peripheral membrane component  26.07 
 
 		 469 aa  72.4  0.000000000005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0035  potassium transporter peripheral membrane component  26.5 
 
 		 469 aa  72.4  0.000000000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.154438 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3071  TrkA domain-containing protein  29.19 
 
 		 220 aa  72  0.000000000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0021  potassium transporter peripheral membrane component  26.5 
 
 		 469 aa  71.6  0.000000000009  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.881079  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3739  potassium transporter peripheral membrane component  26.5 
 
 		 469 aa  71.6  0.000000000009  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00764602 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3335  sodium/hydrogen exchanger  25.96 
 
 		 620 aa  70.9  0.00000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.263671  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00394  potassium transporter peripheral membrane component  27.8 
 
 		 458 aa  71.2  0.00000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3971  potassium transporter peripheral membrane component  27.75 
 
 		 458 aa  70.9  0.00000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0755481  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00140  potassium transporter peripheral membrane component  25.88 
 
 		 457 aa  71.2  0.00000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.35944  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0242  TrkA-N domain protein  31.82 
 
 		 221 aa  71.2  0.00000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3792  potassium transporter peripheral membrane component  27.75 
 
 		 458 aa  71.2  0.00000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002054  Trk system potassium uptake protein TrkA  27.8 
 
 		 458 aa  70.9  0.00000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2476  potassium transporter peripheral membrane component  27.35 
 
 		 458 aa  70.1  0.00000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00290  K+ transport system, NAD-binding component  30.83 
 
 		 226 aa  70.5  0.00000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0014  potassium transporter peripheral membrane component  27.35 
 
 		 458 aa  70.1  0.00000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00830339  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1685  TrkA domain-containing protein  25.95 
 
 		 153 aa  69.7  0.00000000003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.124287  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0020  potassium transporter peripheral membrane component  27.8 
 
 		 459 aa  69.7  0.00000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.688304  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0081  potassium transporter peripheral membrane component  25.56 
 
 		 458 aa  69.7  0.00000000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5999  potassium transporter peripheral membrane component  36.36 
 
 		 485 aa  68.9  0.00000000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0135992 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2407  TrkA domain-containing protein  28.71 
 
 		 220 aa  68.9  0.00000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.163912  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1261  TrkA domain-containing protein  20.64 
 
 		 219 aa  68.9  0.00000000005  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>