More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ajs_3523 on replicon NC_008782
Organism: Acidovorax sp. JS42



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008782  Ajs_3523  hypothetical protein  100 
 
 		 336 aa  666    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2846  hypothetical protein  98.51 
 
 		 336 aa  655    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.716229  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3895  hypothetical protein  78.93 
 
 		 342 aa  472  1e-132  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4478  hypothetical protein  72.14 
 
 		 329 aa  451  1.0000000000000001e-126  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.23415  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1691  hypothetical protein  68.94 
 
 		 330 aa  433  1e-120  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1693  hypothetical protein  63.31 
 
 		 341 aa  387  1e-106  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2815  hypothetical protein  53.21 
 
 		 346 aa  345  6e-94  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.222499  hitchhiker  0.00000272153 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0357  hypothetical protein  56.95 
 
 		 325 aa  343  2e-93  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2127  hypothetical protein  53.25 
 
 		 336 aa  341  1e-92  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.371691  normal  0.957412 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4438  hypothetical protein  52.82 
 
 		 338 aa  293  3e-78  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4521  hypothetical protein  50.17 
 
 		 338 aa  280  2e-74  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.843645  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0256  hypothetical protein  44.18 
 
 		 327 aa  248  1e-64  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0309  twin-arginine translocation pathway signal  42.12 
 
 		 328 aa  235  6e-61  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3983  extra-cytoplasmic solute receptor  39.82 
 
 		 328 aa  214  1.9999999999999998e-54  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0104878 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4494  hypothetical protein  40.06 
 
 		 330 aa  213  3.9999999999999995e-54  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.125803 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4280  hypothetical protein  40 
 
 		 333 aa  212  7e-54  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.711918  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2117  hypothetical protein  41.06 
 
 		 327 aa  211  1e-53  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.299705  normal  0.290671 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4610  hypothetical protein  37.05 
 
 		 322 aa  209  6e-53  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0432088  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3664  hypothetical protein  41.45 
 
 		 324 aa  207  3e-52  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5061  extra-cytoplasmic solute receptor  36.69 
 
 		 335 aa  198  9e-50  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000369607  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1026  hypothetical protein  39.07 
 
 		 333 aa  197  2.0000000000000003e-49  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.346833  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1912  hypothetical protein  35.86 
 
 		 335 aa  197  2.0000000000000003e-49  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3178  hypothetical protein  36.87 
 
 		 328 aa  197  3e-49  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000137109 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4146  extra-cytoplasmic solute receptor  38.83 
 
 		 339 aa  197  3e-49  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00162583  normal  0.322023 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0143  hypothetical protein  38.74 
 
 		 330 aa  196  4.0000000000000005e-49  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.627963 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0161  hypothetical protein  38.74 
 
 		 330 aa  196  4.0000000000000005e-49  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0099  hypothetical protein  35.76 
 
 		 331 aa  196  6e-49  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.361253  normal  0.47407 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0200  hypothetical protein  40.13 
 
 		 349 aa  195  9e-49  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0116  hypothetical protein  35.76 
 
 		 331 aa  195  1e-48  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2871  hypothetical protein  39.87 
 
 		 305 aa  194  3e-48  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.276028  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3949  hypothetical protein  39.8 
 
 		 339 aa  192  5e-48  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.187886  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0719  hypothetical protein  36.81 
 
 		 326 aa  192  5e-48  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.32495 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1383  hypothetical protein  37.16 
 
 		 325 aa  192  5e-48  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.5589  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1017  hypothetical protein  38.31 
 
 		 304 aa  192  1e-47  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.221773 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3827  hypothetical protein  37.42 
 
 		 330 aa  191  1e-47  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.338181  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4526  twin-arginine translocation pathway signal  37.22 
 
 		 337 aa  191  1e-47  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4957  hypothetical protein  37.32 
 
 		 331 aa  191  2e-47  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0102082  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1121  hypothetical protein  39.86 
 
 		 325 aa  189  4e-47  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.237862  normal  0.618143 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1041  hypothetical protein  39.86 
 
 		 327 aa  189  4e-47  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2776  hypothetical protein  37.76 
 
 		 332 aa  188  9e-47  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.918758  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1691  hypothetical protein  38.74 
 
 		 331 aa  187  1e-46  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4611  hypothetical protein  36.6 
 
 		 349 aa  187  1e-46  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1635  hypothetical protein  35.78 
 
 		 333 aa  187  2e-46  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.345549  normal  0.902401 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1868  hypothetical protein  34.94 
 
 		 330 aa  187  2e-46  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5438  hypothetical protein  36.56 
 
 		 326 aa  187  3e-46  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4609  extra-cytoplasmic solute receptor  38.44 
 
 		 328 aa  187  3e-46  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.636278 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2904  hypothetical protein  38.56 
 
 		 332 aa  186  4e-46  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.339964  normal  0.0116375 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4876  extra-cytoplasmic solute receptor  37.42 
 
 		 328 aa  186  5e-46  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.748926  normal  0.754985 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5584  hypothetical protein  35.5 
 
 		 337 aa  186  5e-46  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0384253  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4389  hypothetical protein  37.58 
 
 		 321 aa  186  6e-46  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.907682 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2249  hypothetical protein  35.5 
 
 		 325 aa  185  1.0000000000000001e-45  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.570594 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0795  hypothetical protein  35.74 
 
 		 346 aa  185  1.0000000000000001e-45  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5777  hypothetical protein  36.33 
 
 		 334 aa  185  1.0000000000000001e-45  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.228941  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2562  hypothetical protein  38.25 
 
 		 330 aa  185  1.0000000000000001e-45  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5443  hypothetical protein  36.57 
 
 		 337 aa  184  1.0000000000000001e-45  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0828  hypothetical protein  35.83 
 
 		 335 aa  184  1.0000000000000001e-45  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.136447  normal  0.157407 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1625  hypothetical protein  35.5 
 
 		 325 aa  185  1.0000000000000001e-45  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.354122  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4232  extra-cytoplasmic solute receptor  36.31 
 
 		 314 aa  185  1.0000000000000001e-45  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.125597  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3985  hypothetical protein  37.42 
 
 		 349 aa  184  2.0000000000000003e-45  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.19648  normal  0.0884631 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3347  hypothetical protein  34.67 
 
 		 330 aa  184  2.0000000000000003e-45  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.261888  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2668  hypothetical protein  39.54 
 
 		 336 aa  183  4.0000000000000006e-45  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4422  hypothetical protein  34.76 
 
 		 352 aa  182  6e-45  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.386029  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3604  hypothetical protein  36.21 
 
 		 356 aa  182  6e-45  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1657  hypothetical protein  34.15 
 
 		 331 aa  182  7e-45  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.129303  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1161  hypothetical protein  38.74 
 
 		 323 aa  182  7e-45  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.334484  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0288  hypothetical protein  39.29 
 
 		 325 aa  182  8.000000000000001e-45  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.456248  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5382  extra-cytoplasmic solute receptor  37.84 
 
 		 331 aa  182  9.000000000000001e-45  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.203559  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1233  hypothetical protein  37.83 
 
 		 379 aa  182  9.000000000000001e-45  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1316  hypothetical protein  33.64 
 
 		 334 aa  181  1e-44  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.293847  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2869  hypothetical protein  36.09 
 
 		 330 aa  181  1e-44  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3331  hypothetical protein  37.05 
 
 		 336 aa  181  1e-44  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3546  hypothetical protein  36.09 
 
 		 330 aa  181  1e-44  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0909589  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4142  hypothetical protein  36.18 
 
 		 328 aa  181  1e-44  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.627286  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3830  hypothetical protein  35.97 
 
 		 330 aa  181  1e-44  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.956859  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2429  hypothetical protein  34.44 
 
 		 326 aa  181  1e-44  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0208  hypothetical protein  35.33 
 
 		 335 aa  181  1e-44  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1019  hypothetical protein  34.93 
 
 		 334 aa  181  2e-44  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.100584  normal  0.433272 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3987  hypothetical protein  37.09 
 
 		 334 aa  181  2e-44  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.700334  normal  0.0774583 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4501  extra-cytoplasmic solute receptor  34.74 
 
 		 327 aa  181  2e-44  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.034407  normal  0.0507087 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5801  hypothetical protein  33.77 
 
 		 330 aa  180  2.9999999999999997e-44  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.744071  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2198  hypothetical protein  36.47 
 
 		 331 aa  180  2.9999999999999997e-44  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.000306315  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3986  hypothetical protein  35.1 
 
 		 339 aa  180  2.9999999999999997e-44  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.323954  normal  0.0812118 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3124  hypothetical protein  35.14 
 
 		 340 aa  179  4e-44  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.65371  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6030  hypothetical protein  38.11 
 
 		 351 aa  180  4e-44  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.053883  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5547  hypothetical protein  42.35 
 
 		 325 aa  180  4e-44  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5551  extra-cytoplasmatic solute receptor  34.93 
 
 		 322 aa  180  4e-44  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4803  hypothetical protein  36.36 
 
 		 474 aa  179  4.999999999999999e-44  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.145061 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4624  hypothetical protein  37.3 
 
 		 327 aa  179  4.999999999999999e-44  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3580  hypothetical protein  35.57 
 
 		 336 aa  179  4.999999999999999e-44  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.082795  normal  0.0103715 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4279  hypothetical protein  34.44 
 
 		 356 aa  179  5.999999999999999e-44  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.877893  normal  0.56539 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4972  hypothetical protein  35.64 
 
 		 328 aa  179  5.999999999999999e-44  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.345918  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5386  hypothetical protein  36.88 
 
 		 324 aa  179  7e-44  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4304  hypothetical protein  38.01 
 
 		 331 aa  179  7e-44  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.618665  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0596  hypothetical protein  35.98 
 
 		 336 aa  179  8e-44  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.642014  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3657  hypothetical protein  34.67 
 
 		 322 aa  178  1e-43  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.111701  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0779  hypothetical protein  34.1 
 
 		 360 aa  178  1e-43  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3448  hypothetical protein  35.76 
 
 		 360 aa  178  1e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4752  twin-arginine translocation pathway signal  35.05 
 
 		 333 aa  178  1e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.417694  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6115  hypothetical protein  39.14 
 
 		 328 aa  178  1e-43  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0230  hypothetical protein  34.59 
 
 		 325 aa  177  2e-43  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.297897  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>