More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Afer_0829 on replicon NC_013124
Organism: Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013124  Afer_0829  protein of unknown function UPF0118  100 
 
 		 422 aa  777    Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0384263  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0518  protein of unknown function UPF0118  37.5 
 
 		 397 aa  154  4e-36  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.318359  normal  0.0533128 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4330  protein of unknown function UPF0118  33.77 
 
 		 358 aa  125  1e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.490644  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3895  protein of unknown function UPF0118  29.01 
 
 		 529 aa  105  2e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.374859  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6535  protein of unknown function UPF0118  30.42 
 
 		 394 aa  104  3e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.278292  normal  0.0349253 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1235  protein of unknown function UPF0118  27.68 
 
 		 354 aa  103  6e-21  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3615  hypothetical protein  31.19 
 
 		 412 aa  103  8e-21  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1194  hypothetical protein  22.58 
 
 		 396 aa  102  1e-20  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7547  protein of unknown function UPF0118  30.9 
 
 		 392 aa  102  1e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.43907  normal  0.494892 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2284  protein of unknown function UPF0118  31.89 
 
 		 406 aa  97.8  3e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00112442  hitchhiker  0.00386241 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09400  predicted permease  31.37 
 
 		 357 aa  97.4  4e-19  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.291782 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1731  protein of unknown function UPF0118  27.91 
 
 		 373 aa  97.1  6e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.90656  normal  0.570586 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2868  protein of unknown function UPF0118  29.47 
 
 		 400 aa  97.1  6e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.579917  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3575  protein of unknown function UPF0118  27.69 
 
 		 344 aa  95.5  1e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00192559  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1694  permease-like protein  32.14 
 
 		 443 aa  95.5  1e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.111642  normal  0.106944 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1485  protein of unknown function UPF0118  27.91 
 
 		 455 aa  95.1  2e-18  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.823858  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3997  hypothetical protein  30.72 
 
 		 413 aa  95.1  2e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  decreased coverage  0.00194517  hitchhiker  0.0036434 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2027  protein of unknown function UPF0118  27.5 
 
 		 354 aa  94  5e-18  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.294883  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5305  hypothetical protein  26.73 
 
 		 464 aa  93.2  7e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.111321  normal  0.674007 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8629  permease-like protein  31.89 
 
 		 423 aa  92.8  9e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2536  hypothetical protein  27.67 
 
 		 364 aa  92.8  1e-17  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0195  protein of unknown function UPF0118  30.06 
 
 		 486 aa  92  2e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1713  hypothetical protein  27.08 
 
 		 371 aa  90.9  4e-17  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.655848  normal  0.476202 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0779  Lipocalin-related protein and Bos/Can/Equ allergen  26.76 
 
 		 375 aa  89.4  1e-16  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.770407  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2596  hypothetical protein  25.38 
 
 		 371 aa  89.4  1e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1236  protein of unknown function UPF0118  29.19 
 
 		 439 aa  88.2  2e-16  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000518014 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0768  hypothetical protein  23.78 
 
 		 343 aa  88.6  2e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.011294  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2435  hypothetical protein  26.76 
 
 		 358 aa  88.6  2e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0853714  normal  0.0537169 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3083  hypothetical protein  25.16 
 
 		 373 aa  87.8  3e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.000376158  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1056  hypothetical protein  26.25 
 
 		 398 aa  88.2  3e-16  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2541  protein of unknown function UPF0118  23.46 
 
 		 392 aa  87.4  4e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.407102  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15290  predicted permease  25.44 
 
 		 415 aa  86.7  7e-16  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0742  protein of unknown function UPF0118  25.25 
 
 		 361 aa  85.9  0.000000000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0492  hypothetical protein  30.94 
 
 		 374 aa  85.9  0.000000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1347  permease  23.38 
 
 		 393 aa  86.3  0.000000000000001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0428205  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2801  hypothetical protein  32.11 
 
 		 402 aa  85.5  0.000000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.99719  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0120  protein of unknown function UPF0118  25.07 
 
 		 436 aa  85.5  0.000000000000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0224  protein of unknown function UPF0118  23.1 
 
 		 345 aa  84.3  0.000000000000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000000072412  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2201  hypothetical protein  25.73 
 
 		 365 aa  84.3  0.000000000000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  hitchhiker  0.000750597  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2065  hypothetical protein  28.8 
 
 		 370 aa  84.3  0.000000000000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.76219  normal  0.0900338 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2339  protein of unknown function UPF0118  28.8 
 
 		 370 aa  84.3  0.000000000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5162  hypothetical protein  28.78 
 
 		 382 aa  84.3  0.000000000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.235316  normal  0.0183443 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1029  hypothetical protein  22.76 
 
 		 361 aa  84  0.000000000000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.951774  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1010  hypothetical protein  22.76 
 
 		 361 aa  84  0.000000000000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.389096  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1247  protein of unknown function UPF0118  29.3 
 
 		 388 aa  84  0.000000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.842065 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1577  permease  27.62 
 
 		 379 aa  83.6  0.000000000000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1964  hypothetical protein  28.96 
 
 		 378 aa  83.2  0.000000000000007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0657  permease  24.58 
 
 		 384 aa  83.2  0.000000000000008  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.036358  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0456  protein of unknown function UPF0118  24.43 
 
 		 460 aa  83.2  0.000000000000009  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.204189  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1194  protein of unknown function UPF0118  28.53 
 
 		 359 aa  82.8  0.000000000000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.514771  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0793  hypothetical protein  27.43 
 
 		 379 aa  82.8  0.00000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.114477  normal  0.678459 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2818  hypothetical protein  25.88 
 
 		 363 aa  82.4  0.00000000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0555  hypothetical protein  25.93 
 
 		 380 aa  82.8  0.00000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.11052 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5545  protein of unknown function UPF0118  30.75 
 
 		 375 aa  82.4  0.00000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0252141  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1125  protein of unknown function UPF0118  27.98 
 
 		 359 aa  82.4  0.00000000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1351  permease  24.68 
 
 		 390 aa  82.8  0.00000000000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03191  hypothetical protein  28.21 
 
 		 356 aa  82.8  0.00000000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2806  hypothetical protein  26.87 
 
 		 372 aa  82  0.00000000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.217461  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0663  protein of unknown function UPF0118  26.84 
 
 		 373 aa  81.6  0.00000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.177633 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0960  protein of unknown function UPF0118  29.57 
 
 		 353 aa  82  0.00000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5642  protein of unknown function UPF0118  25.08 
 
 		 361 aa  81.3  0.00000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.45964  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002790  permease PerM  29.15 
 
 		 357 aa  81.3  0.00000000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0633  hypothetical protein  22.94 
 
 		 348 aa  81.3  0.00000000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0451762  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2732  hypothetical protein  26.25 
 
 		 345 aa  81.3  0.00000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.216053 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0400  hypothetical protein  27.05 
 
 		 357 aa  81.3  0.00000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1161  hypothetical protein  28.28 
 
 		 415 aa  81.3  0.00000000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3397  hypothetical protein  27.78 
 
 		 412 aa  80.9  0.00000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.947024  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2702  protein of unknown function UPF0118  25.99 
 
 		 358 aa  80.9  0.00000000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00631725  hitchhiker  0.0000000345193 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0558  hypothetical protein  27.35 
 
 		 362 aa  80.5  0.00000000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0561744  normal  0.0621069 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2291  hypothetical protein  25 
 
 		 407 aa  80.5  0.00000000000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.370535  normal  0.257699 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2392  hypothetical protein  24.77 
 
 		 349 aa  80.1  0.00000000000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.89361 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2025  protein of unknown function UPF0118  28.73 
 
 		 370 aa  80.5  0.00000000000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.653838 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4001  hypothetical protein  25.33 
 
 		 368 aa  80.1  0.00000000000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.591053 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2233  hypothetical protein  26.71 
 
 		 379 aa  80.1  0.00000000000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.195735  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2979  hypothetical protein  30.5 
 
 		 387 aa  79.7  0.00000000000008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0209  protein of unknown function UPF0118  29.25 
 
 		 399 aa  79.7  0.0000000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2087  hypothetical protein  26.89 
 
 		 353 aa  79.3  0.0000000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.257402  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08190  predicted permease  31.46 
 
 		 455 aa  79.3  0.0000000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0210651 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1196  protein of unknown function UPF0118  19.48 
 
 		 349 aa  79  0.0000000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0190  hypothetical protein  27.42 
 
 		 356 aa  79  0.0000000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2774  hypothetical protein  25.24 
 
 		 348 aa  79  0.0000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3381  membrane protein YubA  24.84 
 
 		 373 aa  78.6  0.0000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00559166  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2329  protein of unknown function UPF0118  26.46 
 
 		 436 aa  79  0.0000000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000385102 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2491  protein of unknown function UPF0118  23.91 
 
 		 353 aa  78.6  0.0000000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0602  hypothetical protein  20.92 
 
 		 361 aa  78.2  0.0000000000003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0876326  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3055  permease  24.84 
 
 		 376 aa  77.8  0.0000000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0055436  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4510  hypothetical protein  21.26 
 
 		 355 aa  78.2  0.0000000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2641  protein of unknown function UPF0118  27.01 
 
 		 408 aa  78.2  0.0000000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.517547  normal  0.208528 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3380  hypothetical protein  24.53 
 
 		 376 aa  77.4  0.0000000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.300528  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0726  hypothetical protein  21.26 
 
 		 355 aa  77.8  0.0000000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1066  hypothetical protein  27.98 
 
 		 359 aa  77.4  0.0000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.283585  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1330  protein of unknown function UPF0118  19.87 
 
 		 351 aa  77.4  0.0000000000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2437  protein of unknown function UPF0118  25.44 
 
 		 386 aa  77.8  0.0000000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.0000151216  normal  0.0209402 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4286  hypothetical protein  20.93 
 
 		 355 aa  77  0.0000000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4123  hypothetical protein  20.93 
 
 		 355 aa  77  0.0000000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4134  hypothetical protein  20.93 
 
 		 355 aa  77  0.0000000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4618  hypothetical protein  20.93 
 
 		 355 aa  77  0.0000000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.569611  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4470  hypothetical protein  20.93 
 
 		 355 aa  77  0.0000000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000112475 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3355  hypothetical protein  24.15 
 
 		 373 aa  76.6  0.0000000000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3129  hypothetical protein  24.56 
 
 		 418 aa  76.6  0.0000000000008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>